HPC @UPV/EHU

La SPRI convoca la ayudas “Basque Industry 4.0: Transferencia de Tecnología de I+D en TEICs Aplicadas a la Fabricación Avanzada”, para llevar a cabo proyectos de Transferencia de Tecnología de “proveedores tecnológicos” (como, por ejemplo, la UPV/EHU) hacia empresas industriales manufactureras aplicadas a la Fabricación Avanzada. El programa está dotado de 2.1 millones de €.

Los Proyectos deberán estar relacionados con alguna de las siguientes áreas, dentro del ámbito de los CPSs (Cyber Physical Systems) aplicados a la fabricación avanzada:

• Ciberseguridad y comunicaciones industriales.
• Cloud Computing.
• Big Data – Analítica Avanzada y Business Intelligence.
• Robótica.
• Proyectos de realidad aumentada.
• Proyecto de visión artificial.
• Sensórica.
• Diseño y fabricación aditiva en materiales metálicos.

Más información en los enlaces:

Toda la información en Basque Industry 4.0: Transferencia de Tecnología de I+D en TEICs Aplicadas a la Fabricación Avanzada

Presentación en pdf con información detallada.

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El Servicio General de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico) ha renovado la licencia corporativa para la UPV/EHU del programa de dinámica de fluidos (CFD) STARCCM+ para el año 2015.

Estas licencias pueden usarse en los clusters de cálculo del Servicio de Cálculo Científico de la UPV/EHU. También pueden solicitarse licencias personales para uso en los ordenadores de los investigadores, para ello es necesario realizar una solicitud a los técnicos del Servicio de Cálculo Científico.

Características de la licencia

La licencia será valida para un año y permite el uso de todos los procesadores del ordenador. La licencia se puede usar en ordenadores corporativos de la UPV/EHU o  a través de VPN.

Se dispone de licencia de docencia que permite la instalación de STARCCM+ en las aulas de docencia de la UPV/EHU para impartir cursos y asignaturas.

Tarifa

El uso de STARCCM+ en aulas para docencia de cursos y asignaturas es gratuito.

El uso de STARCCM+ en el cluster de cálculo Arina de la UPV/EHU es gratuito y solo se factura el uso de horas de cálculo según la tarifa estándar del Servicio.

Las tarifas que se aplicarán para la instalación de licencias en los ordenadores personales de los investigadores se detalla a continuación.

• Para un PC y menos de 100 horas.

Se pueden solicitar licencias gratuitas para probar el programa, realizar tareas relacionadas con la docencia o proyectos de fin de master. Estas licencias estarán restringidas a PCs de la UPV/EHU y tendrán un máximo de 100 horas de uso. No se dará acceso por VPN.

• Ordenadores personales.

Las licencias destinadas a su instalación en ordenadores corporativos personales cuyo uso va a ser de más de 100 horas se facturará a 140 € por equipo.

Se pueden solicitar acceso a equipos por VPN. Los recursos a traveś de VPN son muy limitados, por ello la licencia se renovará trimestralmente con un costo adicional de 35 € por licencia y trimestre.

• Estaciones de trabajo y servidores.

Las licencias destinadas a su instalación en estaciones de trabajo y servidores (procesadores xeon o similares) tendrá un coste de 45 € por core.

Más información

• Para más información se puede poner en contacto con los técnicos del Servicio de Cálculo Científico.

• Página web del Servicio General de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico).

• Página web de STARCCM+ en el Servicio de Cálculo Científico.

• Página web CD-Adapco, proveedor del software.

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The CEES school aims to introduce, describe and discuss the theory and applications of computational methods and tools for the study of the electronic structure of excited states in a variety of physical systems: molecules, molecular aggregates, complex systems, nanoclusters and nanoparticles, polymers and solids. The school will be taught at the postgraduate level and is specially addressed to PhD students and postdoctoral researchers with a background in electronic structure theory and its application within the quantum chemistry and/or physics fields.

The school will take place from September 1 to September 4 2015,  in San Sebastian – Donostia, at the Palacio de Miramar, located just in front of the La Concha’s bay.

Subjects

Lecturers

More information

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R es un potente programa de estadística libre gratuito y multiplataforma. El curso se llevará a cabo en la Facultad de Ciencia y Tecnología de Leioa los días 10, 12 y 17 de Febrero.

Datos del curso

Objetivo

Adquirir destreza en el uso del programa R a la hora de llevar a cabo análisis estadísticos y figuras.

