Hil honetako ekipamendua: Proteomikarako Q HF-X masa-espektrometroa

Euskal Herriko Unibertsitateko Proteomics Core Facility unitateak Q Exactive HF-X masa-espektrometro berria instalatu du, UPLC EASY nLC-1200 sistema nano batera akoplatua.

Ekipamendua azken belaunaldiko lau poloko Orbitrap masa-espektrometro hibridoa da, eta konbinatzen ditu ahalmen handiko transferentzia tutu bat, errendimendu handiko lau poloko analizatzaile bat eta Orbitrap masa-analizatzaile bat (bereizmen handiko masarako eremu ultra altukoa) (HRAM), errendimendu bikaina emateko bai analisi fokalizatuan bai ez-fokalizatuan. Hainbat analisi mota onartzen ditu: DDA (mendeko datu-eskuratzea), SIM (ioi hautatuen kontrola), PRM (erreakzio paraleloaren kontrola) eta DIA (datu-eskuratze independentea). Tresna honen deskribapen zehatza 1 eta 2 argitalpenetan dago.

Tresna erabil daiteke behetik gorako proteomikako aplikazio gehienetan. Q Exactive HF-X espektrometroak arazorik gabe egin dezake goranzko analisi-mota bat lagin oso konplexuekin eta/edo kopuru txikiarekin.

• Proteinen behetik gorako identifikazioa eta kuantifikazioa da oraindik ere proteomikako ikerketa askoren oinarria.
• Proteina ezagunetara bideratutako kuantifikazioa.
• Itzulpen ondorengo aldaketen analisia, aldaketa-puntu espezifikoa eta horren kuantifikazio erlatiboa zehazteko.

Tresna dagoeneko erabili da proteinen identifikazio eta kuantifikazio erlatiborako hainbat eratako laginetan, besteak beste, giza exosometan eta landareen zuztarretan. Egiaztatu da oso baliagarria dela ubikitinarekin aldatutako proteinen analisirako ere Drosophila melanogaster-en nahiz giza zeluletan. Aplikazio proteomikoetarako Q Exactive HF tresnen erabilera deskribatzen duten argitalpenak 3, 4, 5, 6 eta 7 dira.

• Maria Goyri Animalien Bioteknologia Zentroa
• 0.02 Laborategia
• Bizkaiko Campusa
• 48940, Leioa.

• Kerman Aloria
• kerman.aloria@ehu.eus
• 946013278