Koletara bidaltzeko hiru era daude:<\/p>\n
send_siesta<\/code> komandoa erabiliz.<\/li>\nqsub<\/code> interaktiboan erabiliz.<\/li>\n- Qsub-entzako script arrunt bat sortuz.<\/li>\n<\/ul>\n
send_siesta<\/h1>\n
send_siesta<\/tt> agindua sortu dugu\u00a0Siesta<\/tt> lanak bidaltzeko.\u00a0send_siesta<\/tt> Arina<\/tt>-n egikaritzean, aginduaren sintaxia erakusten da, jarraian laburtzen dugu:<\/strong><\/p>\nsend_siesta JOBNAME NODES PROCS_PER_NODE[property] TIME MEM [\"Other queue options\"]<\/tt><\/pre>\nJOBNAME:<\/tt> Extensiorik gabeko inputaren izena.
\nNODES:<\/tt> Nodo kopurua.
\nPROCS:<\/tt> Prozesadore kopurua.
\nTIME:<\/tt> Eskatutako denbora\u00a0hh:mm:ss<\/tt> formatoan.
\nMEM:<\/tt> Memoria Gb-etan, unitatea adierazi gabe.
\n[\"Other queue options\"]<\/tt> Torqueri aldagai gehiago pasatzeko aukera hematen digu. Dana komatxoen artean adieraziz.<\/p>\n
Adibideak<\/strong>
\njob1 lana, nodo batean eta 4 itaniumb prozesadoretan bidalzteko:<\/p>\nsend_siesta job1 1 4:itaniumb 04:00:00 1<\/pre>\njob2 lana 2 nodo eta bakoitzeko 4 prozesadoretan, 192 ordu eta 8gb-etako memoria eskatuz. Gainera, job2 lana dagoneko kolan dagoen 1234 lanaren odoren sartzea nahi dugu:<\/p>\n
send_siesta job2 2 4 192:00:00 8 ``-W depend=afterany:1234''<\/pre>\njob2 lana 4 nodo 8 prozesadoretan baokitzean bidaltzeko, 200 ordu, eta 15 gb etako RAM memoria eskatuz. Gainera, lana hasi eta bukatzean email bat bidalzteko adierazten diogu esandako email helbidera.<\/p>\n
send_siesta job2 4 8 200:00:00 15 ``-m be -M nire.emaila@ehu.es''<\/pre>\nsend_siesta<\/code> aginduak, lana bidalitako katalogoaren edukia\u00a0\/scratch<\/tt> edo\u00a0\/gscratch<\/tt> -n burutuko du -azken kasua 2 edo nodo gehiago erabiliz gero-. Bukatzean, emaitza bidalitako katalogora kopiatuko du azpikatalogo batera.<\/p>\n <\/p>\n
Qsub interaktiboa<\/h1>\n
Exekutatu<\/p>\n
qsub<\/pre>\neta erantzun galderei.<\/p>\n
qsub tradizionala<\/h1>\n
Sortu pbs-rentzako scrip bat,[intlink id=\u00bb677″ type=\u00bbpost\u00bb] hemen adibideak daude[\/intlink], non siesta exekutatzeko gehitu lerro hau<\/p>\n
\/software\/bin\/siesta\/siesta_mpi < input.fdf > log.out<\/pre>\nnon input fitxeroa gehitu estensio gabe.<\/p>\n
Lanen jarraipena<\/h1>\n\nsend_siesta edo qsub interaktiboa erabiliz bidalitako lanen jarraipena erraztearren, hurrengo tresnak eskura ditu erabiltzaileak:<\/ul>\n<\/ul>\n\n- remote_vi<\/strong><\/dt>\n
- gvim<\/tt> erabiliz, siesta kalkuluaren outputa\u00a0*.out<\/tt> fitxategia irekiko digu.<\/dd>\n
- remote_xmakemol<\/strong><\/dt>\n
- xmakemol<\/tt> erabiliz, siesta kalkuluaren\u00a0*.ANI<\/tt> fitxategia irekiko digu.<\/dd>\n
- remote_qmde<\/strong><\/dt>\n
- xmgrace<\/tt> programarekin Dinamila Molekularra egiten ari den siesta kalkulu beten, energia vs denbora irudikatuko digu.<\/dd>\n<\/dl>\n
Tresna hauen erabilera berdintsua da, agindua eta jarraian aztertzea nahi del lanaren kola identifikatzailea adierazi behar delarik.\u00a0Adibideak 3465 lanarentzako:<\/p>\n
remote_vi 3465\r\nremote_xmakemol 3465\r\nremote_qmde 3465<\/pre>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Nola bidali Siesta Koletara bidaltzeko hiru era daude: send_siesta komandoa erabiliz. qsub interaktiboan erabiliz. Qsub-entzako script arrunt bat sortuz. send_siesta send_siesta agindua sortu dugu\u00a0Siesta lanak bidaltzeko.\u00a0send_siesta Arina-n egikaritzean, aginduaren sintaxia erakusten da, jarraian laburtzen dugu: send_siesta JOBNAME NODES PROCS_PER_NODE[property] TIME MEM [\u00abOther queue options\u00bb] JOBNAME: Extensiorik gabeko inputaren izena. NODES: Nodo kopurua. PROCS: Prozesadore kopurua. … Seguir leyendo Siesta nola bidali<\/span>