Cómo mandar Qsite

send_qsite

send_qsite JOBNAME DONES PROCS_PER_NODE[property] TIME MEM [``Other queue options'']

  • JOBNAME: Nombre del input de siesta sin extensión.
  • NODES: Número de nodos.
  • PROCS: Número de procesadores.
  • TIME: Tiempo solicitado a la cola, formato hh:mm:ss.
  • MEM: memoria en Gb y sin especificar la unidad.
  • [«Other queue options»] Existe la posibilidad de pasar más variables al sistema de colas. Más información sobre estas opciones

Ejemplos:
Mandamos Jaguar con el input job1 a 1 nodo, 4 procesadores de ese nodo tipo itaniumb, con un tiempo solicitado de 4 horas y 1 GB de RAM:

  • send_qsite job1 1 4:itaniumb 04:00:00 1

Mandamos qsite con el input job3 a 2 nodos, 4 procesadores en cada nodo, con un tiempo solicitado de 60 horas, 8 GB de RAM y que se ejecute después del trabajo 1234.arinab:

  • send_qsite job3 2 4 60:00:00 8 ``-W depend=afterany:1234''

Mandamos qsite con el input job3 a 1 nodos y 4 procesadores en cada nodo, con un tiempo solicitado de 500 horas, 15 GB de RAM y que nos envíe un email al inicio y final del cálculo a la direción especificada.

  • send_qsite job3 1 4 400:00:00 15 ``-m be -M mi.email@ehu.es''

qsub interactivo

qsub

y seguir la instruciones.
La versión de QSITE disponible es la 5. Los manuales están disponibles en arina:/software/schrodinger/docs.

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