Descripción y contextualización de la asignatura

La materia Tecnología Molecular en Biomedicina es una de las 3 materias consideradas fundamentales para todo el alumnado del Máster en Investigación Biomédica por lo que es obligatoria. Incide fundamentalmente en aspectos metodológicos de la Investigación Biomédica.

Aborda a través de experiencias de laboratorio, prácticas de ordenador, sesiones magistrales y de aplicación y análisis el estudio de metodologías fundamentales en Biomedicina experimental.

Convocatoria ordinaria: orientaciones y renuncia

Para la evaluación de la materia se valorarán la asistencia y la participación en las actividades propuestas con un 6 sobre 10. Por cada jornada o equivalente sin asistir se restará 1 punto y se tolerarán como máximo el equivalente a 2 jornadas de ausencia no justificadas.

Durante el desarrollo de la materia se propondrán pequeñes pruebas de pruebas de evaluación; algunas serán presenciales (ejercicios de aplicación y exposiciones) y otras consistirán en elaboración de informes y otros documentos. Las calificaciones de estas evaluaciones se sumarán de forma ponderada a la nota correspondiente al cumplimiento formal.

Convocatoria extraordinaria: orientaciones y renuncia

En la convocatoria extraordinaria se realizarán pruebas equivalentes a las de la convocatoria ordinaria.

Temario

TEMA 1 Análisis de DNA y RNA. Extracción, cuantificación y análisis de pureza de ácidos nucléicos. Determinación cuantitativa y cualitativa. Electroforesis. Retrotranscripción.

TEMA 2 PCR convencional y a tiempo real. PCR cuantitativa. PCR específica de metilación y silenciamiento génico.

TEMA 3 Técnicas radiométricas. Southern blot y cuantificación de la velocidad de transcripción.

TEMA 4 Secuenciación. Plataformas y aplicaciones de la secuenciación masiva.

TEMA 5 Clonaje

TEMA 6 Bioinformática. Nociones básicas y fundamentos de programación. Herramientas para clasificación y predicción con datos biomédicos

TEMA 7 Herramientas y servicios Bioinformáticos.

TEMA 8 Variación genómica: principios generales en Biomedicina.

TEMA 9. Variación estructural en el genoma humano. Impacto biomédico

TEMA 10 Genómica funcional. Caracterización de promotores génicos. Estudio de la unión de factores de transcripción.

TEMA 11 Introducción a la proteómica. Nociones básicas y fundamentos técnicos

TEMA 12 Perspectivas de la proteómica en medicina traslacional

TEMA 13 Proteómica diferencial en el descubrimiento de biomarcadores.

Bibliografía

Materiales de uso obligatorio

Ninguno

Bibliografía básica

Aebersold R and Mann M (2003). Mass spectrometry-based proteomics. Nature. 422: 198-207.

Aebersold R and Mann M (2016). Mass-spectrometry exploration of proteome structure and function. Nature. 537(7620):347-55.

Brazma A et al. (2001) Minimum Information about a microarray experiment (MIAME) - towards standards for microarray data. Nature Genetics 29:365-371

Causton HC, Quackenbush J and Brazma A (2003) Microarray Gene Expression Data Analysis. Blackwell. UK.

Domon B and Aebersold R (2010). Options and considerations when selecting a quantitative proteomics strategy. Nat Biotechnol. 28(7):710-21.

Julian C. Knight (2009). Human Genetic Diversity: Functional Consequences for Health and Disease. Oxford University Press.

Link AJ. (1999) Methods in Molecular Biology Vol 112. 2-D Proteome Analysis Protocols. Humana Press, USA.

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Speed T (Ed). (2003) Statistical Analysis of Gene Expression Microarray Data.Chapman & Hall/CRC, UK.

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Enlaces

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http://www.affymetrix.com/ Portal de Affymetrix acceso a manuales, literatura etc.



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