Oinarri praktikoa duen Biokimikako Metodo Aurreratuak ikasgaian, teknika espektroskopikoen bidez, biomolekulen egitura eta hauen arteko interakzioak aztertuko ditugu. Horretaz gain, eta espektroskopiaz egindako lanen osagarritzat, proteina eta zelula-mintzetan agertzen diren hartzaileen arteko interakzioetan sakontzeko immunokimika-teknikak erabiliko ditugu eta baita zelula eukariotikoak oinarritzat dituzten entseguak ere egingo ditugu. Eduki teorikora begira, praktiketan erabiliko diren tekniken berrikusketa egiteaz gain, X izpien bidezko kristalografia ere ikasiko dugu, biomolekulen, eta batez ere proteinen egitura atomo mailan zehaztea ahalbidetzen duen bereizmen altuko teknika honen kontzeptu fisiko eta kimikoetan sakonduz. Praktiketako laborategian landuko diren praktiken txostenak klasean prestatuko dira. Ikasgai honetan, Espektroskopia ikasgaian landutako eduki teorikoak praktikan aplikatzeaz gain, Biologia Estrukturala ikasgaian jasotakoarekin ere lotura egingo dugu, bertan ikasitako proteinen egituran sakonduko baitugu; era berean, ikasgai honetako praktikak proteinen eta zelula-mintzaren arteko interakzioen osteko seinalizazio prozesuak ulertzen lagungarri izango zaizkigu, seinaleztapena ikasgaiarekin lotura estua eginez. Ikaslegoaren formakuntzari begira, maila molekularrean gertatzen diren prozesuak deskribatzeko ikerketa- eta diagnosi-laborategietan ohikoak diren espektroskopia-tekniken oinarriak, instrumentazioa eta aplikazioak landuko ditugu.

Irakasgai honetan aurreko ikasturteko oinarri teorikoak garatuko dira; horretarako, espektroskopia teknikak erabilita, biomolekulen egituren ezaugarriak eta molekulen arteko elkarrekintzak aztertuko dira.



T2 Ikaskuntza autonomoa eta egoera berrietara egokitzea garatzea.



T3 Ideiak transmititu eta publiko profesional eta ez profesional bati komunikatu, hizkuntzen erabilera sustatuz atzerritarrak, batez ere ingelesa.



T4 Diziplina anitzeko eta kultur anitzeko taldeetan lankidetzan aritzea eta lan egitea genero berdintasuna errespetatuz. Gaitasun espezifikoak:



T6 Sormen eta ekintzailetza gaitasuna garatzea: proiektuak formulatu, diseinatu eta kudeatu, berriak bilatu eta integratu ezagutzak eta jarrerak.



T7 Konpromiso etikoa eta eztabaida sozialean parte hartzeko gaitasuna garatzea.



T8 Molekula biologikoen portaera ulertzeko beharrezkoak diren oinarri zientifikoak ezagutzea propietateak eta haien elkarrekintzak.



T10 Maila zelular eta molekularreko organismoak ulertzea.



T13 Herentziaren oinarri molekularrak eta aurrerapen zientifikoan dituen ondorioak ulertzea.



T14 Metabolismoaren, komunikazio zelularreko sistemen eta haien gaitasunaren ikuspegi integratua eskuratzea aldaketa fisiopatologiko eta ingurumenekoetara egokitzea.



T16: lan egin behar bezala laborategian, segurtasun kimikoa, biologikoa eta erradiologikoa, manipulazioa barne. ezabatzea eta erregistroa.



T18 Datuak aztertzeko oinarrizko tresna kuantitatiboak behar bezala erabiltzea. T19 Ezagutzea ikerketa biokimikoan erabilitako estrategia esperimentalen oinarriak.



T20 Inguruko datuak eta emaitza esperimentalak aztertu eta behar bezala interpretatu.



T21 Teknika instrumentalen oinarrizko ezagutzak modu egokian kudeatzea informazioa lortzeko, diseinatzeko



esperimentuak eta emaitzak interpretatzea.



T22 Ezagutzea zientzialariek produktuak sortzeko, transmititzeko eta hedatzeko erabiltzen dituzten ohiko prozedurak Informazio zientifikoa.



T23 Lortutako eskuratutako ezagutza molekularrak bere aplikazio biomediko posibleak. T24 Inguruko literatura zientifikoa interpretatu eta ebaluatzea.



T26 Autonomia eta autoerregulazioa T 27 Komunikazioa eta eleaniztasuna T28 Etika eta Lanbide Erantzukizuna T29 Pentsamendu kritikoa



ODS3 eta ODS4 Landuko dira.

- Proteinen egonkortasuna. Proteina baten AG-aren kalkulua desnaturalizatzaile desberdinak erabiliz. Cm konparazioa. Espektroskopia diferentzialaren erabilerak.



- Dikroismo zirkular bidezko makromolekulen egituraren esleipena. Proteinen bigarren mailako egituraren eskuratzea.



- Proteina-estekatzaile interakzioak: Anisotropia fluoreszentearen erabilera interakzioaren Kd balioa lortzeko.



- FRET: Molekulen arteko distantziaren kalkulua proteina-proteina interakuntzak aztertzeko



- Proteina eta bere mintzeko hartzailearen arteko interakuntzaren azterketa Inmuno-detekzio bidez (ELISA)



- Zelula eukariotoetan egindako azterketak: Zelulen bideragarritasunaren analisia eta fluoreszentziaren bidez neurtutako konposatuen internalizazioa.



