Genetika Langileak

Jose Antonio Rodriguez Perez

Aurkezpena

Irudia

Irakasle-profila

2007tik aurrera Medikuntza eta Odontologia Fakultateko irakaslea naiz Euskal Herriko Unibertsitatean (UPV/EHU). Nire dozentzia ondoko irakasgaietan ematen dut: Medical Genetics, Ikerketa Biomedikorako Sarrera eta Ikerketa Proiektua. Horrez gain, graduondoko dozentziari dagokionez, Molecular Bases of Cell Proliferation, Differentiation and Death irakasgaia eman eta kordinatzen dut, UPV/EHUketa Cantabria Unibertsitateak batera eskeintzen duten Biologia Molekularra eta Biomedikuntza Masterrean.

UPV/EHUra etorri aurretik (2001-2006) Vrije Universiteit Amsterdam-go Onkologia Medikuko sailean irakatsi nuen. Bertan Onkologia Masterrean parte hartu nuen eta ikasleen lanak zuzendu nituen.

Ikertzaile-profila

1998an Euskal Herriko Unibertsitatean (UPV/EHU) doktore gradua lortu nuen "Factores genéticos en la carcinogénesis cervical inducida por el virus HPV" tesiarekin. Tesia bukatu ostean Eusko Jaurlaritzaren Doktorego osteko beka lortuta Sydney-ko Westmead Institute for Cancer Research-era joan nintzen ikertzera. Bederatzi urtez minbizaren transformazioaren inguruko prozezu molekularrak ikertzen aritu nintzen hainbat herritako ikerketa zentruetan, Herbeheretan, EEBBn eta Australian. 50 ikerketa artikulu baino gehiago argitaratu ditut  eta 4 tesi zuzendu ditut eta beste bi zuzentzen ari naiz.

2007 urtean UPV/EHUra bueltatu eta gero Euskadiko Zientzia eta Teknologia Sistemara batu nintzen. MICINN eta Eusko Jaurlaritzako Saiotek eta Etortek programak eta unibertsitateko proiektuei esker minbiziaren prozesu molekularrak aztertzen dituen ikerketa lerro bat garatu dut. Gure lana proteinen ubikitinazioan eta garraio nukleozioplasmikoan zentratzen da. Gure helburua minbiziaren osaketarako zuzendutako terapia berriak garatzea da.

UPV/EHUko Agente Biologikoen eta Genetikoki Eraldatutako Organismoen Ikerketetarako Etika Batzordeko kidea, eta Asociación Española de Investigación sobre el Cáncer (ASEICA) elkarteko juntakidea naiz.

Ikerketa talde nazional nahiz internazionalekin lankidetzan dihardut eta gure taldea ‘European COST Action (Proteastasis)' delakoaren parte da. Talde hau berriki jarri da martxan eta ubikitinazioarekin erlazionaturiko prozesuen azterketan parte hartzen duten ikerketa taldeez osatuta dago.

Azken 5 urteetako argitalpenak

  • Prieto G, Fullaondo A, Rodriguez JA. Prediction of nuclear export signals using weighted regular expressions (Wregex). Bioinformatics in press 2014; doi: 10.1093/bioinformatics/btu016
  • Laresgoiti U, Apraiz A, Olea M, Mitxelena J, Osinalde N, Rodriguez JA, Fullaondo A, Zubiaga AM. E2F2 and CREB cooperatively regulate transcriptional activity of cell cycle genes. Nucleic Acids Res. 2013 Sep 12. [Epub ahead of print]
  • Osinalde N, Olea M, Mitxelena J, Aloria K, Rodriguez JA, Fullaondo A, Arizmendi JM, Zubiaga AM. The nuclear protein ALY binds to and modulates the activity of transcription factor E2F2. Mol Cell Proteomics. 12(5), pp. 1087-98. (2013)
  • García-Santisteban I, Peters GJ, Giovannetti G, Rodríguez JA. USP1 deubiquitinase: cellular functions, regulatory mechanisms and emerging potential as target in cancer therapy. Mol. Cancer 12:91 (2013)
  • Garcia-Santisteban I, Zorroza K, Rodriguez JA. Two nuclear localization signals in USP1 mediate nuclear import of the USP1/UAF1 complex. PlosONE e38570. (2012)
  • Crovetto MA, Whyte J, Sarasola E, Rodriguez JA, García-Barcina MJ. Absence of COCH gene mutations in patients with superior semicircular canal dehiscence. Am. J. Med. Genet. Part A 158A:251–253. (2012)
  • Garcia-Santisteban I, Bañuelos S, Rodriguez JA. A global survey of CRM1-dependent nuclear export sequences in the human deubiquitinase family. Biochem. J. 441: 209-217 (2012).
  • Sarasola E, Rodriguez JA, Garrote E, Aristegui J, García-Barcina MJ. A short in-frame deletion in NTRK1 tyrosine kinase domain caused by a novel splice site mutation in a patient with congenital insensitivity to pain with anhidrosis. BMC Med. Genet. 12:86 (2011).
  • Checinska A, Giaccone G, Rodriguez JA, Kruyt FAE, Jimenez CR. Comparative proteomics analysis of caspase-9-protein complexes in untreated and cytochrome c/ dATP stimulated lysates of NSCLC cells. J. Proteom. 72: 575-585 (2009).
  • Gallegos Ruiz MI, Floor K, Steinberg SM, Grünberg K, Thunnissen FBJM, Belien JAM, Meijer GA, Peters GJ, Smit EF, Rodriguez JA and Giaccone G. Combined assessment of EGFR pathway-related molecular markers and prognosis of NSCLC patients. Br J Cancer 100: 145-152 (2009)
  • Zucali PA, Gallegos Ruiz MI, Giovannetti E, Destro A, Varella-Garcia M, Floor K, Ceresoli GL, Rodriguez JA, Garassino I, Comoglio P, Roncalli M, Santoro A, Giaccone G.  Role of cMET expression in non-small-cell lung cancer patients treated with EGFR tyrosine kinase inhibitors. Ann. Oncol., 19: 1605-1612 (2008)
  • Gallegos Ruiz MI, Floor K, Roepman P, Rodriguez JA, Meijer GA, Mooi WJ, Jassem E, Niklinski J, Muley T, van Zandwijk N, Smit EF, Beebe K, Neckers L, Ylstra B, Giaccone G. Integration of gene dosage and gene expression in Non Small Cell Lung Cancer; identification of HSP90 as potential target. PLoS ONE 3(3): e0001722. doi:10.1371/journal.pone.0001722 (2008)
  • Giovannetti E, Lemos C, Tekle C, Smid K, Nannizzi S, Rodriguez JA, Ricciardi S, Danesi R, Giaccone G, Peters GJ. Molecular mechanisms underlying the synergistic interaction of erlotinib, an epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase inhibitor, with the multitargeted antifolate pemetrexed in non-small-cell lung cancer cells. Mol. Pharmacol., 73: 1290-1300  (2008)
  • Barlesi F, Giaccone G, Gallegos-Ruiz MI, Span SW, Lefesvre P, Kruyt FAE, Rodriguez JA. Genotype analysis of the VNTR polymorphism in the SMYD3 histone methyltransferase gene: lack of correlation with the level of of histone H3 methylation in NSCLC tissues or with the risk of NSCLC. Int.J. Cancer, 122: 1441-1442 (2008)