Antropogenética

Práctica O4. Minería de datos II (bases de datos GW). Resultados

1. El patrimonio genético actual de Europa

El origen geográfico de las muestras analizadas se muestra en el mapa de la figura 1.

Figura 1. Origen de las muestras.

El resultado del Análisis de Coordenadas Principales sobre la matriz IBS se muestra en la figura 2. La distribución de los individuos por el gráfico se ajusta a grandes rasgos a su origen geográfico. Así, las poblaciones del sur de Europa se sitúan en el extremo positivo del eje 1 y las poblaciones del norte del continente en el extremo negativo. Asimismo, las poblaciones del oeste se sitúan en la parte superior y las del este en la parte inferior.

Figura 2. Resultado del Análisis de Coordenadas Principales sobre muestras actuales.

2. Los componentes originarios del patrimonio genético europeo
En la figura 3 se muestran los resultados de las muestras de ADN antiguo de cazadores recolectores, neolíticos y jinetes de las estepas junto a los individuos actuales. El gráfico ha girado el eje 2 respecto a la figura anterior. También aparece más condensada la nube de puntos de los europeos actuales, al aparecer otros puntos más alejados.
Los cazadores recolectores aparecen muy distanciados de los europeos actuales. En consecuencia, su contribución al patrimonio genético de las poblaciones europeas actuales habrá sido escasa. Los agricultores de Anatolia y primeros agricultores europeos, situados en el otro extremo, aparecen más próximos, por lo que su influencia habrá sido mayor. Se encuentran particularmente próximos de los Sardos. Sin embargo, son los jinetes de las estepas los que aparecen más próximos a la nube de puntos representativa de los europeos actuales, por lo que su influencia habrá sido máxima, particularmente en relación a las poblaciones del norte de Europa.

Figura 3. Resultado del Análisis de Coordenadas Principales sobre muestras actuales y de ADN antiguo.

3. Análisis del mestizaje
Se han realizado dos análisis Structure con la base de datos de individuos actuales y de ADN antiguo. En el gráfico de la figura 4 se muestra el resultado para k=2. Se diferencian los componentes Paleolítio y Neolítico claramente,apareciendo los individuos de las estepas con una proporción mayoritariamente paleolítica. La población con un componente mayor del Neolítico es claramente la de Cerdeña.

Figura 4 . Análisis Structure con k=2.

Con k=3 (figura 5) se mantiene la diferencia entre componente Paleolítico y componente Neolítico, pero aparece un nuevo componente difícil de interpretar. 

Figura 5 . Análisis Structure con k=3.

4. El devenir de la Península Ibérica
La figura 6 muestra el resultado del Análisis de Coordenadas Principales realizado sobre la base de datos que añade un conjunto de restos de diferentes antigüedades de la Península Ibérica. El eje de ordenadas de nuevo se encuentra girado respecto a la figura 3.
Los individuos con un origen Mesolítico se encuentran próximos a los cazadores recolectores europeos, como corresponde a una situación anterior al comienzo del Neolítico. Por ello, se encuentran alejados de los actuales habitantes de la Península, de modo que habrán aportado poco a su actual patrimonio genético.
Los representantes del Neolítico y el Calcolítico se encuentran próximos a los neolíticos de Anatolia y primeros agricultores europeos. Son, sin duda, en buena medida descendientes de ellos. Sin embargo, se encuentran a una cierta distancia de los españoles actuales.
Es a partir de la Edad de Bronce y la Edad de Hierro cuando comienzan a aparecer cerca de los actuales residentes de la Península, influídos probablemente por la llegada de los individuos de las estepas, que aparecen también dentro del área de dispersión de los actuales europeos. Es posible por tanto, que esta sea la oleada migratoria más influyente en la configuración del patrimonio genético de Europa y la Península Ibérica en la actualidad.
Finalmente, los habitantes de la Península en el medievo son ya definitivamente indistinguibles de los habitantes actuales.

Figura 6. Resultado del Análisis de Coordenadas Principales sobre muestras actuales, de ADN antiguo y de la Península Ibérica.

@Mikel Iriondo, Jose A. Peña, 2023 Universidad del País Vasco (UPV/EHU)