Contenido de XSL
Proteómica, Estructura e Ingeniería de Proteínas
- Centro
- Facultad de Ciencia y Tecnología
- Titulación
- Grado en Bioquímica y Biología Molecular
- Curso académico
- 2022/23
- Curso
- 2
- Nº Créditos
- 6
- Idiomas
- Castellano
- Euskera
DocenciaAlternar navegación
Tipo de docencia | Horas de docencia presencial | Horas de actividad no presencial del alumno/a |
---|---|---|
Magistral | 38 | 57 |
P. de Aula | 10 | 15 |
P. Ordenador | 12 | 18 |
Guía docenteAlternar navegación
ObjetivosAlternar navegación
Esta asignatura proporciona una visión integrada y actualizada del conocimiento de las proteínas a nivel estructural y químico. El alumno se familiarizará con con los distintos abordajes de la proteómica, los conceptos que se derivan del análisis estructural de las proteínas, y los últimos avances en la ingeniería aplicada a las mismas.
Además aprenderá a obtener estructuras de proteínas y ácidos nucleicos de las bases de datos estructurales, y manejar software adecuado para la visualización y comprensión de las relaciones estructura-función de macromoléculas
TemarioAlternar navegación
Proteómica Introducción. Proteómica descriptiva, proteómica de expresión y proteómica funcional. Análisis de subproteomas y complejos proteicos. Análisis de rutas de señalización celular. Análisis de interacciones entre proteínas. Espectrometría de masas aplicada a proteínas. Métodos de ionización MALDI, y ESI. Métodos de fragmentación. Analizadores. Identificación de proteínas por espectrometría de masas. Huella de masas peptídicas y huella de fragmentos peptídicos. Procesamiento de datos de espectros de masas. Proteómica cuantitativa. Modificaciones postraducción.
Estructura de proteínas Aminoácidos: Propiedades y clasificación. Escala de hidrofobicidad. Ionización. Grupos funcionales. Péptidos: Enlace peptídico. Estructura primaria. Estructura secundaria. Restricciones conformacionales de los polipéptidos. Tipos de estructura secundaria: hélices, láminas, giros y bucles. Estructura terciaria y cuaternaria de proteínas: Motivos y dominios estructurales. Clasificación de proteínas globulares. Proteínas de membrana. Introducción al plegamiento proteico.
Ingeniería de proteínas. Diseño "de novo" de estructura de proteínas. Diseño de actividades específicas. Diseño racional. Diseño modular. Minimización de las estructuras diseñadas. Aplicaciones del diseño de proteínas: estabilización de estructuras proteicas. Evolución dirigida de proteínas.
MetodologíaAlternar navegación
Clases teóricas, sesiones basadas en articulos de investigación representativos de la materia impartida y prácticas de ordenador.
Sistemas de evaluaciónAlternar navegación
Los exámenes (escrito y/o test) computarán un 75-80 % de la nota. Prácticas y trabajos el 20-25 % restante. Bastará con no presentarse a la prueba final para que la calificación final de la asignatura sea no presentado o no presentada.
Esta asignatura se rige por el “Protocolo sobre ética académica y prevención de las prácticas deshonestas o fraudulentas en las pruebas de evaluación y en los trabajos académicos en la UPV/EHU”, con las consecuencias previstas en el apartado 5 de dicho protocolo.
Materiales de uso obligatorioAlternar navegación
No se utiliza un único libro de texto.
BibliografíaAlternar navegación
Bibliografía básica
- Proteins and Proteomics: A laboratory manual. R.J. Simpson. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York. 2003.
- Manual de Proteómica Volumen I. Sociedad Española de Proteómica, Valencia, 2014.
- Manual de Proteómica Volumen II. Sociedad Española de Proteómica, Valencia, 2019.
- Introduction to protein structure. Branden, C. y Tooze, J. 2nd Edition. Garland Publishing, 1999.
Bibliografía de profundización
- Proteomics for Biological Discovery. Veenstra T.D. and Yates III J.R. Wiley, New Jersey, 2006.
- Estructura de proteínas. Gómez-Moreno, C y Sancho J. (coords.) Ariel Ciencia, 2003
Revistas
-
Tribunal de convocatorias 5ª, 6ª y excepcionalAlternar navegación
- MARTIN PLAGARO, CESAR AUGUSTO
- OMAETXEBARRIA IBARRA, MIREN JOSU
- SANTIN GOMEZ, IZORTZE
GruposAlternar navegación
16 Teórico (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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16-19 | 14:00-15:00 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | ||
21-24 | 14:00-15:00 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | ||
26-29 | 14:00-15:00 | ||||
26-30 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 |
Profesorado
16 P. de Aula-1 (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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20-25 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | |||
20-30 | 14:00-15:00 | ||||
29-29 | 17:00-18:00 | ||||
29-30 | 17:00-18:00 |
16 P. Ordenador-1 (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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18-19 | 09:30-11:30 12:00-13:00 | 08:30-11:30 |
Profesorado
17 Teórico (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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16-19 | 14:00-15:00 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | ||
21-24 | 14:00-15:00 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | ||
26-29 | 14:00-15:00 | ||||
26-30 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 |
Profesorado
17 P. de Aula-1 (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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20-25 | 15:00-16:00 | 14:00-15:00 | |||
20-30 | 14:00-15:00 | ||||
29-29 | 17:00-18:00 | ||||
29-30 | 17:00-18:00 |
17 P. Ordenador-1 (Castellano - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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18-19 | 09:30-11:30 12:00-13:00 | 08:30-11:30 |
Profesorado
46 Teórico (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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16-21 | 14:00-15:00 | 14:00-16:00 | |||
24-30 | 14:00-16:00 | ||||
25-30 | 14:00-15:00 |
Profesorado
46 P. de Aula-1 (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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22-23 | 14:00-16:00 | ||||
22-24 | 14:00-15:00 | ||||
29-29 | 16:00-17:00 | ||||
29-30 | 16:00-17:00 |
Profesorado
46 P. Ordenador-1 (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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18-18 | 08:30-11:30 | 09:30-11:30 12:00-13:00 | |||
27-27 | 08:30-11:30 | 09:30-11:30 12:00-13:00 |
Profesorado
47 Teórico (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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16-21 | 14:00-15:00 | 14:00-16:00 | |||
24-30 | 14:00-16:00 | ||||
25-30 | 14:00-15:00 |
Profesorado
47 P. de Aula-1 (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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22-23 | 14:00-16:00 | ||||
22-24 | 14:00-15:00 | ||||
29-29 | 16:00-17:00 | ||||
29-30 | 16:00-17:00 |
Profesorado
47 P. Ordenador-1 (Euskera - Tarde)Mostrar/ocultar subpáginas
Semanas | Lunes | Martes | Miércoles | Jueves | Viernes |
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18-18 | 08:30-11:30 | 09:30-11:30 12:00-13:00 | |||
27-27 | 08:30-11:30 | 09:30-11:30 12:00-13:00 |