Normalean mikroorganismoak gaixotasunekin soilik erlazionatzen dira. Hala ere, mikroorganismoak betidanik oso langile espezializatuak izan dira, gure onuran lan egitea eragin diegunak. Irakasgai honen helburua bikoitza da: alde batetik, mikroorganismoekin dugun erlazio estua ulertzea, eta bestaldetik, haiek egiten duten lanarekiko dugun mendekotasuna ulertzea (elikagaien eta sendagaien ekoizleak, ekosistemen osasunaren arduradunak, terapia genikorako erremintak etab.).



Mikrobiologia Aplikatua irakasgaia Biologia Zelular, Molekular eta Genetikoaren espezialitatean ematen da. Aukerazko irakasgaia da, eta gomendagarria da aurrez ikasleak Mikrobiologia eta Mikroorganismoen dibertsitatea irakasgaiak eginda edukitzea. Bi nahitaezko irakasgai hauek oinarrizkoak dira mikroorganismoen alderdi onuragarriak eta haien erabilgarritasuna ezagutzeko, baita ere gure gizarteen garapenerako mikroorganismoen garrantzia ulertzeko. Gainera, gomendatzen da Genetikako, Genetika molekularreko eta Ekologiako ezaguerak izatea, irakasgai honetan mikrobioen metabolismoaren erregulazioa, edo inguruneko mikroorganismoen arteko erlazioak aztertuko direlako. Mikroorganismoen fisiologia irakasgaia ere egitea interesgarria da, mikrobioen metabolismoaren eta bere erregulazioaren gaineko ezaguera sakona gomendatzen delako.

Gaitasun espezifikoak:

- Gizakiak mikroorganismoak eta haien produktuak erabil ditzakeen alorrak eta jarduerak ezagutzea.

- Mikroorganismoen aplikazioak ekoizpen industrialean eta ingurumenaren hobekuntzan ezagutzea.



Zeharkako gaitasunak:

- Ikasketa autonomoa, Arrazoiketa kritikoa, Erabaki-hartzea,

- Antolaketa eta plangintza, Analisietarako eta sintesietarako ahalmena,

- Ahozko eta idatzizko komunikazioa, Talde-lana, Konpromiso etikoa

- Ingurumen-sentikortasuna.



Irakasgaia bukatzean, ikaslea lan esperimentaletik lortutako emaitzak analizatzeko gai izango da, aipaturiko lanari buruzko kontzeptu eta ideia gakoak erabilita. Horretarako, ikasleak praktiketan lortutako emaitzen analisia garatu beharko du luzera zehatzeko praktika koadernoan ebaluatuko dena. Ebaluazioan, honako irizpide hauek kontuan hartuko dira: praktiketako emaitzen prozesatze eta analisia zuzena, idatzitako hizkuntzaren egokitasuna, sintesirako ahalmena eta emaitzen eta eztabaidaren arteko koherentzia.

Irakasgaia bukatzean, ikaslea oinarrizko prozesu esperimentaleko eskema bat egiteko gai izango da. Irakasleak proposatuta, ikasleak interes industrial duen mikroorganismo baten hautapen-prozesuaren eskema bat egin beharko du. Eskemak ikasgelan berrikusiko eta analizatuko dira. Gainera, laborategian lan praktikoa egingo da arlo honetaz. Ebaluatuko dira mikroorganismo egokia isolatzeko eta egiaztatzeko segidaren diseinu zehatza baita prozesuaren diseinuaren originaltasuna ere.

Irakasgaia bukatzean, ikaslea Mikrobiologia aplikatuaren termino eta kontzeptu gakoak egokiro erabiltzeko gai izango da. Praktiketako koadernoa eta azkeneko azterketa erabilita kontzeptu gakoen erabilera egokia ebaluatuko da.

PROGRAMA TEORIKOA

Sarrera:

1. Mikroorganismoen erabilera erreminta erabilgarri gisa. Mikroorganismoek ekoiztutako produktuak. Beste prozesu mikrobiano interesgarri batzuk. Mikroorganismo interesgarriak. Prozesu industrialen garapena. Ekoizkinen berreskuratzea. Patenteak.



