Kategoriaren artxiboa: Uncategorized @eu

SCIPION

Informazio orokorra Scipion is an image processing framework to obtain 3D models of macromolecular complexes using Electron Microscopy.Versión de Mayo de Github. Nola erabili SCIPION erabiltzeko exekutatu /software/bin/scipion Informazio gehiago SCIPION web orrialdea Download article as PDF

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

Qbox

Informazio Orokorra Bertsioa: 1.62.3 Qbox is a C++/MPI scalable parallel implementation of first-principles molecular dynamics (FPMD) based on the plane-wave, pseudopotential formalism. Qbox is designed for operation on large parallel computers. Nola Erabili Lanak bidaltzeko send_qbox tresna prestatu dugu honako erabilerarekin: … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

MetAMOS

Informazio orokorra MetAMOS represents a focused effort to create automated, reproducible, traceable assembly & analysis infused with current best practices and state-of-the-art methods. MetAMOS for input can start with next-generation sequencing reads or assemblies, and as output, produces: assembly reports, … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea, Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

QIIME

Information orokorra QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology) is an open-source bioinformatics pipeline for performing microbiome analysis from raw DNA sequencing data. QIIME is designed to take users from raw sequencing data generated on the Illumina or other platforms through … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea, Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

ABySS

Informazio orokorra 1.3.2 ABySS bertsioa (Assembly By Short Sequences). ABySS is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for short reads. ABySS paraleloan exekutatu daiteke. Begiratu ere instalatuta dagoen eta biak konparatzen publikatu dugun artikulua. Nola erabili … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea, Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

Gulp 4.0

Informazio Orokorra GULP programak  materialeen  era askotako simulazioak  egin dintzake 0-D  (molekula eta klusterrak), 1-D (polimeroak), 2-D (azalerak, lauza, …) da , edo 3-D (solidoa peridikoak).  Kodearen helburua soluzio analitiko bat lorztea da da, “sare dinamika” (ahal denean) erabiltzen  dinamika molekularraren ordez. Indarr-eremu anitzak erabili ditzake. Erabili aurretik mesedez begira bere erabilera baldintzak. Guinness:/Softwarea/Gulp katalogoan instalatuta dago. … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

XCrySDen

Informazio orokorra XcrysSDen egitura kristalinoak eta molekularrak ikusteko programa da. Gainazal,  kontornoak eta egitura atomikoak marrazten ditu. Interaktiboki aldatu daitezke. Nola erabili XCrySDen erabiltzeko exekutatu: xcrysden Aplikazio grafikoak ireki ahal izateko (). Informazio gehiago XCrySDen web orrialdea. Download article as … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Kalkulu Softwarea, Uncategorized @eu, Visualization @eu | Utzi iruzkina

GRETL

Informazio orokorra Gretl (Gnu Regression, Econometrics and Time-series Library) ekonometriako programa bat da. 1.9.6. bertsioa dago eskuragarri Ezaugarriak Incluye una gran variedad de estimadores: mínimos cuadrados, máxima verosimilitud, GMM; de una sola ecuación y de sistemas de ecuaciones Métodos de … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Kalkulu Softwarea, Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

Nola bidali Terachem

Sarrera Torque script bat eraiki dezakezu kolara bidaltzeko edo send_terachem komandoa erabili send_terachem lanak bidaltzeko send_terachem agindua sortu dugu. send_terachem JOBNAME TIME MEM [“Other queue options”] non JOBNAME: terachemren sarrera datuen fitxategia. TIME: Kaluluaren denbora hh:mm:ss fromatuan MEM: memoria Gb-etan … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

Terachem

Informazio orokorra TeraChem 1.45 is general purpose quantum chemistry software designed to run on NVIDIA GPU architectures under a 64-bit Linux operating system. Some of TeraChem features include: Full support for both NVIDIA Tesla and Fermi GPUs Restricted Hartree-Fock and … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

GSL

Liburutegi matematikoen 1.16 bertsioa. Hauek sortzen dituzte: ausazko zenbakiak, funtzio bereziak, fft, algebra lineala… guztira 1.000 funtzio baino gehiago. Nola linkatzen diren jakiteko exekutatu gsl-config Informazio gehiago  GSL homepage. Download article as PDF

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

VMD

Informazio orokorra VMD is designed for modeling, visualization, and analysis of biological systems such as proteins, nucleic acids, lipid bilayer assemblies, etc. It may be used to view more general molecules, as VMD can read standard Protein Data Bank (PDB) … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina