Anthropogenetics. The University of the Basque Country

Antropogenética - Actividad 3

Equilibrio Hardy-Weinberg y FST

Queremos estudiar la población de la ciudad albanesa de Berat. Para ello, hemos analizado muestras de habitantes de dos barrios de la ciudad para un SNP. Se han analizado 80 individuos del barrio musulmán de Mangalem y se han obtenido los siguientes resultados: AA (44 individuos), AC (28 individuos) y CC (8 individuos). Prueba de HWE: χ2(1) = 1,20; p = 0,274. Del barrio cristiano de Gorica, al otro lado del río, hemos analizado otros 70 individuos: AA (5 individuos), AC (25 individuos) y CC (40 individuos). Prueba HWE: χ2(1) = 1,60; p = 0,690.

Cuestiones:
¿Los individuos de estos dos barrios se han cruzado entre sí? Analiza si se cumple el equilibrio Hardy-Weinberg para el conjunto de la ciudad de Berat y calcula con una FST el nivel con el que se diferencian los dos barrios.
¿Qué concluirías?

Mangalem

Genotipos	Observados	Esperados	χ²
AA	44	42,1	0,09
AC	28	31,9	0,48
CC	8	6,1	0,63
Total	80	80,0	1,20

Alelos	Frec		Probabilidad
A	0,7250		0,274
C	0,2750
Total	1,0000


Gorica

Genotipos	Observados	Esperados	χ²
AA	5	4,4	0,09
AC	25	26,3	0,06
CC	40	39,4	0,01
Guztira	70	70,0	0,16

Alelos	Frec		Probabilidad
A	0,2500		0,690
C	0,7500
Total	1,0000


Berat

Genotipos	Observados	Esperados	χ²
AA	49	38,0	3,18
AC	53	75,0	6,45
CC	48	37,0	3,27
Total	150	150,0	12,90

Alelos	Frec		Probabilidad
A	0,5033		0,0003
C	0,4967
Total	1,0000

Aparentemente se comportan como poblaciones diferenciadas, con poco flujo génico, ya que el conjunto de la población no muestra equilibrio Hardy-Weinberg.

F_ST

	p(A)	2pq	Promedio
Mangalem	0,7250	0,39875	0,386875	diversidad intrapoblacional
Gorica	0,2500	0,375

Berat	0,5033	0,499977778	diversidad total

		F_ST	0,22621561

El falor de FST es muy elevado, de modo que se comprueba que presentan poco o nulo flujo génico y un alto grado de heterogeneidad interpoblacional.

@Jose A. Peña, Mikel Iriondo 2025