{"id":5653,"date":"2012-01-09T14:12:29","date_gmt":"2012-01-09T12:12:29","guid":{"rendered":"http:\/\/www.ehu.es\/sgi\/?p=5653"},"modified":"2023-09-15T13:33:31","modified_gmt":"2023-09-15T11:33:31","slug":"arina-klusterra-3","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/arina_eu\/baliabide-konputazionalak\/arina-klusterra-3","title":{"rendered":"Arina klusterra"},"content":{"rendered":"<h2>Informazio orokorra<\/h2>\n<h3>Kalkuluarko baliabideen laburpena<\/h3>\n<p>Arinak <strong>3.728\u00a0kalkulu kore<\/strong> ditu 3.664\u00a0Xeon eta 64\u00a0Itanium2 koretan banatuta, nodo bakoitzak 16 eta 512 GB bitarteko\u00a0 memoria duelarik. 4 Xeon nodoek bina Nvidia Tesla txartel dituzte, beste nodo batek bi Nvidia Kepler 20, eta badago beste\u00a0bi Nvidia Kepler 40 txartel dituen bat ere. Hiru eraginkortasun handiko fitxategi sistema daude Lustren oinarrituta 4.2 TBetakoa, 22 TBetakoa eta 40 TBetakoa. Kalkulu nodo guztiak Infiniband latentzia txikiko eta banda zabaleko sarearen bitartzen konektatuta daude.<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" style=\"vertical-align: text-top;\" src=\"http:\/\/www.ehu.es\/sgi\/images\/Ilundua.JPG\" alt=\"Arina UPV\/EHU-ko HPC konputagailua\" width=\"388\" height=\"259\" \/><\/p>\n<h3>Beste baliabideak<\/h3>\n<p>Arina klusterrera konektatzeko 3 zerbitzari erabili daitezke:\u00a0<strong>arina<\/strong> (intanium2), <strong>katramila <\/strong>eta <strong>guinness<\/strong> (xeon), Zerbitzariak ethernet sarea bati medio dago nodoei konektatua. Sare horren bitartez esportatzen da \u00a0<tt>\/home<\/tt> katalogoa nodo guztietara, NFS protokoloa erabiliz. <strong>Gauero katalogo honen segurtasun-kopia egiten da<\/strong> (<tt>\/home)<\/tt>. Nodoren batek<tt>\/home-a<\/tt>n idazten badu, informazioa zerbitzarira bidali behar da NFS protokoloaren (motela) bitartez. Horregatik, ez da komeni kalkuluak egiterakoan direktorio hori erabiltzea, hobe da kalkuluak nodo bakoitzeko tokiko diskoetan egitea. Horretarako, nodoek 36 &#8230; 500 Gb bitarteko \u00a0diskoak dituzte, <tt>\/scratch<\/tt> direktorioan. Ikusi ataleko ilaren sistema medio lanak nodora nola bidali [intlink id=\u00bb68&#8243; type=\u00bbcategory\u00bb] ikusi ilara-sistema.[\/intlink].<\/p>\n<p>3 GB-eko diska kuota dago <tt>\/home-<\/tt>ean erabiltzaile bakoitzeko. Hortik aurrera edukiera fakturatu egingo da. [intlink id=\u00bb71&#8243; type=\u00bbcategory\u00bb]Ikus hemen[\/intlink].<\/p>\n<p>Nodoak ahalmen eta abiadura handiko Infiniband sarea medio daude konektatuta, kalkulua egiterakoan komunikatzeko.<\/p>\n<h2>Xeon nodoen ezaugarriak<\/h2>\n<ul>\n<li>Cluster BullX sistema operatiboa, Red Hat Linux AS 5, AS6 eta AS7.<\/li>\n<li>464 Xeon 5420 prozesadoreak 2.3 GHz-etara, 648 Xeon 5645\u00a0prozesadoreak 2.4 GHz-etara, 630 Xeon 2680v2\u00a0prozesadoreak 2.8 GHz-etara eta 32 Xeon 4620v2\u00a0prozesadorea 2.6 GHz-etara memoria handiko nodoan (512 GB) eta 2.8 GHz-etako baidaurako 1.876\u00a0 Xeon 2680v4 core.<\/li>\n<li>24 eta 512 GB bitarteko \u00a0RAM memoria nodo bakoitzeko .<\/li>\n<li>Infiniband QDR 40 Gb\/s eta FDR 56 GB\/s-etara banda zabalera handiko eta latenzia txikiko sarea.<\/li>\n<li>Konpilatzeko zerbitzari nagusia Guinness eta Katramila.<\/li>\n<\/ul>\n<h3>GPGPUs nodoak<\/h3>\n<p>GPGPU nodoak aurrekoa bezalakoak dira:<\/p>\n<ul>\n<li>Bi nodo bi Tesla 20 C2050 txartelekin, Xeon 5420\u00a0prozesadoreak 2.3 GHz-etara, 24 GB RAM eta bi Infiband QDR txartelak.<\/li>\n<li>Bi nodo bi Tesla 20 C2070 txartelekin, Xeon 5420\u00a0prozesadoreak 2.3 GHz-etara, 24 GB RAM eta bi Infiband QDR txartelak.<\/li>\n<li>Nodo bat bi Tesla 20 \u00a0txartelekin, Xeon 2680v2 prozesadoreak 2.8 GHz-etara, 24 GB RAM eta Infiband FDR txartelak.<\/li>\n<li>Nodo bat bi Tesla 40 \u00a0txartelekin, Xeon 2680v4 \u00a0prozesadoreak 2.8 GHz-etara, 128 GB RAM eta Infiband FDR txartelak.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Nodoen ezaugarri berariazkoak:<\/p>\n<table border=\"1\" cellpadding=\"3\">\n<tbody>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\"><strong>Kopurua<\/strong><\/td>\n<td align=\"LEFT\"><strong>Izena<\/strong><\/td>\n<td align=\"LEFT\"><strong>Mota<\/strong><\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>S.E.<\/strong><\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>Proc.