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MetAMOS

 1. Información general

 2. Cómo usar

 3. Más información

1. Información general

MetAMOS represents a focused effort to create automated, reproducible, traceable assembly & analysis infused with current best practices and state-of-the-art methods. MetAMOS for input can start with next-generation sequencing reads or assemblies, and as output, produces: assembly reports, genomic scaffolds, open-reading frames, variant motifs, taxonomic or functional annotations, Krona charts and HTML report. 1.5rc3 version.

2. Cómo usar

Para enviar trabajos a la cola se puede usar el comando

send_metamos

que realiza unas preguntas para configurar el cálculo. Hay que tener en cuenta que MetAMOS usa mucha memoria RAM, entorno a 1 GB por millón de reads.

3. Más información

Página web de MetAMOS.

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