Los Sellos de Calidad de Unibasq son reconocimientos voluntarios otorgados por la Agencia a solicitud de las Universidades del Sistema Universitario Vasco (SUV). Los reconocimientos o Sellos de Calidad otorgados por Unibasq tienen como propósito el apoyo a las universidades del SUV en el camino de la mejora de una serie de aspectos específicos relevantes de sus titulaciones. Estas distinciones tienen por tanto como objetivo principal promover y estimular el esfuerzo de las universidades del SUV en la mejora de sus titulaciones, con el objetivo secundario de mejorar la visibilidad de dicho esfuerzo de cara a la sociedad.