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Tecnología molecular en Biomedicina

Datos generales de la materia

Modalidad
Presencial
Idioma
Castellano

Descripción y contextualización de la asignatura

La materia Tecnología Molecular en Biomedicina es una de las 3 materias consideradas fundamentales para todo el alumnado del Máster en Investigación Biomédica por lo que es obligatoria. Incide fundamentalmente en aspectos metodológicos de la Investigación Biomédica.

Aborda a través de experiencias de laboratorio, prácticas de ordenador, sesiones magistrales y de aplicación y análisis el estudio de metodologías fundamentales en Biomedicina experimental.

Profesorado

NombreInstituciónCategoríaDoctor/aPerfil docenteÁreaEmail
ALONSO ALEGRE, SANTOSUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaPersonal Doctor InvestigadorDoctorNo bilingüeAntropología Físicasantos.alonso@ehu.eus
ASPICHUETA CELAA, PATRICIAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado PlenoDoctoraBilingüeFisiologíapatricia.aspichueta@ehu.eus
BOYANO LOPEZ, MARIA DOLORESUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Catedratico De UniversidadDoctoraNo bilingüeBiología Celularlola.boyano@ehu.eus
BUQUE GARCIA, XABIERUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctorBilingüeFisiologíaxabier.buque@ehu.eus
CHICO CARMONA, YOLANDAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Titular De UniversidadDoctoraBilingüeFisiologíayolanda.chico@ehu.eus
CRISTOBAL BARRAGAN, SUSANAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaVisitante IkerbaskeDoctoraNo bilingüeFisiologíasusana.cristobal@ehu.eus
DELGADO BALZATEGUI, IGOTZUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctorBilingüeFisiologíaigotz.delgado@ehu.eus
FRESNEDO ARANGUREN, MARIA OLATZUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Titular De UniversidadDoctoraBilingüeFisiologíaolatz.fresnedo@ehu.eus
IRIONDO ORENSANZ, MIKELUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctorBilingüeAntropología Físicam.iriondo@ehu.eus
IZAGIRRE ARRIBALZAGA, NESKUTSUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Titular De UniversidadDoctoraBilingüeAntropología Físicaneskuts.izagirre@ehu.eus
LOPEZ LOPEZ, ELIXABETUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Adjunto (Ayudante Doctor/A)DoctoraBilingüeBioquímica y Biología Molecularelixabet.lopez@ehu.eus
MARTIN GUERRERO, IDOIAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctoraBilingüeGenéticaidoia.marting@ehu.eus
MARTINEZ SAN PELAYO, MARIA JOSEUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado Titular De UniversidadDoctoraNo bilingüeFisiologíamariajose.martinez@ehu.eus
NAVARRO LOBATO, ROSAURAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctoraBilingüeFisiologíarosaura.navarro@ehu.eus
RUEDA ESTEVEZ, YURIUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctorBilingüeFisiologíayuri.rueda@ehu.eus
SANZ ECHEVARRIA, MARIA BEGOÑAUniversidad del País Vasco/Euskal Herriko UnibertsitateaProfesorado AgregadoDoctoraBilingüeFisiologíamariabegona.sanz@ehu.eus

Competencias

DenominaciónPeso
Plantear y realizar análisis experimentales empleando las técnicas básicas en Biología y Patología Molecular40.0 %
Enfrentarse con éxito al estudio, al análisis y al juicio de valor de resultados de investigación biomédica experimental y clínica basados en la tecnología molecular40.0 %
Integrar y desarrollar los conocimientos básicos para comprender nuevas tecnologías moleculares y ser capaces de continuar aprendiendo, en especial sobre las técnicas de extracción de información Biomédica high-throuput20.0 %

Tipos de docencia

TipoHoras presencialesHoras no presencialesHoras totales
Magistral182745
Seminario6915
P. de Aula121830
P. Laboratorio142135

Sistemas de evaluación

DenominaciónPonderación mínimaPonderación máxima
Asistencia y Participación60.0 % 70.0 %
Examen escrito5.0 % 15.0 %
Exposiciones60.0 % 70.0 %
Otros5.0 % 15.0 %
Trabajos Prácticos15.0 % 30.0 %

Convocatoria ordinaria: orientaciones y renuncia

Para la evaluación de la materia se valorarán la asistencia y la participación en las actividades propuestas con un 6 sobre 10. Por cada jornada o equivalente sin asistir se restará 1 punto y se tolerarán como máximo el equivalente a 2 jornadas de ausencia no justificadas.