Ekoizpen industriala:

2. Mikroorganismoen aukeraketa eta hobekuntza. Mikroorganismoen aukeraketarako irizpideak. Mikroorganismo interesgarrien isolaketa. Metabolismo primarioaren mekanismo erregulatzaileak. Metabolismo sekundarioaren mekanismo erregulatzaileak. Mekanismo erregulatzaileen gainditzea. Hobekuntza genetikorako metodoak. Anduien mantentzea. Ariketak.

3. Elikagaien industriko mikroorganismoak. Okingintza. Esnekiak. Landare-elikagai azidotuak. Koji prozesuren bidez hartzitutako elikagaiak. Edari alkoholdunen ekoizpena. Ozpinaren ekoizpena. Azido organikoen ekoizpena. Aminoazidoen ekoizpena.

4. Mikroorganismoen erabilera Farmazia-industrian. Nukleotidoen ekoizpena. Bitaminen ekoizpena. Antibiotikoen ekoizpena. Biofarmakoak. Terapia genikoa. Terapia fagikoa.

5. Bioeraldaketak eta entzimen ekoizpena. Bioeraldaketak: erreakzio eta baldintza motak, esteroide eta esterolen bioeraldaketak. Xenobiotikoen bioeraldaketak. Entzimen ekoizpena: Entzimen erabilerak. Mikroorganismo ekoizleak. Entzimen berreskuratzea. Entzimen egorkortzea.



Ingurumena:

6. Hondakin-uren tratamendu sekundarioa. Sarrera: kontzeptua, bioerremediazioa. Hondakin-uren tratamenduaren oinarriak. Tratamendu-sistemak: diluzioa, injekzioa eta kontzentrazioa. Petrolioak sortutako kutsadura.

7. Hondakin solidoen tratamendua. Solidoen tratamendu anaerobioak (etxeko zaborren tratamendua): hobi septikoak eta hobi beltzak. Solidoen tratamendu anaerobioak (HUA-etan sortutako lokatzen tratamendua): erreaktore anaerobioa, Imhoff tanga. Lur-zoru kutsatuen tratamenduak: landfarmeng, biopilaketak, konpostaketa. Kontaminatzaileen sorrera murriztuz: prozesu berriak



Beste alor batzuk:

8. Nekazaritzako mikroorganismoen aplikazioak. Sarrera. Fitopatogenoak. Landare transgenikoak. Landare-transgenikoan erabiltzen den metodologia. Aplikazioak.

9. Mikroorganismoen erabilera energia lortzeko. Bioerregaien ekoizpena: bioetanola, diodiesela, biogasa. Hidrogenoaren ekoizpena. Elektrizitatearen ekoizpena.

10. Biomeatzaritza. Sarrera. Mikroorganismo ekoizleak. Lixibiazio indutria-prozesuak



PROGRAMA PRAKTIKOA

1. Mikroorganismo proteasa ekoizleen isolaketa.

2. Bakterioen konjugazioa

3. Elikagai eta edarien ekoizpena

4. Mikroorganismo antibiotiko ekoizleak

Irakasgaia emateko hiru metodo orokor konbinatzen dira: eskola magistralak, zeinetan ariketa-proposamenaz ikaslearen parte-hartzea bultzatzen den; eskola praktikoak, eskola magistraletan deskribatutako alderdi batzuk garatzen direnak; eta landa praktikak, mikrobiologiarekin erlazionatuta dagoen enpresa bisitatzeko erabiltzen direnak.

Irakasgai honen kalifikazioa jarduera desberdinetan lortutako emaitzetan oinarrituko da.

