La relación y colaboración con otras instituciones también es imprescindible para llevar adelante los diferentes proyectos. Cabe destacar las siguientes: 

UNESCO Etxea, fundada en 1991, apoya institucionalmente a nuestra Cátedra desde su creación (2007). UNESCO Etxea pretende difundir los principios, programas y líneas de actuación de la UNESCO en el ámbito vasco. Actualmente cuenta con 132 socios que constituyen la base social de la entidad.

La Red UNESCO del País Vasco (EHUS). Como su propio nombre indica, agrupa a las diversas instituciones (centros educativos, fundaciones, catedrales, etc.) que llevan la denominación UNESCO existentes en el País Vasco.

Garabide Elkartea. Llevamos colaborando con Garabide en proyectos de cooperación lingüística desde 2013. Actualmente seguimos colaborando con el proyecto de cooperación lingüística en Cauca, Colombia.

El objetivo de Soziolinguistika Klusterra es crear y gestionar conocimiento sociolingüístico para responder a las necesidades del proceso de revitalización del euskera.

Euskal Gorrak (Federación Vasca de Asociaciones de Personas Sordar), actúa como coordinador y representante de todas las asociaciones de personas sordar adultas de la CAV. También trabaja para garantizar los servicios básicos de las personas sordas en todo el territorio vasco. En 2020 se firmó el acuerdo de colaboración.

Ayuda en Acción, organización no gubernamental: las relaciones con esta organización comenzaron en 2018 cuando la comunidad tseltal de México contactó con ellos para revitalizar la lengua tseltal.

Asociación Africanista Manuel Iradier, organización no gubernamental. El acuerdo de colaboración se firmó en 2014.

Casa del Euskera Oihaneder, ubicada en Gasteiz y dedicada a la difusión de la diversidad lingüística y del euskera.

Cátedras UNESCO de UPV/EHU:

• Cátedra UNESCO de Comunicación y Valores Educativos
• Cátedra UNESCO sobre Desarrollo Sostenible y Educación Ambiental
• Cátedra UNESCO de Paisajes Culturales y Patrimonio
• Cátedra UNESCO de Derechos Humanos y Poderes Públicos

Cooperación Bierzo Sur, organización no gubernamental: el acuerdo de colaboración ha comenzado en 2022, con el objetivo de coordinar la cooperación para la revitalización de la lengua forro en Santo Tomé y Príncipe.

Además, la Cátedra mantiene una estrecha relación con expertos en didáctica de las lenguas de la Universidad de Ginebra y con expertos de Gales, Irlanda y Francia que trabajan en torno a la educación plurilingüe y las lenguas minoritarias.