Gaia
Genomika, proteomika eta bioinformatikaren oinarriak
Gaiari buruzko datu orokorrak
- Modalitatea
- Ikasgelakoa
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- Ingelesa
Irakasleak
Izena | Erakundea | Kategoria | Doktorea | Irakaskuntza-profila | Arloa | Helbide elektronikoa |
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ALONSO ALEGRE, SANTOS | Euskal Herriko Unibertsitatea | Doktore Ikertzaileak | Doktorea | Elebakarra | Antropologia Fisikoa | santos.alonso@ehu.eus |
ARIZMENDI BASTARRIKA, JESUS MARIA | Euskal Herriko Unibertsitatea | Irakaslego Agregatua | Doktorea | Elebiduna | Biokimika eta Biologia Molekularra | jm.arizmendi@ehu.eus |
BILBAO CATALA, JOSE RAMON | Euskal Herriko Unibertsitatea | Irakaslego Osoa | Doktorea | Elebiduna | Genetika | joseramon.bilbao@ehu.eus |
FULLAONDO ELORDUI-ZAPATERIECHE, ASIER | Euskal Herriko Unibertsitatea | Irakaslego Agregatua | Doktorea | Elebiduna | Genetika | asier.fullaondo@ehu.eus |
JUGO ORRANTIA, BEGOÑA MARINA | Euskal Herriko Unibertsitatea | Unibertsitateko Irakaslego Titularra | Doktorea | Elebiduna | Genetika | begonamarina.jugo@ehu.eus |
LOPEZ LOPEZ, ELIXABET | Euskal Herriko Unibertsitatea | Irakaslego Atxikia (Laguntzaile Doktorea) | Doktorea | Elebiduna | Biokimika eta Biologia Molekularra | elixabet.lopez@ehu.eus |
ZUBIAGA ELORDIETA, ANA MARIA | Euskal Herriko Unibertsitatea | Unibertsitateko Katedraduna | Doktorea | Elebiduna | Genetika | ana.zubiaga@ehu.eus |
ARANSAY BAÑARES, ANA MARIA | Centro de Investigacion Cooperativa en Biociencias (CIC-bioGUNE) | Besteak | Doktorea | amaransay@cicbiogune.es | ||
BERNALES PUJANA, IRANTZU | SGIKER Servicio Central de Análisis, UPV/EHU | Besteak | Doktorea | irantzu.bernales@ehu.eus | ||
LAVIN TRUEBA, JOSE LUIS | Neiker-Tecnalia | Besteak | Doktorea |
Irakaskuntza motak
Mota | Ikasgelako orduak | Ikasgelaz kanpoko orduak | Orduak guztira |
---|---|---|---|
Magistrala | 25 | 38 | 63 |
Ordenagailuko p. | 25 | 37 | 62 |
Irakaskuntza motak
Izena | Orduak | Ikasgelako orduen ehunekoa |
---|---|---|
Azalpenezko eskolak | 50.0 | 50 % |
Lanak ekipo informatikoekin | 50.0 | 50 % |
Txostenak eta azalpenak lantzea | 25.0 | 0 % |
Ebaluazio-sistemak
Izena | Gutxieneko ponderazioa | Gehieneko ponderazioa |
---|---|---|
Bertaratzea eta Parte-hartzea | 0.0 % | 50.0 % |
Trabajos prácticos /Valoración por parte del Tribunal del trabajo escrito | 0.0 % | 50.0 % |
Irakasgai-zerrenda
Tema 1
INTRODUCCIÓN A LA GENÓMICA. SECUENCIACIÓN DE GENOMAS. EL GENOMA HUMANO
Tema 2
ANOTACIÓN DE GENOMAS. GENÓMICA COMPARATIVA. GENOMAS DE ESPECIES MODELO EN BIOMEDICINA. ONTOLOGÍA DE GENES.
Tema 3
ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE SECUENCIAS. BASES DE DATOS. COMPARACIÓN POR SIMILITUD. ALINEAMIENTOS DE SECUENCIAS Y GENOMAS.
Tema 4
ANÁLISIS DE LA VARIACIÓN GENÓMICA.
