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Toxicogenómica y toxicoproteómica

Datos generales de la materia

Modalidad
Presencial
Idioma
Inglés

Descripción y contextualización de la asignatura

Se pretende que los estudiantes adquieran conocimientos, teóricos y prácticos, en términos de nuevas tecnologías para analizar la expresión de genes y proteínas y su aplicación a la ciencia ambiental y la toxicología. Los estudiantes también deben conocer las diferentes tecnologías disponibles actualmente, las principales diferencias entre cada tecnología, el tipo de información que puede proporcionar al investigador y en qué contextos deben usarse.



Los objetivos se basan en aprender los conceptos de genoma / proteoma, genómica / proteómica, así como conceptos para identificar genes y separación de proteínas en muestras biológicas complejas, espectrometría de masas e interpretación de datos moleculares en estudios de casos de toxicología. En este sentido, los contenidos del programa incluidos en las clases del plan abordan todos estos aspectos del aprendizaje y permiten a los estudiantes experimentar con datos reales y trabajo de laboratorio para consolidar el conocimiento.

Profesorado

NombreInstituciónCategoríaDoctor/aPerfil docenteÁreaEmail
ETXEBARRIA LOIZATE, NESTORUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Catedratico De UniversidadDoctorBilingüeQuímica Analíticanestor.etxebarria@ehu.eus
ORTIZ ZARRAGOITIA, MARENUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctorBilingüeBiología Celularmaren.ortiz@ehu.eus

Competencias

DenominaciónPeso
Que el estudiante sepa y entienda los conceptos teóricos en torno a los mecanismos de toxicidad de contaminantes químicos ambientales, así como los aspectos prácticos y sus aplicaciones.16.0 %
Que el estudiante sepa y entienda los conceptos teóricos en torno a los Programas de seguimiento ambientales de los niveles y efectos de los contaminantes químicos ambientales, así como los aspectos prácticos y sus aplicaciones.16.0 %
Que el estudiante sepa y entienda los conceptos, práctica y aplicaciones de biomarcadores celulares y moleculares de exposición y efecto de los contaminantes químicos ambientales, con énfasis en cuestiones relacionadas con genotoxicidad y mutagenicidad, disrupción endocrina, estrés general, estrés oxidativo, inmunotoxicidad, etc.16.0 %
Que el estudiante sepa y entienda los conceptos, práctica y aplicaciones de las tecnologías ómicas (genómica, proteómica, transcriptómica, etc.) para el estudio de los mecanismos de toxicidad y el diagnóstico de los efectos de los contaminantes químicos ambientales.16.0 %
Que el estudiante conozca los mecanismos de resistencia de los organismos vivos (tolerancia, resistencia, resiliencia, adaptación, plasticidad, etc.) frente contaminantes químicos ambientales.16.0 %
Que el estudiante domine los conceptos y práctica de la evaluación de riesgo ambiental debido a los contaminantes químicos, incluyendo evaluaciones de ciclo de vida, y sea capaz de aplicarlos para la gestión medioambiental conociendo el marco legislativo y regulatorio en vigor tanto a nivel europeo, como estatal y autonómico (REACH, directivas marco europeas, legislación ambiental, etc).16.0 %

Tipos de docencia

TipoHoras presencialesHoras no presencialesHoras totales
Magistral4263105
Seminario6915
Taller121830

Actividades formativas

DenominaciónHorasPorcentaje de presencialidad
Aula/Seminario/Taller45.040 %
Clases magistrales105.040 %

Sistemas de evaluación

DenominaciónPonderación mínimaPonderación máxima
Evaluación continua10.0 % 10.0 %
Examen escrito50.0 % 50.0 %
OTROS40.0 % 40.0 %

Resultados del aprendizaje de la asignatura

Al final de la unidad el alumno debe:

-Ser capaz de aplicar las técnicas básicas de genómica y proteómica

- Ser capaz de explicar un experimento y sus resultados.

Temario

Topics covered include:

1. Definition and objectives of genomics and proteomics applied to toxicology

2. Presentation of the main study strategies of the genome and proteome

3. Databases and Data Research Tools

4. Presentation of the principles of mass spectrometry and identification of proteins

5. Experimental design and analysis of genomic and proteomic data

6. DNA Sequencing, Gene Identification, and Gene / Protein Phylogenetics

7. Theoretical and practical training on the identification of proteins using bioinformatics tools, extraction of proteins from biological samples and their separation in polyacrylamide gel

Bibliografía

Bibliografía básica

To be delivered during the course