Agenda

Martes 10 de Febrero

15:30:-19:00: Presentación general del programa R: instalación denecesarias y funcionamiento general.

17:30-19:00: Estadística descriptiva y creación de figuras.

Jueves 12 de Febrero

15:30:-19:00: Estadística paramétrica y no paramétrica en R.

17:30-19:00: Estadística multivariante (MANOVA, ACP y MDS).

Martes 17 de Febrero
17:30-19:00: Se trabajarán en R datos que traigan los alumnos.

Inscripciones

Inscripciones en el Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi. 15 plazas como máximo. Precios consultar la información completa en el link del curso, al final.

Profesor

Dr. Aitor Larrañaga Arrizabalaga. Departamento de Biología Vegetal y Ecología, UPV/EHU

Lugar

Aula informática de la Facultad de Ciencia y Tecnología del campus de Leioa de la UPV/EHU.

Mas información

Más detalles sobre el curso en este link del Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi.

Sobre el programa R.

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La UPV/EHU oferta el nuevo servicio de almacenamiento masivo en red ehuStorage para cubrir necesidades de la investigación y la universidad en general. El servicio se ha creado en vista de la creciente demanda de las necesidades de grandes cantidades de disco, mayormente por parte de la investigación.

Cómo funciona

El sistema es muy cómodo y sencillo. La universidad ha instalado un sistema relativamente complejo de almacenamiento en sus instalaciones, no es almacenamiento externo a la UPV/EHU en “la nube”, pero toda esta complejidad es transparente al investigador. Una vez realizada y admitida la solicitud en este almacenamiento masivo se asigna este espacio de disco en este sistema al investigador, espacio al que solo él tendrá acceso. Para acceder al disco el investigador sólo tiene que configurarlo en su ordenador (se lo podrá hacer el servicio de atención al usuario CAU) y accederá al mismo a través de la red. Cuando encendamos el ordenador se verá automáticamente como un disco más. Los técnicos podrán informarnos sobre los diferentes métodos de configurarlo según sea nuestro ordenador un PC o servidor y del sistema operativo que usemos.

Seguridad

La información se guarda en servidores en la UPV/EHU por lo que la información nunca sale de la UPV/EHU. Para acceder a este almacenamiento es necesario estar en la red de la universidad, bien porque el ordenador está físicamente en la misma o porque el equipo se ha conectado a la misma desde el exterior a través de VPN.

El sistema es tremendamente seguro ante fallos de hardware. Para comenzar toda la información está duplicada en dos sistemas gemelos situados en edificios diferentes. Uno de estos sistemas gemelos podría ser destruido totalmente y la información permanecería intacta en el otro. Además, cada uno de ellos posee elementos redundantes para que la rotura de discos, servidores, elementos de red, etc. no produzca una perdida de servicio ni de información.

No obstante, uno de los objetivos del proyecto es que tuviese un coste asequible, por lo que no se ha incluido un sistema de copia de seguridad. Es decir, si el investigador accidentalmente borra información esta no es recuperable. Se espera que en futuras versiones del software empleado por el sistema se incluyan los “snapshots” que permiten la recuperación de información borrada unos días tras el suceso.

Para qué es y para qué no es

El sistema se ha creado para satisfacer necesidades de almacenamiento masivo, como copias de seguridad y almacenamiento de datos, pero no necesidades de rendimiento. Es decir, en estos discos se pueden guardar gran cantidad de datos e incluso se puede trabajar sobre ellos en condiciones normales, pero no ha sido diseñado para requerimientos de gran velocidad de lectura y escritura para hacer un procesamiento intensivo de los datos. Primero, porque ello supondría un gran coste adicional, y segundo, porque a parte de los límites que tienen los propios servidores del almacenamiento están los de la red de datos, el ancho de banda y latencia de la misma que es la suma de todos los que elementos que los datos han de atravesar en su viaje desde los servidores hasta el equipo del investigador. Evidentemente va a ser más lento que un disco local de nuestro PC, pero nos va a permitir trabajar con normalidad. La excepción es el caso de que necesitemos realizar operaciones de escritura y lectura constantemente. Para este tipo de proceso de datos el Servicio de Cálculo Científico IZO-SGI tiene sistemas de almacenamiento hasta 100 veces más rápidos. Los técnicos tanto del CAU como del IZO-SGI podrán asesoraros al respecto.

