Gamess Lanak Nola Bidali

Informazio Orokorra

12 JAN 2009 (R1)  bertsioa dago instalatuta.

send_gamess Agindua

send_gamess agindua erabiltzea gomendatze dugu Gamess lanak bidaltzeko. Este comando preparará script de TORQUE y lo enviará a la cola. El el *.log se mantendrá en el /scratch del nodo de remoto.

send_gamess nola erabili

send_gamess trabajo num_nodos num_proc tiempo MEM (opciones del TORQUE)

non:

trabajo: gamess programaren sarrera fitxategia da extensiorik gabe.
cola o tiempo: Kolaren izena edo denbora adierazi daitezke atal honetan. Denboraren formatoa hh:mm:ss izan behar da.
num_nodos: Erabiltzea nahi den nodo kopurua.
num_proc: el número de procesadores que se quiere usar. Máximo 8. Es posible añadir propiedades de los nodos, por ejemplo 8:itaniumb
mem: La memoria en Gb. Si no se especifica, el valor por defecto es nproc*900mb.
(opciones del TORQUE) Opciones avanzadas que se quieren pasar al gestros de colas TORQUE. Más información sobre estas opciones

Adibideak:

send_gamess ti3_cor 1 8 90:00:00 4

Enviará el trabajo ti3_cor en 1 nodo, con 8 procesadores, 90 horas de duración y 4Gb de memoria RAM.

send_gamess ti3_cor 4 8 190:00:00 16
Enviará el trabajo ti3_cor en 4 nodos, y 8 procs en cada nodo, solicitando 190 horas y 16gb de memoria RAM.

send_gamess ti3_cor 4 4:itanium4 23:00:00 4 ``-m be -M niris@ehu.es -W depend=afterany:4827''

Enviará el trabajo ti3_cor en 4 nodos con 4 procesadoeres que tengan la propiedad itanium4, 4gb de RAM. El tiempo solicitado son 23 horas, y nos enviará un email al inicio y final del cálculo. Por otra parte este trabajo no empezará hasta que termine el trabajo 4827.

Kalkulua jarraitzeko

Para poder visualizarlo, tenemos disponibles las herramientas

Para relaizar el seguimiento del trabajo existen las herramietas remote_vi y remote_molden. Su uso el el siguiente:

remote_vi 2341
o
remote_vi 2341.arinab

donde 2341(/.arinab) es el identificador del trabajo en la cola.

qsub interaktiboa

También se puede lanzar gamess con el comando qsub interactivo.

Kategoria: F.A.Q. @eu, Lanak Bidaltzeko. Gorde lotura.