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Archive for December, 2015

2014 a positive year for the IZO-SGI Computing Service

December 17th, 2015

2014 year report

The Computing Service IZO-SGI SGIker of the UPV/EHU has published the 2014 year report, which can be found in the next link:

IZO-SGI 2014 year report (pdf in spanish)

The Computing Service has maintained or increased its main quality indicators as can be observed in the table below. Among the positive aspects,  the increase in the use of the resources and the increase of the HPC resources that where available at the end of the year. In the negative part, we can mention the reduction of the scientific publications . The Service continues having an excellent score in the satisfaction poll between the researches.

Acknowledgments

We would like to acknowledgment to all the researchers that have relied on the service, most of the good results of the Service are in fact their merits and not ours.

2014  Relevant posts in our Blog

The IZO-SGI in numbers

In the table below, the main figures of the Service in the last years is summarized and in the graph at the very bottom the use of Arina is shown.

2009 2010 2011 2012 2013 2014
Computing cores 440 872 1.520 1.520 1.400 1.3008
Consumed millions of hours 2,11 2,26 5,76 11,27 10,4 10,1
Active researches 101 98 90 89 99 107
Active groups 53 40 39 42 47 45
New accounts 49 33 33 20 34 23
Satisfaction of the researches¹ 8.9 8.8 8.8 9,3 9,3 9,6
Scientific articles² 44 58 57 74 87 75
Web visits 4.925 5.957 8.022 9.899 5.924 2.340
View pages 58.731 40.987 30.042 30.738 20.323 12.057
Posts in the HPC blog 29 34 27 47 36
Visits of the HPC blog 1.431 3.818 4.741 24.613 23.677
Arina
Computing cores 320 752 1.360 1.360 1.320 1.300
Consumed millions of hours 2,07 2,11 5,20 9,6 9,8 10,1
Mean occupation 75% 47%³ 74% 79% 83% 87%
Submitted jobs 38.497 65.179 68.991 98.383 100.214 76.912
More than 2 minutes jobs⁴ 28.377 50.624 51.735 78.846 75.406 64.335
Job mean computing time⁵ 76 hours 44 hours 101 hours 122 hours 130 hours 156 hours
Job mean waiting time⁶ 5,7 hours 3,8 hours 3,8 hours 5,2 hours 5,5 hours 10 hours
Péndulo
Computing cores 120 120 120 80 80 70
Consumed millions of hours 0,02 0,15 0,09 0,07 0,04 0,006
Ikerbasque
Computing cores 208 208 208
Consumed millions of hours 0,47 1,6 0,55

¹ Satisfaction pool by the SGIker Quality Unit.
² Where the IZO-SGI is acknowledged.
³ The use in 2010 is apparently low because new machines where installed passing form 300 cores to 752 cores in July. In August and September Arina was quite empty and the weigh of these months has had a lot of importance in the mean value. In fact in November the mean use was already in the 76%.
Jobs with less than 2 minutes of computing time are usually failed jobs. In any case due to the short duration they don’t have relevance in the usage.
The jobs with less than 2 minutes of computing time are not taken into account.
The jobs are executed through a queue system that assign proper resources to the jobs. The waiting time is the time the jobs spend in the queue waiting for the resources to be available.
The machine was switch off in April.
8 At the end of the year we got 652 new cores.

Use of Arina between 2013 December and 2014 November.

 

 

General, IZO-SGI

Balance positivo para el Servicio de Computación IZO-SGI

December 17th, 2015

Memoria 2014

El Servicio de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico) IZO-SGI SGIker ha publicado la memoria del 2014. La memoria completa puede encontrarse en el siguiente enlace:

IZO-SGI memoria del 2014 (pdf)

El 2014 el Servicio General de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico) de la UPV/EHU ha seguido su tendencia mejorando o manteniendo la mayoría de sus índice, que se resumen en la tabla inferior. Entre los aspectos negativos, la disminución de las publicaciones, y entre los positivos el incremento significativo de ocupación de la máquina sin excesivo impacto en los tiempos de espera y la ampliación que se puso operativa a finales de año. El Servicio sigue manteniendo una excelente puntuación en la encuesta de satisfacción de los investigadores.