Almacenamiento masivo en el Servicio de Cálculo Científico IZO-SGI

El Servicio de Cálculo Científico IZO-SGI tiene su propia instancia de este almacenamiento masivo en su cluster Arina a disposición de los investigadores. Así mismo e incluso más interesante, los investigadores pueden configurar sus instancias de almacenamiento masivo en Arina, simultáneamente a tenerla en sus propios equipos.

Más información

El servicio ehuStorage es proporcionado por la Vicegerencia de las TICs y las solicitudes han de realizarse a través del formulario correspondiente. Toda la información completa en esta web. Por ahora es un servicio gratuito pero no se descarta cobrarlo en un futuro.

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The UPV/EHU offers ehuStorage a new massive storage system. The service has been setup due to the massive disk demand, mainly  from the researchers.

How it works

The system is simple, from the end user point of view. However, technically the university has a set up complex file system, which is not cloud storage but local storage. Once the request of this storage space is made to the university and accepted, the space is assigned to the researcher who is the only one that can access it. To access the virtual disk the researcher has to configure it on its own computer (it can be done by the assistance of the CAU service to the user) and access it across the network. Hereafter when we power on the computer, it will automatically mount the disk. Technicians from UPV/EHU can inform you about the different methods to configure your computer depending on its characteristics.

Security

The information is stored on servers at the UPV/EHU, so the information never leaves the UPV/EHU. To access this storage, you must be in the university network, either using a computer that is physically on the university or using VPN if you are outside.

The system is extremely secure against hardware failures. Firstable, all information is duplicated in twin systems located in different buildings. One of these twin systems could be completely destroyed and information will still remain intact in the other one. In addition, different elements like disks, servers, network devices, etc. are redundant so the failure of some of them will not cause a loss of service or information.

However, one of the objectives of the project was to had an affordable cost, so it does not include a backup system. That is, if the researcher accidentally deletes information, it is not recoverable. It is expected that future versions of the software used by the system will include “snapshots” that allow information retrieval few days after it was deleted.

What it should be used for and what it should not be used for

The system is adequate to store large amount of that, like backups and scientific data, but not for high performance data access. That is, the stored data can be accessed and work on them under normal conditions, but has not been designed for requirements of high-speed read and write operations like intensive data processing. First, because this will require significant additional cost, and second, because in addition to the limits imposed on storage servers themselves there are also the limits imposed by the network, i.e., the bandwidth and latency of all the network devices the data must pass through on its journey from servers to the researcher computers. Obviously, it will be slower than a local drive of your PC, but it will allow to work normally. The exception is the case when you need to perform intensive write or read operations. For this type of data processing Scientific Computing Service IZO-SGI has storage systems 100 times faster. Technicians both CAU and the IZO-SGI may inform you about it.

Mass Storage Service IZO-SGI Scientific Computing

The Scientific Computing Service IZO-SGI has its own instance of this ehuStorage on our cluster Arina available to researchers. And even more interesting, researchers can configure its own instances of ehuStorage simultaneously in Arina and on it own computers.

More information

The ehuStorage service is provided by the ICT service (CIDIR) and applications must be made through the appropriate form. The complete information is on this web. Currently it is a free service but it can has a cost in the future.

Ehustorage service web page

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UPV/EHUk, ikerkuntza eta unibertsitatearen beharrak asetzeko, sarearen bitartez atzitu daiteken edukiera handiko memoria edo disko zerbitzu berri bat martxan jarri berri du. Datuak gordetzeko (batez ere ikerkuntzaren arolokoak) beharra gero eta handiagoa izanik, Zerbitzu hau sortu da.

Nola funtzionatzen du

Sistema erabiltzailearen ikuspuntutik, erabiltzeko oso erraza eta erosoa da. Baina oinarrian, biltegiratze sistema nahiko konplexua de Unibertsiatetan bere instalazioetan eraiki duena, ez da kanpoko edo “odeian” dagoen biltegi bat. Erabiltzailearentzat ordea, konplexutasun hau estalita dago. Behin eta datua gordetzeko UPV/EHU-ri eskaera egin eta berau onartzen denan,  almazenamendua esleitzen zaio ikertzaileari, espazio hori beste inork atzitu ezingo dituelarik. Ikertzaileak almazenamendua atzitzeko bere ordenagailua konfiguratu beharko du noski (EAZ/CAUk ere egin ahal dio) eta sarearen bitartez konektatuko da biltegiratze berrira. Ordenagailua piztearkoan almazenamendu hau beste disko bat bezala agertuko da. EAZ/CAU-k ere aholkatuko ditu ikertzaileak konfiguratzeko dauden era desberdinetatik ikertzailearentzat eraginkorrena zein den adieraziz.

