SERVICIO GENERAL DE GENÓMICA -UNIDAD DE EXPRESIÓN GÉNICA

Equipamiento

En el Laboratorio de Genómica que la Unidad de Expresión Génica comparte con la Unidad de Secuenciación y Genotipado del Servicio de Genómica y Proteómica, disponemos de equipamiento de alto rendimiento y tecnología genómica de última generación para el análisis de la expresión génica global y otros análisis a escala genómica, como el estudio de aberraciones cromosómicas, regulación transcripcional, metilación de DNA, micro RNAs. A continuación se muestra un listado de los equipos más relevantes:

  1. Homogenizador para el procesado de la muestra (extracción de ARN a partir de tejidos, sangre ycultivos celulares) Precellys-24 de Bertin.
  2. Bioanalizador 2100 Bioanalyzer, espectrofotómetro y fluorímetro de placas para el control de calidad y cuantificación de las muestras (ADN y ARN).
  3. PCR a tiempo real 7900HT Fast Real Time System (Applied Biosystems) con bloques 96-fast, 384 y TLDAs
  4. Plataforma de PCR a tiempo Real de nanofluídica de  alto rendimiento BioMark HD System de Fluidigm Corporation
  5. Plataforma de microarrays de DNA de Agilent Technologies: horno de hibridación y G2565CA Microarray Scanner.
  6. Sistema automático de electroforesis preparativa en gel pippin prep (SAGE SCIENCE)

EQUIPOS CONFINANCIADOS POR LA UNIÓN EUROPEA A TRAVÉS DEL FONDO EUROPEO DE DESARROLLO REGIONAL

HOMOGENIZADOR DE TEJIDOS


Precellys 24

CUANTIFICACIÓN DE ALTA PRECISIÓN


Nanodrop ND-8000


FLX800T (Fluorimetro lector de placas)

ANÁLISIS DE CALIDAD DE RNA TOTAL, RNA MENSAJERO Y MICRO-RNAS Y MIGRACIÓN DE AMPLIFICADOS Y DIGESTIONES DE ADN

          
Agilent 2100 Bioanalyzer

PCR A TIEMPO REAL 7900HT FAST

PCR A TIEMPO REAL DE NANOFLUIDICA BIOMARK HD SYSTEM (FLUIDIGM)

HORNO DE HIBRIDACIÓN DE AGILENT TECHNOLOGIES

          

ESCANER DE MICROARRAYS G2565CA de AGILENT TECHNOLOGIES

 

SISTEMA AUTOMÁTICO DE ELECTROFORESIS PREPARATIVA EN GEL PIPPIN PREP (SAGE SCIENCE)

Sistema automático para la selección de fragmentos de ADN de interés a partir de geles de agarosa, en los rangos de 100 pb a 1500 pb. Su principal aplicación es la preparación de librerías de NGS, especialmente librerías de microRNAs y RNAs de pequeño tamaño (small RNAs).