- Nanokonposatu proteo-lipidikoen karakterizazioa TEM irudiak erabiliz.



- Proteinen 3D egituraren esleipena. X izpien difrakzioaren gaineko sarrera. Proteinen 3D egituraren X izpien bidezko esleipena.

Ikasgaiaren Klase magistraletan (M)"Biomolekulen Espektroskopia" Ikastaroan emandako informazioa sakonduko da. Praktiken protokoloak azalduko dira eta mintegietan teknika konplexuagoak edo berrienak garatuko dira. Laborategiko praktikak egingo dira eta ordenagailuko praktiketan laborategian lortutako datuen prozesamendua burutuko da.

• Azken Ebaluazioaren Sistema
• Kalifikazioko tresnak eta ehunekoak:
  • alde lanak (arazoen ebazpenak, proiektuen diseinuak) (%): 90
  • Lanen, irakurketen... aurkezpena (%): 10

Laborategiko eta ordenagailuko praktiken datuekin ikasleak GrAL-gida jarraituz ikerketa artikulu bat prestatuko du.



Indarrean dagoen araudiaren arabera, ikasleak etengabeko ebaluazioari uko egin nahi badio, hori adieraziz idatzi bat aurkeztu beharko dio



irakasgaiaren ardura duen irakasleari eta, horretarako, bederatzi asteko epea izango du ikasturtea hasten denetik.



Uko egitea: Etengabeko ebaluazioaren kasuan, deialdiari uko egin nahi dion ikasleak irakasgaiaren irakaskuntza aldia bukatu baino, gutxienez, hilabete



lehenago egin beharko du eskaria. Eskari hori idatziz aurkeztu beharko zaio irakasgaiaren ardura duen irakasleari. Azken ebaluazioaren kasuan, Deialdiari uko egiteko, azterketa egun ofizialean egin beharreko probara ez aurkeztea nahikoa da.



Ebaluazioa:



- Laborategian burututako lana + ordenagailuko praktiketan burututako lana + txostena egitea eta amaieran entregatzen den dokumentua (% 90).



- Mintegia % 10



Azkeneko zein etengabeko ebaluazioaren kasuan, nahikoa izango da proba horretara ez aurkeztea azken kalifikazioa



“Ez aurkeztua” izan dadin.



Laborategiko eta ordenagailuko praktiketara joatea nahitaezkoa da, kontrolatu egingo da eta bertaratze-orriak egiten diren egunean bertan entregatuko dira.



Azken nota lortzeko, ebaluatutako diren ataletako kalifikazio partzialak batuko dira. Irakasgaia gainditzeko, aipatutako atal bakoitzean gutxieneko bat lortu behar da (% 40). Ohiko deialdian irakasgaia gainditzen ez bada, gainditu diren ataletako kalifikazio partzialak aurtengo ezohiko deialdirako gordeko dira (uztaila).

Ez Ohiko deialdiari uko egitea: Azterketara ez aurkezteak zuzenki aktetan EZ-AURKEZTU gisa agertzea dakar

egela orria

Oinarrizko bibliografia

- Estructura de proteínas, Gómez-Moreno C., Sancho, J (2003), ed. Ariel Ciencia

- Biological Spectroscopy, Campbell I.D. and Dwek, R.A. (1984), Benjamin Cummings

Gehiago sakontzeko bibliografia

- Biophysical Tools for Biologists,Volume One: In Vivo Techniques. J.J.Correia y H.W.Dietrich III en: Methods in Cell Biology vol 89, (2008) Elsevier
- Methods in Molecular Biophysics. Structure, dynamics, function. I.N. Serdyuk, N.R. Zaccai, J. Zaccai (2007) Cambridge
- Spectroscopy for the Biological Sciences. G.G.Hammes (2005) Wiley Interscience.
- Principles of Fluorescence Spectroscopy. 3 ed J.R. Lakowicz. (2006) Springer.
- Spectroscopy for Biochemist. S.B. Brown (1980) Academic Press
- Principles of Physical Biochemistry. K. E. van Holde, W. Curtis Johnson and P. Shing Ho. (1998) Prentice Hall.
- Molecular Spectroscopy J.M. Brown. (1998) Oxford University Press.
- Foundations of Spectroscopy S. Duckett and B. Gilbert. (2000) Oxford University Press.
- Spectrometry and Spectrofluorimetry. A Practical Approach. C.L. Baschford and D.A. Harris. (1987) IRL Press.
- Spectrophotometry and Spectrofluorimetry M.G. Gore. (2000) Oxford University Press, 2000
- Introduction to Biophysical Methods for Protein and Nucleic Acid Research. J.A. Glasel y M.P. Deutscher (eds.) (1995). Academic Press.
- Biophysical Chemistry. Part II: Techniques for the study of biological structure and function. C. R. Cantor and P. R. Schimmel. (1980) W. H.Freeman and Company.
- Protein Structure: a practical approach. T. E. Creighton. (1990) IRL Press at Oxford University Press.
- Cell and Molecular Biology: concepts and experiments. G. Karp. (1996) J. Wiley and Sons, Inc

Aldizkariak

- Nature
- Nature Methods
- Annual Review o0f Biophysics
- Biophysical Journal
- Biochemistry

Web helbideak

http://www.ysbl.york.ac.uk/%7Ecowtan/sfapplet/sfintro.html
http://biomodel.uah.es/lab/dc/inicio.htm