SERVICIO GENERAL DE GENÓMICA -UNIDAD DE EXPRESIÓN GÉNICA

La tecnología de los microarrays de DNA y de la PCR a tiempo Real o PCR cuantitativa es de gran utilidad para la investigación y desarrollo de productos en áreas relacionadas con la Biomedicina, las Biociencias, microbiología, veterinaria, agricultura, farmacología,  biotecnología o toxicología.

A continuación destacamos algunas de las aplicaciones de la tecnología de microarrays y de PCR a tiempo real.

Aplicaciones de la PCR a tiempo real o qPCR

• Cuantificación de la expresión génica
• Validación de los datos de microarrays
• Detección de patógenos (humanos, animales o plantas)
• Cuantificación de microRNAs
• Identificación de cepas bacterianas, levaduras u hongos
• Identificación de especies con elevado grado de homología
• Cuantificación de carga viral
• Detección y cuantificación de DNA metilado
• Discriminación alélica y genotipado
  • Diagnóstico: detección de mutaciones específicas
  • Análisis de número de copias de genes, regiones cromosómicas y detección de aneuploidias
  • Identificación de alteraciones cromosómicas (microdeleciones, translocaciones)
  • Análisis de haplotipos (SNPs)
  • Análisis de pérdida de heterocigosidad (LOH) con microsatélites
  • Diagnóstico prenatal a partir de sangre fetal contenida en sangre materna, y diagnóstico preimplantacional
  • Diagnóstico pre-sintomático
  • Monitorización de la enfermedad mínima residual (leucemias) después del transplante de médula ósea (límite de detección inferior a una célula tumoral por 105 células)
  • Monitorización de quimerismo tras el transplante de médula ósea
• Estudios forenses: estimación del número de copias de DNA nuclear y mitocondrial y valoración del grado de degradación del DNA; determinación del sexo
• Detección y cuantificación de organismos modificados genéticamente (GMOs)

Aplicaciones de la tecnología de Microarrays

• Determinación de perfiles de expresión génica en diferentes tejidos, estadios de desarrollo, tratamientos, estímulos químicos o medioambientales, enfermos vs. sanos, etc. en organismos tan diversos como bacterias, archeobacterias, hongos, plantas, animales o humanos.
• Determinación de la variación del número de copias de secuencias cromosómicas: array Comparative Genomic Hybridization (aCGH)
• Genotipado de SNPs y estudios de asociación.
• Análisis de promotores: Chip-chip, Chip-on-chip. Permite el análisis de las interacciones DNA-proteína (factores de transcripción, modificadores de proteínas, nucleosomas)
• Estudios epigenéticos: Análisis de patrones de metilación de DNA mediante  microarrays de Islas CpG.
• Estudios de perfiles de expresión de microRNAs.

Los experimentos de microarrays son de utilidad en numerosas y diversas áreas científicas. A continuación se describen algunas de ellas:

• Investigación Básica: Biología, Ecología y Fisiología: biología del desarrollo; caracterización funcional de los genes; estudios evolutivos; estudios de regulación génica.
• Salud Humana: caracterización de los mecanismos moleculares de las enfermedades; identificación de genes y variantes de susceptibilidad a enfermedades complejas; clasificación molecular de las enfermedades; diagnóstico molecular; identificación de marcadores con valor pronóstico y predictivo; identificación de nuevas dianas terapéuticas; seguimiento de la respuesta a fármacos en el desarrollo de nuevas terapias y fármacos.
• Biotecnología medioambiental y agrícola
• Biotecnología industrial: desarrollo de nuevas cepas
• Detección de patógenos, organismos modificados genéticamente
• Diagnóstico en veterinaria
• Monitorización medioambiental
• Toxicogenómica: identificar perfiles de expresión asociados con determinados compuestos y tóxicos.