Archivo por días: septiembre 14, 2010

Coin-or

Información general

1.7.5 version. The Computational Infrastructure for Operations Research (COIN-OR**, or simply COIN) project is an initiative to spur the development of open-source software for the operations research community. Se ha compilado incluyendo [intlink id=»5232″ type=»post»]CPLEX[/intlink].

Cómo usar

Los ejecutables blis, cbc, clp, OSSolverService y symphony se encuentran instalados en /software/bin/CoinAll. Para usar, por ejemplo clp ejecutar en los scripts de torque:

/software/bin/CoinAll/clp

Más información

Coin-or home page.

GAP

Versión 4.4 del lenguaje matemático para álgebra discreta con numerosas librerías de funciones y tablas.

GAP es unas 2.5 veces más lento en itanium que en opteron o core2duo. Os recomendamos Maiz o Péndulo para ejecutar GAP en interactivo.

Se puede ejecutar directamente gap en la línea de comandos. Por defecto se crea un espacio de trabajo (workspace) de 512 MB. En los scripts del sistema de colas si es necesario incrementar la memoria que usa GAP ejecutarlo con la opción -m, por ejemplo:

/software/bin/gap -m 900m < input-file > output-file

donde input-file es el fichero con las órdenes para GAP, en output-file se guarda la salida de pantalla y se está creando un workspace de 900 MB para GAP.

Más información y documentación en GAP home page.

HTK

Versión 3.4.1 del conjunto de programas para trabajar modelos ocultos de Markov. Es principalmente usado en investigación sobre el reconocimiento del habla.

Sólamente está instalado en Péndulo y los nodos Opteron.

Para ejecutar alguna de sus programas emplear por ejemplo:

/software/bin/HDecode

Para más información Página web de HTK.

Matplotlib

Información general

Librerías para cálculo matemático con Python. Se han instalado también las librerías numphy y el intérprete ipython.

Se ha requerido recompilar python, se deben usar ejecutando

/software/bin/python

/software/bin/ipython

Más información

Página web de Matplotlib.

Página web de Numpy.

Página web de ipython.

Grace

Información general

Está instalada la versión 5.1.19. Grace es un herramienta WYSIWYG (What you see is what you get, es decir, Lo que Ves es lo que Consigues) para hacer gráficos en dos dimensiones de datos numéricos.

Para ejecutarlo hay que utilizar el comando:

xmgrace

Más información

Más información y documentación en la página web de Grace.

P4VASP

Información general

P4vasp es un paquete para visualizar estructuras y densidades electrónicas,…de cálculos de VASP.

Como usar

Los usuarios deberán cerciorarse el poder ejecutar una aplicación gráfica de los servidores del Servicio en sus ordenadores personales. Esto se explica [intlink id=»48″ type=»post»]en la guía de acceso[/intlink] al servicio.

Para su ejecución, simplemente ejecutar

p4v

Más información

P4Vasp home page.