Hilabetekako artxiboa: January 2012

MCCCS Towhee 7.0.2

Towhee Monte Carlo kode libre bat da. Simulazio molekularrak egiten ditu atomoetan oinarritutako indar eremuak erabiliz.   Informazio orokorra Towheek hainbat talde termodinamiko estatistiko  (NVT, NPT, UVT, NVT eta NPT) simulatu ditzake, eta Monte Carloerabiliz . (Informazio gehiago).   Nola erabili send_towhee Towhee ilarara bidaltzeko   send_lmp tresna sortu dugu. … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Softwarea | Utzi iruzkina

Genepop

Informazio orokorra 4.1 bertsioa. Genepop is a population genetics software package, which has options for the following analysis: Hardy Weinberg equilibrium, Linkage Disequilibrium, Population Differentiation, Effective number of migrants, Fst or other correlations. Nola erabili Ilara sisteman exekutatzeko gehitu kolarako … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea | Utzi iruzkina

CLUMPP

Informazio orokorra 1.1.3 bertsioa. CLUMPP is a program that deals with label switching and multimodality problems in population-genetic cluster analyses. CLUMPP permutes the clusters output by independent runs of clustering programs such as , so that they match up as … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea | Utzi iruzkina

Structure

Informazio orokorra 2.33 bertsioa The program structure is a free software package for using multi-locus genotype data to investigate population structure. Its uses include inferring the presence of distinct populations, assigning individuals to populations, studying hybrid zones, identifying migrants and … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Genetika, Kalkulu Softwarea | Utzi iruzkina

Gulp 4.0

Informazio Orokorra GULP programak  materialeen  era askotako simulazioak  egin dintzake 0-D  (molekula eta klusterrak), 1-D (polimeroak), 2-D (azalerak, lauza, …) da , edo 3-D (solidoa peridikoak).  Kodearen helburua soluzio analitiko bat lorztea da da, “sare dinamika” (ahal denean) erabiltzen  dinamika molekularraren ordez. Indarr-eremu anitzak erabili ditzake. Erabili aurretik mesedez begira bere erabilera baldintzak. Guinness:/Softwarea/Gulp katalogoan instalatuta dago. … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Uncategorized @eu | Utzi iruzkina

LAMMPS

LAMMPS (“Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator”)  Sandia National Laborategiak garatutako dinamika molekular programa bat da. LAMMPS-ek  MPI komunikazioa erabiltzen du kalkulu paraleloentzat. Kode  irekia da eta GNU General Public License baldintzapean banatzen da. 2019ko Ekainare 5eko bertsioa. Informazio orokorra LAMMPS  dinamika molekular klasikoak egiteko  kodea da. Egoera likido, solido edo gaseosoan dauden partikula multzoak simula … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Biokimika, Softwarea | Utzi iruzkina

Arina klusterra

Informazio orokorra Kalkuluarko baliabideen laburpena Arinak 3.728 kalkulu kore ditu 3.664 Xeon eta 64 Itanium2 koretan banatuta, nodo bakoitzak 16 eta 512 GB bitarteko  memoria duelarik. 4 Xeon nodoek bina Nvidia Tesla txartel dituzte, beste nodo batek bi Nvidia Kepler 20, eta badago … Jarraitu irakurtzen

Kategoriak Arina @eu, Baliabide Konputazionalak | Utzi iruzkina