{"id":1153,"date":"2010-09-30T15:11:20","date_gmt":"2010-09-30T13:11:20","guid":{"rendered":"http:\/\/www.ehu.es\/sgi\/Arina\/?p=1153"},"modified":"2011-03-31T12:39:57","modified_gmt":"2011-03-31T10:39:57","slug":"gaussian-nola-bidali","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/arina_eu\/lanak-bidali\/gaussian-nola-bidali","title":{"rendered":"Gaussian nola bidali"},"content":{"rendered":"<h2>send_gauss agindua<\/h2>\n<p>G09 lanak bidaltzeko agindu hau erabiltzea gomendatzen dugu. Honek, gaussianeko *.com-ean prozesagauilu kopurua eta memoria egokitzeaz gain, torqueren kolako sarrera fitxategia ere prestatuko du.<\/p>\n<p>Lana, exekuzio nodoetan egingo da eta emaitza bertan gorde. Lana jarraitu ahal izateko <code>remote_vi<\/code> eta <code>remote_molden<\/code> prestatu ditugu (ikusi beherago).<\/p>\n<pre><code>send_gauss<\/code> erabiltzeko modua honakoa da:<\/pre>\n<p>send_gauss lana denbora\u00a0 proz_kop [mem] [ TORQUE beste aukerak]<\/p>\n<p>Zein:<\/p>\n<ul>\n<li><code>lana<\/code>: gaussian inputaren izena da *.com estensiorik gabe.<\/li>\n<li><code>denbora<\/code>: \u00a0oo:mm:ss formatoan, kakuluarentzat eskatzen den denbora.<\/li>\n<li><code>proz_kop<\/code>: Erabiltzea nahi den prozesagailu kopurua, 8 baino txikiagoa edo 8ren multiploa izan behar du . Prozesagailu mota ere adierazi daiteke \u00ab:xeon\u00bb, \u00ab:itanium\u00bb, edo \u00ab:opteron\u00bb.<\/li>\n<li><code>mem<\/code>: \u00a0zenbat memoria eskatzen den nodo bakiotzeko<\/li>\n<li>[<code>TORQUE Aukera Aurreratuak<\/code>]: torque ilara sistemari adierazi nahi zaizkion aukera aurreratuak.<\/li>\n<\/ul>\n<h3>Adibideak<\/h3>\n<pre>send_gauss h2o 400:00:00 16<\/pre>\n<p>h2o lana \u00a016 prozesagailuetara bidaliko du, 8 prozesagailu nodo bakoitzean, \u00a0400:00:00 ordutarako. \u00a0Memoria defektuzkoa jarriko zaio, \u00a0(nproc*900mb), 7200mb.<\/p>\n<pre>send_gauss h2o 10:00:00 8 60<\/pre>\n<p>h2o \u00a08 prozesagailuetara bidaliko du (nodo bakarrera) \u00a0 60gb-etako \u00a0RAM memoria eskatuz. Lanak 10 ordu iraungo ditu gehienez.<\/p>\n<pre>send_gauss h2o 23:00:00 16:itaniumb 16 ``-m be -M niri@ehu.es -W depend=afterany:4827''<\/pre>\n<p>h2o en 16 \u00a0 itaniumb motako prozesagailuetara bidaliko du, 16gb-etako \u00a0 RAM memoria erreserbatuz. Eskatutako denbora 23 ordutakoa da. Torque ilara sistema, lana hasi eta bukatzean email bay bidaliko du \u00abniri@ehu.es\u00bb helbidera.\u00a0\u00a0Gainera, \u00a04827 lana bukatu harte ezingo da hasi.<\/p>\n<h2 id=\"qsubI\">qsub interaktiboa<\/h2>\n<p><code>qsub<\/code><\/p>\n<p>exekutatzen bada menu interaktibo bat agertuko zaigu eta honek egindako galderak erantzunez g09 bidlai hal izango da. [intlink id=\u00bb667&#8243; type=\u00bbpost\u00bb]qsub interaktiboari[\/intlink] buruzko informazio gehiago.<\/p>\n<h2>Ohiko qsub<\/h2>\n<p>Torquerako qsub skritp bat presta daiteke zuzenean. [intlink id=\u00bb677&#8243; type=\u00bbpost\u00bb target=\u00bb_blank\u00bb]Esteka honetan[\/intlink] adibide batzuk daude.<\/p>\n<h2>Lanaren jarraipena<\/h2>\n<p><code>remote_vi<\/code> eta <code>remote_molden<\/code> aginduek, lana exekutatzen ari den bitartean .log fitxeroa ikusteko edo Molden-ekin marrasteko aukera eskeintzen dute. Lana <code>send_gauss<\/code> edo <code>qsub<\/code> interaktiboarekin bidali behar da.<\/p>\n<pre>remote_vi 2341\r\nremote_molden 2341.arina<\/pre>\n<p>edo<\/p>\n<pre>remote_vi 2341.arina\r\nremote_molden 2341<\/pre>\n<p>non 2341(.arina) lanaren identifikadorea den.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>send_gauss agindua G09 lanak bidaltzeko agindu hau erabiltzea gomendatzen dugu. Honek, gaussianeko *.com-ean prozesagauilu kopurua eta memoria egokitzeaz gain, torqueren kolako sarrera fitxategia ere prestatuko du. Lana, exekuzio nodoetan egingo da eta emaitza bertan gorde. Lana jarraitu ahal izateko remote_vi eta remote_molden prestatu ditugu (ikusi beherago). send_gauss erabiltzeko modua honakoa da: send_gauss lana denbora\u00a0 proz_kop &hellip; <a href=\"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/arina_eu\/lanak-bidali\/gaussian-nola-bidali\" class=\"more-link\">Seguir leyendo <span class=\"screen-reader-text\">Gaussian nola bidali<\/span> <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_links_to":"","_links_to_target":""},"categories":[137,68],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1153"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1153"}],"version-history":[{"count":14,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1153\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1161,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1153\/revisions\/1161"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1153"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1153"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1153"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}