Fue diputado de Euskadiko Ezkerra por Gipuzkoa entre 1977 y 1979, y de Herri Batasuna entre 1979 y 1982, por Bizkaia tras lo cual inició su carrera académica en Euskal Herriko Unibertsitatean (EHU), donde ejerció como profesor titular hasta el año 2017.

Amaba profundamente la enseñanza y como profesor universitario recibió el aprecio de las y los estudiantes por su compromiso, cercanía y capacidad para fomentar el pensamiento crítico. En su faceta de investigador fue un pensador guiado por la curiosidad, constantemente con afán por aprender y de entender los vínculos entre diferentes temas.      

Sus dos primeros libros fueron editados con la editorial Ruedo Ibérico en la década de los 70: “El proceso de Euskadi en Burgos” (1971) “Historia de Euskadi: el nacionalismo vasco y ETA” (1975). Autor prolífico su obra académica más reseñable es “Juego de espejos conflictos nacionales centro-periferia” (Madrid: Trotta, 1997), un amplio y exhaustivo sobre el Estado-Nación y los nacionalismos que como indica la reseña de Joseba Arregi “un tema necesitado de análisis y no considerado como dato autoexplicado (…). Un objeto de la ciencia política que tiene que ver con la estructuración de relaciones de poder, y que, por ello, sólo puede ser comprendido desde la perspectiva de los conflictos que acompañan a toda estructuración, es decir, a todo reparto de poder” (Rev. int. estud. vascos. 43, 2, 1998, 517-567).

Precisamente las líneas de investigación principal del profesor Letamendia se centraron en la transición y la historia política del País Vasco, el derecho a la autodeterminación, el plurinacionalismo, los movimientos nacionalistas, la violencia política, así como la presencia de los pueblos en la Unión Europea.