Para lanzar al sistema de colas trabajos de Quantum Espresso existe la utilidad send_espresso<\/strong>. Al ejecutarlo, muestra la sintaxis del comando, que se resume a continuaci\u00f3n:<\/p>\n Mandamos Espresso (binario pw.x) con el input job1.in a 1 nodo, 4 procesadores de ese nodo, con un tiempo solicitado de 4 horas y 1 GB de RAM:<\/p>\n Mandamos espresso (car-parrinello) con el input job2.in a 2 nodos, 8 procesadores en cada nodo, con un tiempo solicitado de 192 horas, 8 GB de RAM y que se ejecute despu\u00e9s del trabajo 1234.arina:<\/p>\n Mandamos espresso (binario ph.x) con el input job3.in a 8 nodos y 8 procesadores en cada nodo, con un tiempo solicitado de 200:00:00 horas, 64 GB de RAM (global) y que nos env\u00ede un mensaje de correo al inicio y final del c\u00e1lculo a la direcci\u00f3n especificada.<\/p>\n El comando send_espresso copia el contenido del directorio desde el que se lanza al \/scratch o \/gscratch -si se usan 2 o m\u00e1s nodos. Es all\u00ed donde realiza el c\u00e1lculo.<\/p>\n Los ejecutables de Espresso se encuentran instalados en \/software\/bin\/espresso<\/tt>. Por ejemplo, para ejecutar pw.x en las colas usar:<\/p>\n En la opci\u00f3n send_espresso Para lanzar al sistema de colas trabajos de Quantum Espresso existe la utilidad send_espresso. Al ejecutarlo, muestra la sintaxis del comando, que se resume a continuaci\u00f3n: send_espresso input Executable Nodes Procs_per_node Time Mem [\u00abOtherqueue options\u00bb ] Input Nombre del input de espresso\u00a0sin extensi\u00f3n Executable Nombre del programa de espresso que se quiere usar: pw.x, … Seguir leyendo C\u00f3mo mandar Espresso<\/span> send_espresso input Executable Nodes Procs_per_node Time Mem [``Otherqueue options'' ]<\/pre>\n
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\n Input<\/strong><\/td>\n Nombre del input de espresso\u00a0sin extensi\u00f3n<\/td>\n<\/tr>\n \n Executable<\/strong><\/td>\n Nombre del programa de espresso que se quiere usar: pw.x, ph.x, cp.x,…<\/td>\n<\/tr>\n \n Nodos<\/strong><\/td>\n N\u00famero de nodos a los que se quiere mandar el c\u00e1lculo<\/td>\n<\/tr>\n \n Procs_per_node:<\/strong><\/td>\n N\u00famero de procesadores por nodo<\/td>\n<\/tr>\n \n Time:<\/strong><\/td>\n Tiempo solicitado a la cola, formato hh:mm:ss<\/td>\n<\/tr>\n \n Mem<\/strong><\/td>\n Memoria en GB y sin especificar la unidad<\/td>\n<\/tr>\n \n [\u00abOtras opciones de Torque\u00bb] <\/strong><\/td>\n Existe la posibilidad de pasar m\u00e1s variables al sistema de colas. Ver ejemplos m\u00e1s abajo<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n Ejemplos<\/h3>\n
send_espresso job1 pw.x 2 4 04:00:00 1<\/pre>\n
send_espresso job2 cp.x 2 8 192:00:00 8 ``-W depend=afterany:1234''<\/pre>\n
send_espresso job3 ph.x 8 8 200:00:00 64 ``-m be -M mi.email@ehu.es''<\/pre>\n
C\u00f3mo usar creando tu propio script para Torque<\/h2>\n
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source \/software\/Espresso\/compilervars.sh\n\/software\/Espresso\/bin\/pw.x -npool ncores < input_file > output_file<\/tt><\/pre>\n<\/blockquote>\n
-npool ncores<\/code> hay que sustituir ncores<\/code> por el n\u00famero de cores que se va a usar, esto mejora la velocidad de ejecuci\u00f3n del c\u00e1lculo. Si se solicitan m\u00e1s de un core se ejecuta autom\u00e1ticamente en paralelo.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"