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noviembre, 2010:

VMD

Informazio orokorra

VMD is designed for modeling, visualization, and analysis of biological systems such as proteins, nucleic acids, lipid bilayer assemblies, etc. It may be used to view more general molecules, as VMD can read standard Protein Data Bank (PDB) files and display the contained structure. VMD provides a wide variety of methods for rendering and coloring a molecule: simple points and lines, CPK spheres and cylinders, licorice bonds, backbone tubes and ribbons, cartoon drawings, and others. VMD can be used to animate and analyze the trajectory of a molecular dynamics (MD) simulation. In particular, VMD can act as a graphical front end for an external MD program by displaying and animating a molecule undergoing simulation on a remote computer.

Nola erabili

Erabiltzaileek ziurtatu behar dute Zerbitzuko makinetan exekutatu aplikazio grafikoak erabiltzaile bakoitzaren ordenagailuan ikuzi ahal dituela. Hori zerbitzura nola konektatu atalean azaltzen da.

VMD exekutatzeko erabili

vmd

Informazio gehiago

VMD homepage.

VMD

Información general

VMD is designed for modeling, visualization, and analysis of biological systems such as proteins, nucleic acids, lipid bilayer assemblies, etc. It may be used to view more general molecules, as VMD can read standard Protein Data Bank (PDB) files and display the contained structure. VMD provides a wide variety of methods for rendering and coloring a molecule: simple points and lines, CPK spheres and cylinders, licorice bonds, backbone tubes and ribbons, cartoon drawings, and others. VMD can be used to animate and analyze the trajectory of a molecular dynamics (MD) simulation. In particular, VMD can act as a graphical front end for an external MD program by displaying and animating a molecule undergoing simulation on a remote computer.

Como usar

Los usuarios deberán cerciorarse el poder ejecutar una aplicación gráfica de los servidores del Servicio en sus ordenadores personales. Esto se explica en la guía de acceso al servicio.

Para usar VMD ejecutar en la terminal

vmd

Más información

VMD homepage.

Maestro

Informazio orokorra

Maestro is the unified interface for all Schrödinger software. Impressive rendering capabilities, a powerful selection of analysis tools, and an easy-to-use design combine to make Maestro a versatile modeling environment for all researchers.

In Guinness eta Péndulo zerbitzariak 9.0 bertsioa instalatuta dago, Maizen 8.5 bertsioa. Maestro exekutatzeko Guinness erabiltzea gomendatzen dugu, zerbitzari berriena baita eta azkeneko bertsioak erabil dezakeena.

Nola erabili

Erabiltzaileek ziurtatu behar dute Zerbitzuko makinetan exekutatu aplikazio grafikoak erabiltzaile bakoitzaren ordenagailuan ikuzi ahal dituela. Hori zerbitzura nola konektatu atalean azaltzen da.

Maestro exekutatzeko erabili

maestro

Informazio gehiago

Maestro web orrialdea.

Schrödinger web orrialdea.

Maestro

Información general

Maestro is the unified interface for all Schrödinger software. Impressive rendering capabilities, a powerful selection of analysis tools, and an easy-to-use design combine to make Maestro a versatile modeling environment for all researchers.

En los servidores Guinness y Péndulo está instalada la versión 9.0, en Maiz la versión 8.5. Recomandamos usar Maestro en el servidor Guinness, es el servidor más nuevo y el que soporta las últimas versiones de Maestro.

Como usar

Los usuarios deberán cerciorarse el poder ejecutar una aplicación gráfica de los servidores del Servicio en sus ordenadores personales. Esto se explica en la guía de acceso al servicio.

Para ejecutar Maestro usar en la terminal

maestro

Más información

Página web de Maestro.

Página web de Schrödinger.