Materia
Tecnología molecular en Biomedicina
Datos generales de la materia
- Modalidad
- Presencial
- Idioma
- Castellano
Descripción y contextualización de la asignatura
La materia Tecnología Molecular en Biomedicina es una de las 3 materias consideradas fundamentales para todo el alumnado del Máster en Investigación Biomédica por lo que es obligatoria. Incide fundamentalmente en aspectos metodológicos de la Investigación Biomédica.Aborda a través de experiencias de laboratorio, prácticas de ordenador, sesiones magistrales y de aplicación y análisis el estudio de metodologías fundamentales en Biomedicina experimental.
Profesorado
Nombre | Institución | Categoría | Doctor/a | Perfil docente | Área | |
---|---|---|---|---|---|---|
ALONSO ALEGRE, SANTOS | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Personal Doctor Investigador | Doctor | No bilingüe | Antropología Física | santos.alonso@ehu.eus |
ASPICHUETA CELAA, PATRICIA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Pleno | Doctora | Bilingüe | Fisiología | patricia.aspichueta@ehu.eus |
BOYANO LOPEZ, MARIA DOLORES | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Catedratico De Universidad | Doctora | No bilingüe | Biología Celular | lola.boyano@ehu.eus |
BUQUE GARCIA, XABIER | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctor | Bilingüe | Fisiología | xabier.buque@ehu.eus |
CHICO CARMONA, YOLANDA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Titular De Universidad | Doctora | Bilingüe | Fisiología | yolanda.chico@ehu.eus |
CRISTOBAL BARRAGAN, SUSANA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Visitante Ikerbaske | Doctora | No bilingüe | Fisiología | susana.cristobal@ehu.eus |
DELGADO BALZATEGUI, IGOTZ | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctor | Bilingüe | Fisiología | igotz.delgado@ehu.eus |
FRESNEDO ARANGUREN, MARIA OLATZ | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Titular De Universidad | Doctora | Bilingüe | Fisiología | olatz.fresnedo@ehu.eus |
IRIONDO ORENSANZ, MIKEL | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctor | Bilingüe | Antropología Física | m.iriondo@ehu.eus |
IZAGIRRE ARRIBALZAGA, NESKUTS | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Titular De Universidad | Doctora | Bilingüe | Antropología Física | neskuts.izagirre@ehu.eus |
LOPEZ LOPEZ, ELIXABET | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Adjunto (Ayudante Doctor/A) | Doctora | Bilingüe | Bioquímica y Biología Molecular | elixabet.lopez@ehu.eus |
MARTIN GUERRERO, IDOIA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctora | Bilingüe | Genética | idoia.marting@ehu.eus |
MARTINEZ SAN PELAYO, MARIA JOSE | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Titular De Universidad | Doctora | No bilingüe | Fisiología | mariajose.martinez@ehu.eus |
NAVARRO LOBATO, ROSAURA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctora | Bilingüe | Fisiología | rosaura.navarro@ehu.eus |
RUEDA ESTEVEZ, YURI | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctor | Bilingüe | Fisiología | yuri.rueda@ehu.eus |
SANZ ECHEVARRIA, MARIA BEGOÑA | Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea | Profesorado Agregado | Doctora | Bilingüe | Fisiología | mariabegona.sanz@ehu.eus |
Competencias
Denominación | Peso |
---|---|
Plantear y realizar análisis experimentales empleando las técnicas básicas en Biología y Patología Molecular | 40.0 % |
Enfrentarse con éxito al estudio, al análisis y al juicio de valor de resultados de investigación biomédica experimental y clínica basados en la tecnología molecular | 40.0 % |
Integrar y desarrollar los conocimientos básicos para comprender nuevas tecnologías moleculares y ser capaces de continuar aprendiendo, en especial sobre las técnicas de extracción de información Biomédica high-throuput | 20.0 % |
Tipos de docencia
Tipo | Horas presenciales | Horas no presenciales | Horas totales |
---|---|---|---|
Magistral | 18 | 27 | 45 |
Seminario | 6 | 9 | 15 |
P. de Aula | 12 | 18 | 30 |
P. Laboratorio | 14 | 21 | 35 |
Sistemas de evaluación
Denominación | Ponderación mínima | Ponderación máxima |
---|---|---|
Asistencia y Participación | 60.0 % | 70.0 % |
Examen escrito | 5.0 % | 15.0 % |
Exposiciones | 60.0 % | 70.0 % |
Otros | 5.0 % | 15.0 % |
Trabajos Prácticos | 15.0 % | 30.0 % |
Convocatoria ordinaria: orientaciones y renuncia
Para la evaluación de la materia se valorarán la asistencia y la participación en las actividades propuestas con un 6 sobre 10. Por cada jornada o equivalente sin asistir se restará 1 punto y se tolerarán como máximo el equivalente a 2 jornadas de ausencia no justificadas.Durante el desarrollo de la materia se propondrán pequeñes pruebas de pruebas de evaluación; algunas serán presenciales (ejercicios de aplicación y exposiciones) y otras consistirán en elaboración de informes y otros documentos. Las calificaciones de estas evaluaciones se sumarán de forma ponderada a la nota correspondiente al cumplimiento formal.