Segurtasuna

Datuak UPV/EHUren zerbitzarietan gordetzen dira eta ez dira beraz, unibertsitateti inoiz ateratzen. Datuak atzikitzeko UPV/EHUren sarean egon behar da, UPV/EHU-tik kanpo egonda, VPN erabili behar delarik.

Sistema oso segurua da hardware matxuren aurrean. Hasteko, informazio guztia bikoiztuta dago bi sistema bikietan eta bi eraikin desberdinetan. Nahiz eta horietako sistema bat guztiz suntsitua izan, bestea mantentzen ditu zerbitzua eta datuak. Gainera, sistema bakoitzak elementu erredundanteak ditu (diskoak, sare elementuak, etab.) eta baten batek kale egiteak ez dauka eraginik erabiltzaileean aldean.

Hala ere kostua onargarria edukitzeko, ez dauka segurtasun kopiarik. Hots, erabiltzaileak nahi gabe datuak ezabatuz gero ezingo dira hauek berreskuratu. Softwarearen etorkizuneko bertsiotan “snapshot” direakoak edukitzea espero da, orduan nahi gabe ezabatutako informazioa egun batzutan zehar berreskuragarria izango da.

Zertarako da eta zertarako ez

Sistema datu kantitate handiak metatzeko sortu da, segurtasun kopiak edo ikerkuntzako datuak adibidez, baina ez eraginkortasun altua eskaintzeko. Disko hauetan datu asko gorde daitezke eta horien gainean era arruntetan lan egin, baina ez da diseinatuta izan datuak abiadura handiarekin irakurri edo idatzi ahal izateko. Alde batetik kostu oso handia suposatuko lukeelako eta bestetik biltegiratze zerbitzari hauek eman dezaketen errendimenduaren gainetik, sareak ezartzen dituen mugak zorrotzagoak daudelako. Izan ere, datuek saretik egiten duten bidean,  zeharkatzen dituzten elementu guztien banda zabalera eta latentzia jasan behar dute. Memoria hau gure PCko disko bat baino mantsoagoa izango da, baina normaltasunarekin lan egin ahalko dugu. Salbuespena, datuak prozesatzeko asko irakurri eta idatzi behar baditugu izango da, prozesamendu mota honentzako IZO-SGI Kalkulu Zientifikoko  Zerbitzuak almazenamendu bereziak ditu 100 aldiz azkarragoak. Bai IZO-SGIk bai CAUko teknikariak aholkatu ahalko dizuete honi buruz.

Almazenamendu masiboa IZO-SGI Kalkulo Zientifikoko Zerbitzuan

IZO-SGI Kalkulu Zientifikoko  Zerbitzuak, erabiltzaileen esku,  ehuStorageko bere adar propioa dauka Arina klusterrean. Gainera aukera ematen zaie ikertzaileei beraiek izan dezaketen ehuStorage almazenamendua Arinan konfiguratzeko eta horrela, bai Arinan zein  bere PC-etatik datuak zuzenean atzitzeko aukera izango dute.

Informazio gehigo

EhuStorage zerbitzuak IKT gerentziaordea ematen du eta eskaerak beraiei zuzendu behar dira web orrialde honen bitartez. Momentuz doako zerbitzua da, baina ez da baztertzen etorkizun batean ordaindu behar izatea.

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El curso PATC de programación en CUDA que se dará en Barcelona y pretende proporcionar conocimientos sobre programación en arquitecturas masivamente paralelas como GPUs (Nvidia y AMD) o  coprocesadores (Intel Phi).

Dónde y cuándo

El curso lo ofrece el CUDA Center of Excellence (CCOE) concedido por Nvidia del Barcelona Supercomputing Center y la Universitat Politecnica de Catalunya en sesiones de mañana y tarde los entre los días 1 y 5 de Junio de 2015 en el Barcelona Supercomputing Center.

Objetivos

Proporcionar conocimiento y práctica sobre programación en arquitecturas masivamente paralelas como GPUs (Nvidia y AMD) o  coprocesadores (Phi). La programación de estos dispositivos requiere de conocimiento sobre principios de paralelización, modelos de paralelismo y comunicación, así como sobre los límites de las propias arquitecturas. El curso está orientado a principiantes que deseen desarrollar aplicaciones para estos procesadores.

