Descripción y contextualización de la asignatura

En esta asignatura estudiaremos los campos más activos de la Microbiología, centrándonos en los aspectos moleculares y de interacción con células superiores, tanto a nivel Biotecnológico como Biomédico. El objetivo es ver cómo los avances del conocimiento básico se trasladan a nuevas preguntas o aplicaciones prácticas.

Convocatoria ordinaria: orientaciones y renuncia

Evaluación contínua 70%

Realización de un trabajo asignado por el profesor de la clase perdida

La falta de asistencia a una clase se penalizará con 0.5 puntos sobre la nota final, y para aprobar el curso no se podrá faltar a más de dos clases. Las ausencias justificadas serán recuperables mediante la realización de un trabajo a criterio del profesor responsable de la asignatura.

Presentación Oral 30%

A cada estudiante se asignará el primer día de clase un tema , sobre el que elaborará el trabajo que defenderá en la sesión de evaluación final. También tendrá que presentar una memoria de unas 5 páginas (unas 2000 palabras) que recoja el contenido del trabajo. A cada estudiante se le asignará un profesor-tutor a efectos de supervisar y asistir en la preparación de este trabajo. Los temas se asignarán a los estudiantes por sorteo el primer día de clase. Según el número de alumnos se llevará a cabo una presentación oral (hasta 12 alumnos), o una presentación en formato póster (más de 12 alumnos), con la posibilidad de subirlos como entradas de un blog sobre Microbiología Molecular y Celular.

Este método de evaluación podría sufrir cambios si las directrices de las autoridades sanitarias así lo estableciesen. Las oportunas modificaciones se anunciarían oportunamente, contando con las estrategias y herramientas necesarias para garantizar el derecho del alumnado a ser evaluado con equidad y justicia

Convocatoria extraordinaria: orientaciones y renuncia

Realización de un examen escrito de todo el temario .

Este método de evaluación podría sufrir cambios si las directrices de las autoridades sanitarias así lo estableciesen. Las oportunas modificaciones se anunciarían oportunamente, contando con las estrategias y herramientas necesarias para garantizar el derecho del alumnado a ser evaluado con equidad y justicia

Temario

Tema 1. Replicación y Transcripción en bacterias

Tema 2. Plasticidad del genoma bacteriano. Recombinación general y sitio-específica. Integrones. Trasposición. Trasposones.

Tema 3. Transferencia genética horizontal. Conjugación bacteriana y plásmidos. Mecanismos de defensa frente al ADN exógeno. Sistema CRISPR/Cas.


Tema 4. Secuenciación masiva. Tecnologías. Métodos. Análisis de biodiversidad: 16S profiling, metabarcoding.

Tema 5. Secuenciación de genomas bacterianos, ensamblaje, anotación. Metagenomas.

Tema 6. Análisis molecular de comunidades microbianas Sesión práctica (Aula de ordenadores): Uso de Artemis. Instalación, descarga de genomas. Funciones. Anotación. ACT. Aplicaciones genómicas y transcriptómicas. La suite Blast+.

Tema

7. Técnicas de microscopía en Microbiología Molecular y Celular.
Tema

8. Adherencia bacteriana y Biofilms.


Tema 9. Regulación mediada por RNAs no codificantes en bacterias.

Tema 10. Estudio de las interacciones moleculares bacteria-planta.


Tema 11. Sistemas de Secreción Bacterianos.


Tema 12. Mecanismos moleculares de patogenicidad en bacterias intracelulares.

Tema 13. Saccharomyces cerevisiae como organismo modelo para uso en investigación.


Tema 14. Diagnóstico molecular y tipado de microorganismos de interés clínico.

Tema 15. Resistencia a antibióticos. Determinación de la susceptibilidad en el laboratorio clínico. Problemas clínicos más serios derivados de la resistencia.


Tema 16. Microbiología no convencional

Bibliografía

Materiales de uso obligatorio

Para cada asignatura individual incluida en el programa, los instructores proporcionarán al estudiante material didáctico adicional (es decir, presentaciones en Power Point y otras referencias especializadas como reseñas o artículos de investigación).

Bibliografía básica

- Methods for General and Molecular Microbiology, 3rd Edition. CA Redy et al, eds. ASM Press, 2007


- Bacterial Pathogenesis. Pascale Cossart, Stanley Maloy, eds. CSH Laboratory Press, 2014


- Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 2 Edition. Editor in Chief: David H. Persing. ASM Press. 2010

- Molecular Genetics of Bacteria, 4th Edition. Larry Snyder, Joseph E. Peters, Tina M. Henkin, Wendy Champness. ASM Press, Washington DC. 2013


- Mobile DNA III (3rd edition), Nancy L. Craig (Editor).ASM Press, Washington DC. 2015


- Next-Generation DNA Sequencing Informatics, 2nd Edition. Stuart M. Brown, Ed.CSH Laboratory Press, 2015



El Profesorado suministrará al alumnado la bibliografía complementaria que considere adecuada