<\/strong><\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>Cores<\/strong><\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>Abiadura<\/strong><\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>RAM<\/strong> (GB)<\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>Diskoa <\/strong>(GB)<\/td>\n<td align=\"RIGHT\"><strong>Etiketa<\/strong><\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Guinness<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Zerbitzaria<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.3 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">12<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">&#8212;<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">&#8212;<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Katramila<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Zerbitzaria<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.6 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">&#8212;<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">&#8212;<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn3<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.3 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">96<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon8,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">17<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn4-cn20<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.3 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">24<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon8,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">36<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn21-56,<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.3 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">48<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon8,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">4<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn57-60<\/td>\n<td align=\"LEFT\">gpu nodo<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">8<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.3 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">24<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">450<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon8,gpu,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">18<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn61-78<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">12<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.4 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">48<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon12,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn79<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">12<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.4 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">96<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon12,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">35<\/td>\n<td align=\"LEFT\">cn80-cn114<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodoa<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH6<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">12<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.4 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">24<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">250<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon12,xeonbull<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">30<\/td>\n<td align=\"LEFT\">n1-n30<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodo<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">20<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.8 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon20,,xeonbull,rh7<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">n31<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodo<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">32<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.6 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">1000<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon20,,xeonbull,rh7<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">n32<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodo GPU<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">20<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.8 GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon20,gpu,,xeonbull,rh7<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">66<\/td>\n<td align=\"LEFT\">n1-nd14,nd16-nd67<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodo<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">28<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.8GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon28,rh7<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"LEFT\">1<\/td>\n<td align=\"LEFT\">nd15<\/td>\n<td align=\"LEFT\">Nodo GPU<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">RH7<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">28<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">2.8GHz<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">128<\/td>\n<td align=\"RIGHT\">xeon,xeon28,rh7,gpu<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<p>Nodo guzti hauek <em>xeon<\/em> etiketa dute. Kalkuluak egiterako garaian, nodo jakinak aukeratzeko erabili daitezke etiketak.<\/p>\n<h2 id=\"ita\">Itanium nodoen ezaugarriak<\/h2>\n<ul>\n<li>Cluster HP Integrity Server Red Hat Linux AS 4 sistema eraginkorrarekin.