Convocatoria extraordinaria: orientaciones y renuncia
En la convocatoria extraordinaria se realizarán pruebas equivalentes a las de la convocatoria ordinaria.Temario
TEMA 1 Análisis de DNA y RNA. Extracción, cuantificación y análisis de pureza de ácidos nucléicos. Determinación cuantitativa y cualitativa. Electroforesis. Retrotranscripción.TEMA 2 PCR convencional y a tiempo real. PCR cuantitativa. PCR específica de metilación y silenciamiento génico.
TEMA 3 Técnicas radiométricas. Southern blot y cuantificación de la velocidad de transcripción.
TEMA 4 Secuenciación. Plataformas y aplicaciones de la secuenciación masiva.
TEMA 5 Clonaje
TEMA 6 Bioinformática. Nociones básicas y fundamentos de programación. Herramientas para clasificación y predicción con datos biomédicos
TEMA 7 Herramientas y servicios Bioinformáticos.
TEMA 8 Variación genómica: principios generales en Biomedicina.
TEMA 9. Variación estructural en el genoma humano. Impacto biomédico
TEMA 10 Genómica funcional. Caracterización de promotores génicos. Estudio de la unión de factores de transcripción.
TEMA 11 Introducción a la proteómica. Nociones básicas y fundamentos técnicos
TEMA 12 Perspectivas de la proteómica en medicina traslacional
TEMA 13 Proteómica diferencial en el descubrimiento de biomarcadores.
Bibliografía
Materiales de uso obligatorio
NingunoBibliografía básica
Aebersold R and Mann M (2003). Mass spectrometry-based proteomics. Nature. 422: 198-207.Aebersold R and Mann M (2016). Mass-spectrometry exploration of proteome structure and function. Nature. 537(7620):347-55.
Brazma A et al. (2001) Minimum Information about a microarray experiment (MIAME) - towards standards for microarray data. Nature Genetics 29:365-371
Causton HC, Quackenbush J and Brazma A (2003) Microarray Gene Expression Data Analysis. Blackwell. UK.
Domon B and Aebersold R (2010). Options and considerations when selecting a quantitative proteomics strategy. Nat Biotechnol. 28(7):710-21.
Julian C. Knight (2009). Human Genetic Diversity: Functional Consequences for Health and Disease. Oxford University Press.
Link AJ. (1999) Methods in Molecular Biology Vol 112. 2-D Proteome Analysis Protocols. Humana Press, USA.
Sambrook J & Russell SW (2012) Molecular cloning. A laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA (http://www.molecularcloning.com/)
Speed T (Ed). (2003) Statistical Analysis of Gene Expression Microarray Data.Chapman & Hall/CRC, UK.
Trent RJ (2012) Molecular medicine. Elsevier, USA
Enlaces
http://decipher.sanger.ac.uk/http://eichlerlab.gs.washington.edu/database.html
http://genome.ucsc.edu
http://humanparalogy.gs.washington.edu/build34/chromBlowups/starburst.S20000.P0.90/20kb90P.htm
http://jaspar.genereg.net/
http://media.affymetrix.com/support/learning/training_tutorials/genotyping_console_3_0/1/
http://projects.tcag.ca/variation/
http://rna.lundberg.gu.se/cutter2/ WebCutter restriction map
http://www.affymetrix.com/ Portal de Affymetrix acceso a manuales, literatura etc.
http://www.affymetrix.com/support/learning/training_tutorials/genotyping_console_2_1/genotyping_console_software_2_1.affx#1_2
http://www.expasy.org/
http://www.hprd.org/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.nslij-genetics.org/cnv/index.html
http://www.protocol-online.org/prot/Molecular_Biology/
http://www.sanger.ac.uk/humgen/cnv/
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK20363/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbvar/
https://www.proteinatlas.org/