Informática Aplicada a la Investigación Rotating Header Image

Quantum mechanics @eu

Turbomole

Presently TURBOMOLE is one of the fastest and most stable codes available for standard quantum chemical applications. Unlike many other programs, the main focus in the development of TURBOMOLE has not been to implement all new methods and functionals, but to provide a fast and stable code which is able to treat molecules of industrial relevance at reasonable time and memory requirements.

Informazio Orokorra

Katalisi homogeneo,  heterogeneo, kimika organikoa eta inorganikoa,   hainbat espectroskopia arazo eta biokimikako sistemak aztertzeko egokia da. Programaren funtzio nagusiak honakoak dira:

  • DFT (LDA, GGA, híbridos).
  • Erantzun funtzioak (HF, DFT).
  • spin-orbita interazioekin ebaztutako kalkulu erlatibistak.
  • Coupled-Cluster (CC2) kalkuluak oinarrizko eta kitzikatutako egoerentzat.
  • Egoera kitzikoatuien arteko trantsizio momentu kalkuluak (monoelectronikoak)  CC2.
  • Egituren optimizazioak (minimo eta trantsizio egoerak).
  • Frekuentzi bibrazionalak ( HF eta DFT analitikoak, besteak numerikoki ebaztuak).
  • NMR.
  • C1 Douglas-Kroll-Hess energiak.
  • ab initio dinamika molekularrak.

 

Nola Erabili

Guinness programa /software/TURBOMOLE, karpetan dago eta kalkuluak ilaretara bidaltzeko send_turbo tresna sortu da. Begiratu  Turbomole nola bidali.

TmoleX, tresna berriz inputak sortzeko eta emaitzak aztertzeko lagungarria da. TmoleX dohan jaitsi daiteke PCan instalatzeko edo Guinness-en eskuragarri dago. TmoleX erabiltzeko exekutatu:

TmoleX

Kolan kalkulatzen ari den lan bat era garbi batean bukatzeko, adibidez 1111.arina zenbakiarekin exekutatzen hari denean, erabili:

turbomole_stop 1111

Gogoratu “stop” fitxeroa ezabatzen kalkulua berriz bidali nahi baduzu.

Informazio gehiago

Turbomole web orrialdea.

Turbomole esku liburua.

Turbomole tutoriala.

Orca

Informazio Orokorra

Orca kalkulu Kuantikoak egiten dituen programa malgu, eraginkorra eta erabiltzeko erraza da.
Geruza irekiko molekulen ezaugarri espektroskopikoan kalkulurako oso egokia da. Kimika kuantikoaren metodo estandarrak semiempirikoak, DFT  ugari ditu.

Nola Erabili

Exekutagarriak  /softwarea/orca katalogoan instalatu dira, eta send_orca tresna ere eraiki dugu lanak modu erraz batean bidali ahal izateko.

 Nola bidali Orca lanak

Benchmarkak

Orca (B3LYP optimizazioa)  kalkulu batzuien benchmarkak ere gin dura zerbitzuko makinetan itaniumetako eraginkortasuna oso txikia izanik, ez dira datuak adierazten.

Cores Xeon Denbora Speed Up Eraginkortasuna
1 3438 100%
8 498 6.9 86%
16 316 10.90 62%
32 218 15.77 50%