• Ebaluazio Jarraituaren Sistema
• Azken Ebaluazioaren Sistema
• Kalifikazioko tresnak eta ehunekoak:
  • Garatu beharreko proba idatzia (%): 60
  • Praktikak egitea (ariketak, kasuak edo buruketak) (%): 30
  • Landa praktikak (txosten idatzia) (%): 10

Etengabeko ebaluazioa:



Irakaskuntza magistrala idatzizko proben bidez ebaluatuko da. Proba horiek 5-6 galdera labur izango dituzte. Erantzunen argitasuna eta ordena, hizkuntzaren egokitasuna, termino eta kontzeptu mikrobiologikoen ezagutza, kontzeptuen arteko erlazioa eta abar baloratuko dira. Jarduera honetan lortutako nota % 60koa izango da azken notan, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Atal honetako azken nota modulatu ahal izango da ikasleak klase magistralen garapenean duen parte-hartzea eta ariketak ebazterakoan egiten duen lan pertsonala kontuan hartuta.



Praktikak bikoteka eta/edo 4-6 pertsonako taldeetan egiten dira, praktikaren arabera. Bikoteka edo taldeka lortutako emaitzak taldean aztertu eta eztabaidatzen dira (18 ikasle/praktika-talde) jardunaldi bakoitza amaitzean. Irakaskuntza praktikoan garatutako gaitasunak ebaluatzeko, laborategiko lan pertsonalaren eta talde-lanaren etengabeko jarraipena egingo da, eta banakako praktika-koaderno bat aurkeztuko da, egindako lan praktikoarekin zerikusia duten gaiei modu arrazoituan erantzuteko. Koadernoak 15 eguneko epean entregatu behar dira, praktiketako azken egunetik zenbatzen hasita. Jarduera honen nota azken notaren % 30 izango da, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Praktiketako koaderno guztiak berrikusten dira eta horietan idatzitako zuzenketak ikasleei itzuli aurretik. Irakasgaiaren ezaugarriak direla eta, nahitaezkoa da laborategira joatea eta praktikak egitea.

Landa-praktikak (enpresetara bisitak) borondatezkoak dira, eta irteerako bertaratzea egiaztatuz eta ikasleak bisitatutako enpresaren jarduerari eta ikasgaiarekin duen harremanari buruz egindako txostena emanez ebaluatuko dira. Irakasgaiaren zati honetan lortutako nota azken notaren % 10 izango da. Enpresara ez joateak edo txostena ez aurkezteak oharraren % 10ari uko egitea dakar. Irakasgaiaren ebaluazioa 3 jardueretan (irakaskuntza teorikoa eta praktikoa, enpresarako bisita) lortutako puntuazioen baturaren azken emaitza izango da, betiere irakaskuntza teorikoa eta irakaskuntza praktikoa gainditu badira. Bestela, ikaslea gehienez 4/10eko kalifikazioarekin ebaluatuko da.



Ohiko deialdia onartzen ez bada, onartutako jardueren kalifikazioak gordeko dira ezohiko deialdian aplikatzeko.





Azken ebaluazioa:



Azken ebaluazioa ebaluazio-eredu gisa aukeratzen duten ikasleek idatziz aurkeztu beharko diete irakasgaiaz arduratzen diren irakasleei ebaluazio jarraituari uko egiten diotela; horretarako, 9 asteko epea izango dute, irakasgaia ematen den lauhilekoa hasten denetik.



Ikasle horien ebaluazioa idatzizko probaren eta/edo proba praktikoaren bidez egingo da. Irakaskuntza magistrala idatzizko proba baten bidez ebaluatuko da. Proba horrek 5-7 galdera labur izango ditu. Erantzunen argitasuna eta ordena, hizkuntzaren egokitasuna, termino eta kontzeptu mikrobiologikoen ezagutza, kontzeptuen arteko erlazioa eta abar baloratuko dira. Jarduera honetan lortutako nota % 70ekoa izango da azken notan, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Irakaskuntza praktikoarekin lotutako gaitasun espezifikoak azterketa teoriko/praktiko baten bidez ebaluatuko dira. Jarduera honen nota azken notaren % 30 izango da, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da.



Deialdiari uko egitea:



Azterketen data ofizialean ezarritako probara aurkezten ez badira, automatikoki uko egingo zaio dagokion deialdiari, bai ebaluazio jarraitua egin behar duten ikasleek, bai azken ebaluazioa egin behar dutenek. Nolanahi ere, deialdiari uko eginez gero, aurkeztu gabekotzat edo aurkeztu gabekotzat joko da.



