- "Acción Complementaria Vasconia en la Alta Edad Media, 450-1000" Ministry of Science and Innovation (Reference: HAR2009-07919-E) - 2010 - 2010
- "Programa de Investigación en Tecnologías para la valoración y conservación del Patrimonio Cultural" CONSOLIDER programme (Reference: CSD2007-00058) - 2008 - 2012
- "Orígenes y expansión de la agricultura en el sur peninsular y norte de Marruecos: aportaciones desde la arqueobotánica y la genética" National R&D&I Plan (Reference: HAR2008-01929/HIST) - 2008 - 2011
- "PRJ: Procesos Judiciales en las sociedades medievales del norte peninsular. Estudio histórico y corpus documental (siglos IX-XI)" National R&D&I Plan (Reference: HUM2007-61233/HIST) - 2008 - 2010
- "Grupo de Investigación en Prehistoria UPV/EHU" Basque Government (Reference: IT-288-07) - 2007 - 2012
- "De la Lucha de Bandos a la hidalguía universal: transformaciones sociales, políticas e ideológicas en el País Vasco (siglos XIV y XV)" National R&D&I Plan (Reference: HUM2007-60209) - 2007 - 2010
- "La memoria del camino: ciencia y divulgación de las primeras rutas pecuarias neolíticas en el Pirineo" Ayudas para el fomento de la cultura científica, tecnológica y de la innovación 2015, FECYT, MECD (MEDELCA FCT-15-9947) - 2016 - 2016
- "Estudo Interdisciplinar de Comunidades Alto Medievais. O caso de Viseu" Fundação Calouste Gulbenkian - 2013 - 2015
- "Las unidades básicas de paisaje agrario en España: identificación, delimitación, caracterización y valoración. La España Atlántica y Navarra" Ministerio de Educación y Ciencia de España. VI Plan Nacional de Investigación Científica, Desarrollo e Innovación Tecnológica 2008-2011. Convocatoria de ayudas de Proyectos de Investigación Fundamental No Orientada, convocatoria 2008. Proyecto coordinado (Referencia: CSO2009-12225-C05-04) - 2010 - 2012
- "Investigaciones arqueológicas en la región de Sus-Tekna (Marruecos)" Ayudas para proyectos arqueológicos en el exterior 2013, MECD - 2014 - 2014
- "Excavaciones arqueológicas en Tusculum" Ayudas para proyectos arqueológicos en el exterior 2013, MECD - 2014 - 2014
- "Los Fundamentos del Espacio Europeo (II). Identidades locales y estados emergentes en la Europa altomedieval" Plan Nacional de I+D (Programa Nacional de Fomento de la Investigación Científica y Técnica de Excelencia, Subprograma de Generación del Conocimiento). Ref. HAR2010-21950-C03-01 - 2011 - 2014
- "Dinámicas socio-ecológicas, resiliencia y vulnerabilidad en un paisaje de montaña: el Sistema Central (9000 cal. BC-1850 cal. AD) (DESIRÈ)" Ministerio de Economía y Competitividad (Plan Nacional de I + D + i) (Referencia: HAR2013-43701-P) - 2014 - 2016
- "La implantación de las especies domésticas en la Europa atlántica: origen de la agricultura y dinámica de la antropización de los ecosistemas" Ministerio de Educación y Ciencia (Plan Nacional de I + D + i) (Referencia: HAR2008-06477-C03-03/HIST) - 2009 - 2011
- "Paisajes culturales de la Lista Patrimonio Mundial. Claves para la identificación y criterios para la gestión de paisajes agroganaderos, mineros e industriales de la España Atlántica" Ministerio de Economía y Competitividad de España y Fondo Europeo de Desarrollo regional (MINECO/FEDER, UE). Programa Estatal de Fomento de la Investigación Científica y Técnica de Excelencia, Subprograma Estatal de Generación de Conocimiento, convocatoria 2015 (Referencia: CSO2015-65787-C6-3-P) - 2016 - 2018
- "Paisajes patrimoniales de la España atlántica y Navarra" Ministerio de Economía y Competitividad de España. Plan Nacional I+D+i 2008-2012. Convocatoria de ayudas de Proyectos de Investigación Fundamental No Orientada, convocatoria 2012. Proyecto coordinado (Referencia: CSO2012-39564-C07-05) - 2013 - 2015
- "Redes monásticas y complejidad social en el condado de Castilla" Plan Nacional de I+D (Programa Nacional de Fomento de la Investigación Científica y Técnica de Excelencia, Subprograma de Generación del Conocimiento). Ref. HAR2013-47889-C3-2-P - 2014 - 2017
- "Grupo de investigación en patrimonio y paisajes culturales / Ondare eta Kultur Paisaietan Ikerketa Taldea (IT315-10)" Gobierno Vasco. Proyectos Investigación del Sistema Universitario Vasco 2010 - 2010 - 2015
- "Cambios ambientales y culturales en la Comunidad Autónoma de Madrid en el III milenio A.C.: una perspectiva arqueobotánica" Creación y Consolidación Grupos de Investigación CSIC-CAM (Referencia: CCG07-CSIC/HUM-1924) - 2008 - 2008
- "Origins and spread of agriculture in the south-western Mediterranean region" European Research Council (Referencia: Advanced Grants (Proposal No 230561)) - 2009 - 2013
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