Antropogenética

Práctica O1. Bases de datos. Resultados

1. La Base de Datos del Genoma Humano

Secuencias

1. HLA-DPA1
2. CFTR

Cebadores

El par número 1 es el correcto.

2. PCR y enzimas de restricción

1. Tamaño del amplificado: 271
2. Temperatura adecuada de anillamiento: 59ºC
3. Tamaño de los fragmentos de restricción: 196 y 75
4. Temperatura de incubación de la enzima: 37ºC

3. La base de datos pop.STR

1. D19S433*14.2 en vascos: 0,021
2. D17S974*10 en los karitiana de Brasil: 0,500
3. TH01*7 en los burusho de Paquistán: 0,300
4. D2S1338*22 en los Yakut de Siberia: 0,020
5. CSF1PO*6 en los San de Namibia : 0,167

4. Allele Frequency Net Database (http://www.allelefrequencies.net/)

HLA-A*02:01 en la Isla de Pascua : 0,095
HLA-DRB1*04:07 en los Tehuelche de Patagonia : 0,325
HLA-B*07:02 en los Inuit Yupik de Alaska : 0,016
HLA-DQB1*02 en los Ceilandeses de Sri Lanka : 0,182
HLA-DQA1*01:02 en los Amhara de Etiopia :0,281

@Jose A. Peña, 2007-2021 Universidad del País Vasco