SNPS: DETECCIÓN Y TECNOLOGÍAS DE GENOTIPACIÓN. VARIACIÓN GENÓMICA EN LA ESPECIE HUMANA Y SU IMPLICACIÓN EN LA SALUD.
Tema 5
DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO Y MAPAS HAPLOTÍPICOS. APLICACIONES DE LA TECNOLOGÍA DE SNPS: MAPEO DE QTLS Y ESTUDIOS DE ASOCIACIÓN CON ENFERMEDADES.
Tema 6¿¿¿¿.
ANÁLISIS DE LA EXPRESIÓN GENÓMICA.
MICROMATRICES DE DNA. DISEÑO EXPERIMENTAL Y METODOLOGÍA. NUEVAS HERRAMIENTAS: CGH, CHIP ON CHIP.
Tema 7
MINERÍA DE DATOS
ANÁLISIS ESTADÍSTICO DE DATOS DE MICROMATRICES
Tema 8
INTRODUCCIÓN A LA PROTEÓMICA. MÉTODOS DE SEPARACIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS.
Tema 9
ESPECTROMETRÍA DE MASAS. ESTRATEGÍAS DE IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS.
Tema 10
BIOINFORMÁTICA EN LA PROTEÓMICA.
Bibliografia
Oinarrizko bibliografia
1.- A. MALCON CAMPBELL & LAURIE J. HEDER (2003): DISCOVERING GENOMICS, PROTEOMICS AND BIOINFORMATICS.. PEARSON EDUCATION, INC. BENJAMIN CUMMINGS, SAN FRANCISCO.2.- G. GIBSON AND S.V. MUSE. A PRIMER OF GENOME SCIENCE. (2004). SINAUER ASSOCIATES, INC.
3.- AZUAJE, F., DOPAZO, J (EDS.). DATA ANALYSIS AND VISUALIZATION IN GENOMICS AND
PROTEOMICS. (2005) WILEY
4.- MOUNT DW. (2001): BIOINFORMATICS. SEQUENCE AND GENOME ANALYSIS. APPLICATIONS IN BIOLOGICAL SCIENCE AND MEDICINE. CDR PRESS, BOCA RATON.
5.- BAXEVANIS, A.D., OUELLETTE, B.F.F. 2001. BIOINFORMATICS. A PRACTICAL GUIDE TO THE ANALYSIS OF GENES AND PROTEINS. 2ND ED. WILEY-INTERSCIENCE.
6.- DC. LIEBLER. (2002): INTRODUCTION TO PROTEOMICS. TOOLS FOR THE NEW BIOLOGY.. HUMAN PRESS, TOTOWA, NEW YORK,
7.- JAMES P. (2001): PROTEOME RESEARCH: MASS SPECTROMETRY. SPRINGER, BERLIN.
8.- E. DE HOFFMANN & V. STROOBANT (2002): MASS SPECTROMETRY: PRINCIPLES AND APPLICATIONS. WILEY, CHICHESTER
ARTÍCULOS
- ALAN E., MD GUTTMACHER, ET AL. (2004): GENOMIC MEDICINE. ARTICLES FROM THE NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE. MASSACHUSETTS MEDICAL SOCIETY USA
- HACKL H., ET AL (2004): ANALYSIS OF DNA MICROARRAY DATA. CURR. TOP. MED. CHEM. 4(13):1357-70
-KERR MK. (2003): DESIGNS CONSIDERATIONS FOR EFFICIENT AND EFFECTIVE MICROARRAY STUDIES. BIOMETRICS DEC, 59(4):822-8
- NADON R, & SHOEMAKER J. (2002): STATISTICAL ISSUES WITH MICROARRAYS: PROCESSING AND ANALYSIS. TRENS GENET. MAY18(5): 265-71
OTROS ARTÍCULOS SELECCIONADOS DE LAS REVISTAS: NATURE, SCIENCE, CELL, MOLECULAR CELL, EMBO J, NATURE GENETICS¿PARA SU LECTURA Y DISCUSIÓN EN LOS SEMINARIOS