Agradecimientos

Queremos aprovechar estas líneas para agradecer la confianza depositada en el Servicio por los investigadores dado que buena parte de los buenos números del Servicio son más mérito suyo que nuestro.

Posts relevantes del 2014 en el Blog del IZO-SGI SGIker 

El IZO-SGI en cifras

En la siguiente tabla se resumen los datos más significativos del Servicio de cálculo en los últimos años. En la figura inferior se muestra la ocupación de Arina.

2009 2010 2011 2012 2013 2014
Cores de cálculo 440 872 1.520 1.520 1.400 1.3008
Millones de horas de cálculo consumidas 2,11 2,26 5,76 11,27 10,4 10,1
Investigadores activos 101 98 90 89 99 107
Grupos activos 53 40 39 42 47 45
Cuentas nuevas 49 33 33 20 34 23
Satisfacción de los investigadores¹ 8.9 8.8 8.8 9,3 9,3 9,6
Artículos científicos² 44 58 57 74 87 75
Visitas web 4.925 5.957 8.022 9.899 5.924 2.340
Páginas vistas 58.731 40.987 30.042 30.738 20.323 12.057
Posts en el blog HPC 29 34 27 47 36
Visitas del blog HPC 1.431 3.818 4.741 24.613 23.677
Arina
Cores de cálculo 320 752 1.360 1.360 1.320 1.300
Millones de horas de cálculo consumidas 2,07 2,11 5,20 9,6 9,8 10.1
Promedio de ocupación 75% 47%³ 74% 79% 83% 87%
Trabajos enviados 38.497 65.179 68.991 98.383 100.214 76.912
Trabajos de más de 2 minutos⁴ 28.377 50.624 51.735 78.846 75.406 64.335
Tiempo promedio por trabajo⁵ 76 horas 44 horas 101 horas 122 horas 130 horas 156 horas
Tiempo medio de espera⁶ 5,7 horas 3,8 horas 3,8 horas 5,2 horas 5,5 horas 10 horas
Péndulo
Cores de cálculo 120 120 120 80 80 70
Millones de horas de cálculo consumidas 0,02 0,15 0,09 0,07 0,04 0,006
Recursos Ikerbasque
Cores de cálculo 208 208 208
Millones de horas de cálculo consumidas 0,47 1,6 0,55

¹ Encuesta de satisfacción de los usuarios del Servicio realizada por la Unidad de Calidad de SGIker. ² En los que se agradece al IZO-SGI. ³ El uso de 2010 es aparentemente bajo debido a que se instaló una ampliación de Arina que pasó de 300 cores a 752 y se hizo disponible a finales de Julio. Esto provocó que en Agosto y Septiembre Arina estuviese muy vacía y, debido a la magnitud de la ampliación, estos meses han tenido mucho peso en la media anual. En el mes de Noviembre ya se alcanzó un 76% de ocupación. Los trabajos de menos de 2 minutos se deben normalmente a trabajos fallidos que terminan inmediatamente en error. En cualquier caso, aun de no ser así, dada su corta duración no repercuten en el cluster. No se han tenido en cuenta los trabajos de menos de dos minutos. Los trabajos se ejecutan a través de un sistema de colas que asigna a cada trabajo los recursos que se le han solicitado y ordena su ejecución para optimizar el uso del cluster. El tiempo en cola es el tiempo que están esperando los trabajos hasta que se liberan los recursos que necesitan. La máquina se apagó en Abril.8A finales de 2014 con la ampliación se llegó a los 1850 cores.

General, IZO-SGI

2014 urtea ere urte positiboa IZO-SGI Konputazio Zerbitzuarentzat

December 16th, 2015

2014 Memoria

Ikerkuntzari zuzendutatko Informatikako zerbitzuak (Kalkulu Zientifikoa) IZO-SGI SGIker 2014ko txostena argitaratu du. Txosten osoa ondorengo estekan dago:

2014ko IZO-SGIren urteko txostena (pdf gazteleraz)

UPV/EHUko Kalkulu Zerbitzuak balantze positiboa izan du 2014. urtean. Bere zenbaki ia gehienak hobetu edo mantendu ditu beheko taulan ikusi daiteken moduan. Atal positiboen artean,  makinaren erabilpenaren igoera eta urte bukaeran egindako baliabideen handitzea, nabarmendu ditzakegu. Elementu negatiboen aldetik, publikazio kopuruaren jeitxiera ikusten dugu. Zerbitzuak,  bestalde, erabiltzaileen artean egindako inekestan oso puntuazio ona jaso du berriz ere.

