Irakasgaiaren azalpena eta testuingurua

El objetivo del curso es proporcionar al estudiante una visión de los fundamentos conceptuales de las técnicas moleculares y su aplicación a áreas relacionadas con la Biología Vegetal y Agrobiología. Las técnicas están orientadas a proporcionar al estudiante la adquisición de conocimientos teórico-prácticos y herramientas dentro del campo de la biología molecular de plantas que le permitirán aplicar su apliacaión en proyectos y soluciones en éste área. Es estudiante aquiere competencias para contrastar hipótesis sobre los mecanismos moleculares subyacentes a los diferentes procesos fisiológicos en plantas y su regulación genética, adaptaciones al ambiente y estudio de la interacción genotipo-ambiente. Se estudia la aplicación de estas técnicas a proyectos biotecnológios, a la protección de cultivos, conservacion de recursos fitogenétcio y mejoramiento genéticos.





COMPETENCIAS

- Capacidad de valorar la información que las diferentes técnicas moleculares puede aportar a la resolución de problemas y estudios con plantas y su interacción con ambiente

- Capacidad de valorar la idoneidad de las herramientas metodológicas basadas en técnicas moleculares y ómicas más adecuadas a una investigación concreta

- Capacidad de acceso a los motores de búsqueda de la información y manejo de las bases de genes y proteínas

- Capacidad de planificación de la investigación que requiera el uso de técnicas moleculares y ómicas

- Capacidad de análisis, visión crítica y compromiso ético de trabajos de investigación en el campo de la Agrobiología Ambiental

Ohiko deialdia: orientazioak eta uko egitea

Sistema de evaluación continua de los conocimientos teórico-prácticos los trabajos, estudios de casos, y seminarios realizados. Prueba tipo test



Para el alumnado, sujeto tanto a evaluación continua como final, bastará con no presentarse a la prueba final para que la calificación final de la asignatura sea no presentado o no presentada.

Ezohiko deialdia: orientazioak eta uko egitea

Sistema de evaluación continua de los conocimientos teórico-prácticos los trabajos, estudios de casos, y seminarios realizados. Prueba tipo test

Irakasgai-zerrenda

Tema 1. Características estructurales y funcionales de los ácidos nucleicos. Técnicas básicas de análisis de ácidos nucleicos y proteínas. Electroforesis en gel de agarosa, SDS-PAGE. Amplificación in vitro de los ácidos nucleícos: PCR convencional y RT-PCR



Tema 2. Organización del genoma vegetal. Composición del DNA, elementos repetitivo, familias génicas. Tipos de RNA. El cromosoma. El plastoma.





Tema 3. Expresión y regulación génica en plantas. Niveles de regulación génica elementos reguladores, factores de transcripción, procesamiento del RNA, RNA antisentido, RNA interferencia, RNA no codificante, microRNA, CRISPR/Cas9.



Tema 4. Omicas en plantas. Genómica, proteómica y metabolómica. Estudio de asociación de genoma completo (GWAS). Aplicación a la mejora genética en plantas



Tema 5. Bases de datos de genes y proteínas: GenBank, UniProt, KEGG. Introducción al análisis y alineamiento de secuencias. Diseño de primers



Tema 6. Mejora genética y cultivo "in vitro". Aplicaciones en agricultura. Conservación de recursos fitogenéticos. Micropropagación, Hibridación somática. Criopreservación.



Tema 7. Biotecnología vegetal. Marcadores moleculares y su aplicación a la mejora genética en plantas. Mapas genéticos. Genes cualitativos, Quantitative Trait Loci (QTL) and Quantitative Trait Alelles (QTA).



Tema 8. Patógenos y enfermedades vegetales. Aplicaciones de la Biología Molecular. Agentes patógenos. Virus vegetales. Identificación de patógenos por técnicas moleculares: ELISA, PCR. Protección y legislación de los cultivos.



CONTENIDOS PRÁCTICOS DE LABORATORIO:

- Obtención de ácidos nucleicos: cuantificación

- Amplificación del DNA por PCR in vitro.

- Electroforesis de DNA

- Técnicas fitopatológicas

- Prácticas de cultivo in vitro



PRÁCTICAS ORDENADOR:

- Manejo de bases de datos de genes y proteínas: UniProt, KEGG

- Análisis de secuencias

- Manejo de recurso para el diseño de primers

- RT-PCR: estudio de caso, práctica virtual



SEMINARIOS Y TALLERES

- Marcadores moleculares basados en el DNA: SNP, RFLP, SSR, etc.

- Estudio de caos sobre las técnicas vista en el curso y su aplicación en Agrobiología Ambiental

- Temas de actualidad: CRISPR, proyectos genómicos en plantas, avances, etc.

Bibliografia

Nahitaez erabili beharreko materiala

Bata de laboratorio

Oinarrizko bibliografia

AGRIOS GN. Fitopatología. Ed. Limusa.

AGRIOS GN. 2005. Plant Pathology. 5th Ed. Elsevier

TIESSEN FAVIER A. Fundamentos y Metodologías innovadoras para el mejoramiento genético de maíz. Primera Ed. Versión 1.36. 2009. Editorial Fundación Ciencia Activa.

PATOLOGÍA VEGETAL. Tomos I y II. Sociedad Española de Fitopatología, 1996.

Aldizkariak

Functional Plant Biology



Journal of Experimental Botany



Journal of Plant Growth Regulation



Journal of Plant Pathology



In vitro celular and Developmental Biology



International Journal of Plant Science



New Phytologist



Nature protocols



Phytochemistry



Photochemistry and Photobiology



Plant and Cell Physiology



Plant Molecular Biology



Plant Cell Reports



Plant Pathology Journal



Plant Physiology



Plant Physiology and Biochemistry



Plant Science



The Pant Cell