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Andone Estonba

PRESENTACIÓN

  • Nombre: Estonba, Andone 
  • Cargo: Evaluación positiva para el acceso al cuerpo de Profesores Catedráticos de Universidad y Asesora Científica del Servicio de Secuenciación y Genotipado (SGiker) de la Universidad del País Vasco (UPV/EHU).
  • Teléfono: +34 94 601 55 17
  • e-mail: andone.estonba@ehu.es
  • Universidad/Centro: Facultad de Ciencia y Tecnología. Dpto. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal. Despacho F1.P0.7
  • Idiomas: Euskera, español, inglés y francés.

ACTIVIDADES DOCENTES

Andone Estonba, catedrática de Genética, imparte la asignatura de Genética en los grados de Biociencias y coordina la asignatura Marine Genomic Resources en el Erasmus Mundus MSc Marine Environment and Resources. Ha dirigido 10 Tesis Doctorales (2 internacionales, 2 euskera, 1 premio extraordinario), 18 TFMs y 27 TFGs. 

Lidera el equipo Genomic Resources, grupo A de Investigación del Sistema Universitario Vasco desde el año 2010. Ha dirigido 28 proyectos competitivos (5 europeos, 1 transfronterizo, 5 estatales y 17 autonómicos), 18 contratos de investigación y también contratos de análisis repetitivos. Es asesora científica de la Unidad de Secuenciación y Genotipado (SGIker).

Su interés está en el estudio de la diversidad genética. Su historial investigador comenzó aplicando la Genética de Poblaciones a programas de conservación y mejora genética en un contexto de gestión sostenible. Más tarde estuvo implicada en la identificación de genes de susceptibilidad a enfermedades. Más recientemente, su interés se ha ampliado a las comunidades microbianas y su interacción con el huésped.

INDICADORES DE CALIDAD

Docencia: Seis Tramos de Actividad Docente con evaluación positiva y Calificación de excelente en DOCENTIAZ

Investigación: Índice h: 20. Citas totales: 944 (últimos 5 años: 102/año). Publicaciones totales indexadas: 70 (últimos 10 años: 51). Publicaciones totales (Q1): 48 (últimos 10 años: 42). Número de sexenios de investigación: 4. Patentes: 2

ACTIVIDADES DE INVESTIGACIÓN

Desde el año 2010 soy líder del Grupo Consolidado de Investigación del Departamento de Educación, Universidades e Investigación del Gobierno Vasco IT558 -10. En un comienzo, mi interés se centró en la genética de poblaciones enmarcada en la conservación y mejora genética de poblaciones locales de animales domésticos (ganado ovino, equino y bovino) para, posteriormente, ampliarlo a especies salvajes (termitas, peces, liebres) y semisalvajes (abejas). Los resultados de estos estudios han sido aplicados en programas de mejora genética y conservación de la biodiversidad incluyendo la identificación de animales, la delimitación de poblaciones y la trazabilidad de alimentos. Recientemente, nos hemos especializado en la aplicación de las nuevas tecnologías de secuenciación (Next Generation Sequencing; NGS) en organismos no modelo, principalmente peces. Así los proyectos actuales abarcan (1) estudios de genómica de poblaciones en atún rojo, anchoa y verdel, que abarcan desde el descubrimiento de SNPs en el transcriptoma, hasta el genotipado mediante secuenciación (RAD-seq/GBS) en atún rojo; (2) estudios de expresión diferencial (RNA-seq) y anotación funcional para el estudio de los factores genéticos implicados en el crecimiento de la almeja; y (3) se han iniciado estudios de metagenómica con el objetivo de descifrar la adaptación de las comunidades bacterianas a diferentes ecosistemas con impacto antrópico, como son los estuarios del Nervión y Urdaibai, y los viñedos para la producción de Txakolí. Los trabajos descritos han sido y son realizados en colaboración con centros tecnológicos del entorno, asociaciones de criadores, y diversos grupos universitarios y empresas europeas. Los resultados más destacados obtenidos en los últimos cinco años (2009-2014), se recogen en los 20 artículos publicados en revistas indexadas y  dos patentes registradas.

www.genomic-resources.eus

Líneas de investigación

Genómica de especies no-modelo. Generación de recursos genómicos en especies relevantes con genoma desconocido, con el objetivo de facilitar estudios genéticos ulteriores.

Aplicamos la tecnología de secuenciación masiva (NGS) en diversos proyectos, como son:

  1. Estudios genómicos de poblaciones en especies de relevancia ganadera y pesquera, para su gestión sostenible y el desarrollo de recursos de trazabilidad alimentaria.
  2. Barrido de genomas completos para la identificación de señales genómicas de selección en ganado ovino
  3. Estudios de expresión diferencial (RNASeq) en especies de interés para la acuicultura, como el crecimiento en almejas.
  4. Estudios en metagenómica para descifrar la diversidad específica y funcional de las comunidades bacterianas en ecosistemas con impacto antrópico (estuarios y viñedos).

Proyectos activos

  • P4 Título Proyecto: Sustainable Management of Resilient Bee Populations (SMARTBEES)
    Entidad Financiadora:  European Commission-Research Executive Agency. Collaborative Project ‐large‐scale integrating project targeted to SMEs (FP7-KBBE-2013) 
    Participantes: UPV/EHU, LIB-B, ANSES, ARU, AUA, CT, FERA, GenSK, ICDA, IO, LLH,NBA,SLU, UABD, UNINA, UNIUD 
    Duración: Fase de negociación 
    Coordinador proyecto: KasparBienefeld (LIB-B) 
    IP en la UPV/EHU: Andone Estonba (UPV/EHU)
  • P3 Título Proyecto: Determinación de la estructura poblacional y estudio del efecto de la selección en el ovino autóctono de la región pirenaica occidental (US13/29)
    Entidad Financiadora: Universidad del País Vasco (UPV/EHU) and Conservatoire des Racesd'Aquitaine (Francia)
    Participantes: UPV/EHU, Conservatoire des Racesd'Aquitaineand e Instituto Navarro de Tecnologías e Infraestructuras Agroalimentarias Duración: Jul. 2013-Jul. 2015
    IP: Andone Estonba (UPV/EHU))
  • P2 Título Proyecto: Genes and Proteins for Autoimmunity Diagnostics (GAPAID).
    Entidad Financiadora: EuropeanCommission-Research Executive Agency (FP7-SME-2012-1).
    Participantes:  UPV/EHU, Progenika, Toscana Biomarkers, Diagnosticum, Universitá di Pisa, Universitá di Firenze, Omnilab Iberia, EötvösLoránd Tudományegyetem, Pécsi Tudományegyetem
    Duración: Sep. 2012-Ago. 2014
    Coordinador proyecto: Claudia Alcaro (Toscana Biomarkers)
    IP en la UPV/EHU: Andone Estonba (UPV/EHU)
  • P1 Título Proyecto: Grupo de Investigación del Sistema Universitario Vasco. "Análisis genómicos de la variación del ADN" (GIC10/58)
    Entidad Financiadora: Basque Government (GV/EJ)
    Participantes: UPV/EHU
    Duración: Ene. 2010-Dic. 2015 )
    IP: Andone Estonba (UPV/EHU)

Contratos I+D activos

  • K1 Título Contrato: Biological and genetic sampling and analysis of the ICCAT Atlantic-Wide Research Program on Bluefin Tuna (GBYP 02/2013)
    Tipo Contrato: Investigación
    Entidad Financiadora: ICCAT 
    Duración: Ene. 2013-Ene. 2014. 
    IP: Andone Estonba (UPV/EHU)