 Eskeronak

Zerbitzuko memoriarekin batera, zerbitzuko ikertzaileak eskertzen ditugu Zerbitzuan jarritako konfiantzagatik, izan ere, Zerbitzuaren zenbaki onak beraien merituak baitira.

2014. urtean zehar blogean publikatutako post nabarmenenak.

IZO-SGI zerbitzua zenbakietan

Ondorengo taulan azken urteko Zerbitzuko datu esanguratsuenak laburbiltzen dira. Beheko irudian berriz Arinaren erabilera erakusten da.

2009 2010 2011 2012 2013 2014
Kalkulu koreak 440 872 1.520 1.520 1.400 1.3008
Erabilitako kalkulu orduak (milioiak) 2,11 2,26 5,76 11,27 10,4 10,1
Ikertzaile aktiboak 101 98 90 89 99 107
Talde aktiboak 53 40 39 42 47 45
Kontu berriak 49 33 33 20 34 23
Ikertzaileen satisfakzioa¹ 8.9 8.8 8.8 9,3 9,3 9,6
Artikulu zientifikoak² 44 58 57 74 87 75
Web bisitak 4.925 5.957 8.022 9.899 5.924 2.340
Orrialde ikusiak 58.731 40.987 30.042 30.738 20.323 12.057
Postak HPC blogan 29 34 27 47 36
Bisitak HPC blogan 1.431 3.818 4.741 24.613 23.677
Arina
Kalkulu koreak 320 752 1.360 1.360 1.320 1.300
Erabilitako kalkulu orduak (milioiak) 2,07 2,11 5,20 9,6 9,8 10,1
Okupazio batez bestekoa 75% 47%³ 74% 79% 83% 87%
Bidalitako lanak 38.497 65.179 68.991 98.383 100.214 76.912
2 minutuko baino gehiagoko lanak⁴ 28.377 50.624 51.735 78.846 75.406 64.335
Batez besteko lanen denbora⁵ 76 44 101 122 130 156
Batez besteko itxaron denbora⁶ 5,7 3,8 3,8 5,2 5,5 10
Péndulo
Kalkulu koreak 120 120 120 80 80 70
Erabilitako kalkulu orduak (milioiak) 0,02 0,15 0,09 0,07 0,04 0,006
Ikerbasque
Kalkulu koreak 208 208 208
Erabilitako kalkulu orduak (milioiak) 0,47 1,6 0,55

¹ SGIker Kalitate unitateagatik egindako zerbitzuari buruzko inkesta.
² Non IZO-SGI eskertzen da.
³ 2010ko erabilera nahiko txikia diruri, makina berriak instalatu ziren 300 koretik 752ra pasatzen eta Uztailaren bukaeran izan zen. Abuztuan eta Irailan makina oso utxik egon zen eta hilabete hauek pisu handia eduki dute urteko batazbestekoan. Azaroan adibidez erabilpena %76 zen berriz.
 2 minutu baino gutxiago irauten duten lanak normalean kale egin duten lanak dira. Bere iraupen motxagatik pisu txikia dute clusterraren erabileran.
 Unitatea ordutan. Ez dira kontutan hartu bi minutu baino gutxiagoko lanak.
 Unitatea ordutan. Lanek kola sistema baten bitartez bideratzen dira zeinek lan bakoitzari dagokion baliabideak ematen dizkio. Lanen itxaron denbora kolan baliabideak itxoiten ematen duten denbora da.
Makina apirilean itzali zen.
8 Urte bukaeran 652 kore berri gehitu genituen.

 

 

Arinaren erabilera 2013 Abendutik 2014.ko Azarora arte.

 

General, IZO-SGI

Resumen de Posts del 2014 / 2014 Posten Laburpena

December 15th, 2015