<\/li>\n<li>128 Itanium2 koreak 1.3 y 1.6 GHz-etara.<\/li>\n<li>4 eta 128 GB \u00a0bitarteko\u00a0RAM memoria\u00a0nodo bakoitzeko.<\/li>\n<li>SDR eta DDR a 20 eta 10 Gb\/s eta latenzia txikiko Infiniband sarea.<\/li>\n<li>Konpilatzeko zerbitzaria: arina.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Ezaugarri berariazkoak:<\/p>\n<table border=\"1\" cellpadding=\"3\">\n<tbody>\n<tr>\n<td align=\"left\">Cantidad<\/td>\n<td align=\"left\">Nombre<\/td>\n<td align=\"left\">Tipo<\/td>\n<td align=\"right\">Proc.<\/td>\n<td align=\"right\">Cores<\/td>\n<td align=\"right\">Velocidad<\/td>\n<td align=\"right\">RAM (GB)<\/td>\n<td align=\"right\">Disco (GB)<\/td>\n<td align=\"right\">Etiqueta<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"left\">1<\/td>\n<td align=\"left\">Arina<\/td>\n<td align=\"left\">Servidor<\/td>\n<td align=\"right\">2<\/td>\n<td align=\"right\">4<\/td>\n<td align=\"right\">1.6 GHz<\/td>\n<td align=\"right\">8<\/td>\n<td align=\"right\">&#8212;<\/td>\n<td align=\"right\">&#8212;<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"left\">4<\/td>\n<td align=\"left\">cndXX<\/td>\n<td align=\"left\">Nodo<\/td>\n<td align=\"right\">4<\/td>\n<td align=\"right\">8<\/td>\n<td align=\"right\">1.6 GHz<\/td>\n<td align=\"right\">16<\/td>\n<td align=\"right\">550<\/td>\n<td align=\"right\">itaniumb<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"left\">10<\/td>\n<td align=\"left\">cndXX<\/td>\n<td align=\"left\">Nodo<\/td>\n<td align=\"right\">4<\/td>\n<td align=\"right\">8<\/td>\n<td align=\"right\">1.6 GHz<\/td>\n<td align=\"right\">32<\/td>\n<td align=\"right\">550<\/td>\n<td align=\"right\">itaniumb<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td align=\"left\">1<\/td>\n<td align=\"left\">cnd43<\/td>\n<td align=\"left\">Nodo<\/td>\n<td align=\"right\">4<\/td>\n<td align=\"right\">8<\/td>\n<td align=\"right\">1.6 GHz<\/td>\n<td align=\"right\">64<\/td>\n<td align=\"right\">550<\/td>\n<td align=\"right\">itaniumb<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<p>Nodo guztiak <em>itanium<\/em> etiketa dute. Kalkuluak egiterako garaian, nodo jakinak aukeratzeko erabili daitezke etiketak. [intlink id=\u00bb68&#8243; type=\u00bbcategory\u00bb] Ikusi ilara-sistema.[\/intlink].<\/p>\n<h2><\/h2>\n<h2>Diska sitemaren ezaugarriak<\/h2>\n<p>Nodo bakoitzak dituen disko lokalez aparte (<tt>\/scratch<\/tt>), Itanium eta Opteron nodoek HP-SFS diska sistema globala dute 4.7 TB-etako tamainarekin (Lustre teknologian oinarrituta dago) eta Xeon prozesagailuek 22 TB-etako Lustre diska sistema bat. Lustre biltegi sistema oso eraginkorra da paraleloan idazten baitu disko askotan.<\/p>\n<ul>\n<li>Bere erabilera kalkuluetan erabiltzen diren aldi baterako fitxeroentzako da.<\/li>\n<li><tt>\/gscratch<\/tt> bezala montatuta dago.<\/li>\n<li>Bakarrik kalkulu nodoetatik idatzi\/irakurri egin daiteke.<\/li>\n<li>Fitxategi sistema bakarra da, hots, nodo guztiak direktorio bera ikusten dute.<\/li>\n<li>Ez dira segurtasun kopiak egiten.<\/li>\n<li>Oso egonkorra da eta erredundantea.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Bere erabilera gomendatzen dugu kasu hauetan<\/p>\n<ul>\n<li>Programak asko idazten edo irakurtzen du.<\/li>\n<li>Fitxeroak oso handiak dira disko localak erabili ahal izateko, gutxi gorabehera 8 GB erabilitako cpu bakoitzagatik.<\/li>\n<li>Kalkulu bateko nodoak fitxero bera erabili behar badute, adibidez MPI lanak zenbait nodoetan.<\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Informazio orokorra Kalkuluarko baliabideen laburpena Arinak 3.728\u00a0kalkulu kore ditu 3.664\u00a0Xeon eta 64\u00a0Itanium2 koretan banatuta, nodo bakoitzak 16 eta 512 GB bitarteko\u00a0 memoria duelarik. 4 Xeon nodoek bina Nvidia Tesla txartel dituzte, beste nodo batek bi Nvidia Kepler 20, eta badago beste\u00a0bi Nvidia Kepler 40 txartel dituen bat ere. Hiru eraginkortasun handiko fitxategi sistema daude Lustren &hellip; <a href=\"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/arina_eu\/baliabide-konputazionalak\/arina-klusterra-3\" class=\"more-link\">Seguir leyendo <span class=\"screen-reader-text\">Arina klusterra<\/span> <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_links_to":"","_links_to_target":""},"categories":[69],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/5653"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=5653"}],"version-history":[{"count":15,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/5653\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":9199,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/5653\/revisions\/9199"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=5653"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=5653"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ehu.eus\/sgi\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=5653"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}