Ebaluazio-probak egiten diren bitartean, debekatuta egongo da ikasleek liburuak, oharrak edo apunteak erabiltzea, bai eta telefono, elektronika, informatika edo bestelako aparatu edo gailuak erabiltzea ere. Jokabide desonesta edo iruzurrezkoa izanez gero, etika akademikoari eta jardunbide lizunkoien edo iruzurrekoen prebentzioari buruzko protokoloan xedatutakoa aplikatuko da UPV/EHUko ebaluazio-probetan eta lan akademikoetan.

Ohiko deialdia onartzen ez bada, etengabeko ebaluazioa behar duten ikasleentzat, onartutako jardueren kalifikazioak gordeko dira, ezohiko deialdian aplikatzeko. Irakaskuntza magistrala idatzizko proben bidez ebaluatuko da. Proba horiek 5-6 galdera labur izango dituzte. Erantzunen argitasuna eta ordena, hizkuntzaren egokitasuna, termino eta kontzeptu mikrobiologikoen ezagutza, kontzeptuen arteko erlazioa eta abar baloratuko dira. Jarduera honetan lortutako nota % 60koa izango da azken notan, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Irakaskuntza praktikoan garatutako gaitasunak egindako lan praktikoarekin lotutako azterketa teoriko/praktiko baten bidez ebaluatuko dira. Jarduera horren nota azken notaren % 30 izango da, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Landa-praktikak (enpresetarako bisitak) azterketa teorikoaren testuinguruan ebaluatuko dira ( % 10). Irakasgaiaren ebaluazioa 3 jardueretan (irakaskuntza teorikoa, irakaskuntza praktikoa, enpresarako bisita) lortutako puntuazioen baturaren azken emaitza izango da, betiere irakaskuntza teorikoa eta irakaskuntza praktikoa gainditu badira. Bestela, ikasleak gehienez 4/10 kalifikazioarekin ebaluatuko dira.



Azken ebaluazioa behar duten ikasleen kasuan, idatzizko proba eta/edo proba praktikoa egingo da. Irakaskuntza magistrala idatzizko proba baten bidez ebaluatuko da. Proba horrek 5-7 galdera labur izango ditu. Erantzunen argitasuna eta ordena, hizkuntzaren egokitasuna, termino eta kontzeptu mikrobiologikoen ezagutza, kontzeptuen arteko erlazioa eta abar baloratuko dira. Jarduera honetan lortutako nota % 70ekoa izango da azken notan, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da. Irakaskuntza praktikoarekin lotutako gaitasun espezifikoak azterketa teoriko/praktiko baten bidez ebaluatuko dira. Jarduera honen nota azken notaren % 30 izango da, eta gainditzeko 5/10 lortu beharko da.



Azterketen data ofizialean ezarritako probara aurkezten ez badira, automatikoki uko egingo zaio dagokion deialdiari, bai ebaluazio jarraitua egin behar duten ikasleek, bai azken ebaluazioa egin behar dutenek. Nolanahi ere, deialdiari uko eginez gero, aurkeztu gabekotzat edo aurkeztu gabekotzat joko da.



Ebaluazio-probak egiten diren bitartean, debekatuta egongo da ikasleek liburuak, oharrak edo apunteak erabiltzea, bai eta telefono, elektronika, informatika edo bestelako aparatu edo gailuak erabiltzea ere. Jokabide desonesta edo iruzurrezkoa izanez gero, etika akademikoari eta jardunbide lizunkoien edo iruzurrekoen prebentzioari buruzko protokoloan xedatutakoa aplikatuko da UPV/EHUko ebaluazio-probetan eta lan akademikoetan.

Eskola praktikoetan, ikasleek laborategira honako material hau eraman beharko dute: protokoloa (irakasgaiaren eGela gunean jarrita egongo dena), mantala, errotuladore iraunkorra, eta ikasleak behar baditu, erabilera bakarreko eskularruak.
Irakasgai guztirako erabil daitekeen testu bakarrik ez dago.
Irakasgai honen ikasgela birtuala eGela plataforman egongo da.