 Agenda

Day 1 – 2nd June, 2015
09:00h The GPU hardware: Many-core Nvidia developments
11:15h CUDA Programming: Threads, blocks, kernels, grids
14:00h CUDA Tools: Compiling, debugging, profiling, occupancy calculator
16:15h CUDA Examples: VectorAdd, ReverseArray, Matrix Multiply
18.00h Adjourn

Day 2 – 3th June, 2015
09:00h Inside Kepler
11:15h Optimizing GPU codes on Kepler using CUDA 5.0
14:00h Lab: Getting Started Guide (PATC)
14:30h Lab: Vector Addition
16:15h Lab: Simple Matrix-Matrix Multiplication
18.00h Adjourn

Day 3 – 4th June, 2015
09:00h Future Nvidia designs: Maxwell, Pascal, Stacked DRAM
11:15h Programming with CUDA 6.0 and unified memory
14:00h Lab: Tiled 7-point 3D Stencil
16:15h Lab: Tiled Matrix-Matrix Multiplication
18.00h Adjourn

Day 4 – 5th June, 2015
09:00h Atomics and Histograming14:30h Lab: Vector Addition
11:15h Reductions
14:00h Lab: Histogramming
16:15h Lab: Vector Reduction
18.00h Adjourn

Day 5 – 6th June, 2015
09:00h Prefix Scan
11:15h CUDA Streams
14:00h Lab: Prefix scan
18.00h Adjourn

Más información

La información completa del curso y registro en la página web del curso:

http://www.bsc.es/marenostrum-support-services/hpc-education-and-training/patc-training/2015-1-5-jun-introduction-cuda

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Curso que se llevará a cabo en Bilbao los días 10 y 11 de Octubre y que puede ser un buen complemento con el curso sobre el software R que se dará también a principios de Octubre.

Datos del curso

Objetivo

Implementar y desarrollar las diferentes herramientas estadísticas y multivariantes en el ámbito biológico.

Agenda

Martes 10 de Octubre

16:00:-20:00: Análisis estadísticos, análisis descriptivo o univariante, ejercicios prácticos y análisis multivalentes.

Martes 11 de Octubre

16:00:-20:00: Programa SPSS, análisis de Componentes Principales, Multidimensional scaling, otros software libres aplicados a genética de poblaciones, evaluación y clausura del curso.

Inscripciones

Inscripciones en el Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi. 15 plazas como máximo. Precios consultar la información completa en el link del curso, al final.

Profesor

Dr. Montse Hervella. Dpto. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal. Fac. Ciencia y Tecnología (UPV/EHU)

Lugar

Euskadiko Biologoen Elkargo Ofiziala – Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi
Licenciado Poza, 31-5o-Dpto. 1.
48011 Bilbao
 944276251 : 944276729
cobeuskadi@cobeuskadi.es
www.cobeuskadi.es

Mas información

Más detalles sobre el curso en este link del Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi.

Más detalles sobre el  Curso de estadística con R en Bilbao.

Sobre el programa R.

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R es un potente programa de estadística libre gratuito y multiplataforma. El curso se llevará a cabo en Bilbao los días 7 y 14 de Octubre.

Datos del curso

Objetivo

Adquirir destreza en el uso del programa R a la hora de llevar a cabo análisis estadísticos y figuras.

Agenda

Martes 7 de Octrubre

15:30:-17:30: Presentación general del programa R: instalación denecesarias y funcionamiento general.

17:30-19:30: Estadística descriptiva y creación de figuras.

Martes 14 de Octrubre

15:30:-17:30: Estadística paramétrica y no paramétrica en R.

17:30-19:30: Estadística multivariante (MANOVA, ACP y MDS).
*Para el segundo día los alumnos podrán traer datos propios para trabajar con ellos.

Inscripciones

Inscripciones en el Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi. 15 plazas como máximo. Precios consultar la información completa en el link del curso, al final.

Profesor

Dr. Aitor Larrañaga Arrizabalaga. Departamento de Biología Vegetal y Ecología, UPV/EHU

Lugar

Euskadiko Biologoen Elkargo Ofiziala – Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi
Licenciado Poza, 31-5o-Dpto. 1.
48011 Bilbao
 944276251 : 944276729
cobeuskadi@cobeuskadi.es
www.cobeuskadi.es

Mas información

Más detalles sobre el curso en este link del Colegio Oficial de Biólogos de Euskadi.

Sobre el programa R.

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