Durante el desarrollo de la materia se propondrán pequeñes pruebas de pruebas de evaluación; algunas serán presenciales (ejercicios de aplicación y exposiciones) y otras consistirán en elaboración de informes y otros documentos. Las calificaciones de estas evaluaciones se sumarán de forma ponderada a la nota correspondiente al cumplimiento formal.

Convocatoria extraordinaria: orientaciones y renuncia

En la convocatoria extraordinaria se realizarán pruebas equivalentes a las de la convocatoria ordinaria.

Temario

TEMA 1 Análisis de DNA y RNA. Extracción, cuantificación y análisis de pureza de ácidos nucléicos. Determinación cuantitativa y cualitativa. Electroforesis. Retrotranscripción.

TEMA 2 PCR convencional y a tiempo real. PCR cuantitativa. PCR específica de metilación y silenciamiento génico.

TEMA 3 Técnicas radiométricas. Southern blot y cuantificación de la velocidad de transcripción.

TEMA 4 Secuenciación. Plataformas y aplicaciones de la secuenciación masiva.

TEMA 5 Clonaje

TEMA 6 Bioinformática. Nociones básicas y fundamentos de programación. Herramientas para clasificación y predicción con datos biomédicos

TEMA 7 Herramientas y servicios Bioinformáticos.

TEMA 8 Variación genómica: principios generales en Biomedicina.

TEMA 9. Variación estructural en el genoma humano. Impacto biomédico

TEMA 10 Genómica funcional. Caracterización de promotores génicos. Estudio de la unión de factores de transcripción.

TEMA 11 Introducción a la proteómica. Nociones básicas y fundamentos técnicos

TEMA 12 Perspectivas de la proteómica en medicina traslacional

TEMA 13 Proteómica diferencial en el descubrimiento de biomarcadores.

Bibliografía

Materiales de uso obligatorio

Ninguno

Bibliografía básica

Aebersold R and Mann M (2003). Mass spectrometry-based proteomics. Nature. 422: 198-207.

Aebersold R and Mann M (2016). Mass-spectrometry exploration of proteome structure and function. Nature. 537(7620):347-55.

Brazma A et al. (2001) Minimum Information about a microarray experiment (MIAME) - towards standards for microarray data. Nature Genetics 29:365-371

Causton HC, Quackenbush J and Brazma A (2003) Microarray Gene Expression Data Analysis. Blackwell. UK.

Domon B and Aebersold R (2010). Options and considerations when selecting a quantitative proteomics strategy. Nat Biotechnol. 28(7):710-21.

Julian C. Knight (2009). Human Genetic Diversity: Functional Consequences for Health and Disease. Oxford University Press.

Link AJ. (1999) Methods in Molecular Biology Vol 112. 2-D Proteome Analysis Protocols. Humana Press, USA.

Sambrook J & Russell SW (2012) Molecular cloning. A laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA (http://www.molecularcloning.com/)

Speed T (Ed). (2003) Statistical Analysis of Gene Expression Microarray Data.Chapman & Hall/CRC, UK.

Trent RJ (2012) Molecular medicine. Elsevier, USA

Enlaces

http://decipher.sanger.ac.uk/



http://eichlerlab.gs.washington.edu/database.html



http://genome.ucsc.edu



http://humanparalogy.gs.washington.edu/build34/chromBlowups/starburst.S20000.P0.90/20kb90P.htm



http://jaspar.genereg.net/



http://media.affymetrix.com/support/learning/training_tutorials/genotyping_console_3_0/1/



http://projects.tcag.ca/variation/



http://rna.lundberg.gu.se/cutter2/ WebCutter restriction map



http://www.affymetrix.com/ Portal de Affymetrix acceso a manuales, literatura etc.



http://www.affymetrix.com/support/learning/training_tutorials/genotyping_console_2_1/genotyping_console_software_2_1.affx#1_2



http://www.expasy.org/



http://www.hprd.org/



http://www.ncbi.nlm.nih.gov/



http://www.nslij-genetics.org/cnv/index.html



http://www.protocol-online.org/prot/Molecular_Biology/



http://www.sanger.ac.uk/humgen/cnv/



https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi



https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK20363/



https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbvar/



https://www.proteinatlas.org/



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