Oinarrizko bibliografia

Leveau JY, Bouix M (2000) Los microorganismos de interés industrial. Acribia. Zaragoza.

Waites MJ, Morgan NL, Rockey JS, Hington G. (2001) Industrial Microbiology. An Introduction. Blackwell Science, Oxford.

Bitton G (2001) Wastewater Microbiology. Ed. John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey, USA.

Rittmann, B. E. & P.L. McMarty (2001) Biotecnologia del medio ambiente. Principios y aplicaciones. McGraw Hill.

Hutkins RW (2006) Microbiology and technology of fermented foods. Blackwell Publishing Ltd

Smith, JE (2009) Biotechnology (5th ed.). Cambridge University Press

Glazer AN, Nikaido H (2007) Microbial Biotechnology. Fundamentals of Applied Microbiology (2nd ed.) Cambridge University Press

Schaechter M (Editor-in-Chief) (2009) Encyclopedia of Microbiology (3rd ed.) Elsevier

Thieman WJ, Palladino MA (2010)Introducción a la Biotecnología (2ª ed.) Pearson

Gehiago sakontzeko bibliografia

Okafor N (2007) Modern industrial microbiology and biotechnology Science Publishing
Renneberg R (2008). Biotecnología para principiantes. Reverté
Hui YH, Goddik LM, Hansen AS, Josephsen J, Nip W-K (2004) Handbook of food and beverage fermentation technology Marcel Dekker
Mara D, Horan N. eds (2003) Handbook of water wastewater and microbiology; Academic Press, Amsterdam.
Scragg A (2005) Environmental Microbiology (2nd ed.) Oxford University Press
Hurst CJ, Crawford RL, Knudsen GR, McInerney MJ, Stetzenbach LD (2002) Manual of Environmental Microbiology 2 Ed. American Society for Microbiology Press.
Atlas RM (2005) Bioremediation: Applied Microbial Solutions for Real-World Environmental Cleanup. Ed. ASM Press.
Salminen S, von Wright A, Ouwehand AC (2004) Lactic Acid Bacteria: Microbiological and Functional Aspects, Marcel Dekker.
Tkacz JS, Lange L (2004) Advances in Fungal Biotechnology for Industry, Agriculture, and Medicine CPL Scientific Publishing Services Limited.
Wilson M (2005) Microbial Inhabitants of Human. Their ecology and role in health and disease. Cambridge University Press

Aldizkariak

Reviews in Environmental Science and Biotechnology
Applied and Environmental Microbiology
Journal of Applied Microbiology
Applied Microbiology and Biotechnology
Advances in applied microbiology
Biotechnology Annual Review
Critical Reviews in Biotechnology
Current Opinion in Biotechnology
Microbiology today
Environmental Pollution
Journal of Bioscience and Biotechnology
Water Research

Web helbideak

Society for Applied Microbiology: http://www.sfam.org.uk
American Society for Microbiology: http://www.asm.org/
Sociedad Española de Microbiologia: http://www.semicro.es/
Compañero del Brock 8ªEd: http://cwx.prenhall.com/bookbind/pubbooks/brock
Microbiology Resources Information and Links: http://www.microbes.info/resources/
The microbial world: http://helios.bto.ed.ac.uk/bto/microbes/
Microbeworld: http://www.microbeworld.org/home.htm
Microbial zoo: http://commtechlab.msu.edu/sites/dlc-me/
Virtual Museum of Bacteria: http://www.bacteriamuseum.org/main1.shtml
Aguas residuales: http://www.cepis.ops-oms.org/bvsaar/e/home.htm
Water Science for schools: http://ga.water.usgs.gov/edu/wuww.html
Cómo resolver aspectos prácticos de Microbiología: http://ocw.ehu.es/course/view.php?id=48
Métodos básicos de enumeración de poblaciones bacterianas: http://ocw.ehu.es/course/view.php?id=297