Genomic Resources

Datos generales

Ubicación
Centro de Biotecnología Maria Goyri
Facultad de Ciencia y Tecnología
Investigador/a principal
Andone Estonba
Número de doctores/as
5
Número de integrantes
8
Correo electrónico
andone.estonba@ehu.eus
Página web
(Abre una nueva ventana) https://www.genomic-resources.eus

Personal

  • Andone Estonba
  • Carmen Manzano Basabe
  • Mikel Iriondo Orensanz
  • Iratxe Zarraonaindia Martinez
  • Iratxe Montes

Líneas de investigación

Análisis de la Variación Genómica
  • Conservación y promoción de poblaciones locales. Granja, fauna silvestre, pesquerías, parques naturales...
    • Genética/genómica de poblaciones. Análisis de la diversidad genética dentro y entre poblaciones.
  • Trazabilidad agroalimentaria. Marcas de calidad, Denominación de origen, Salud Pública...
    • Genética/genómica forense. Desarrollo de herramientas DNA altamente discriminantes
  • Producción animal, Medicina personalizada...
    • GWAs, RNAseq. Identificación de genes de importancia económica: Crecimiento, rendimiento productivo, domesticación, susceptibilidad/resistencia a enfermedades.
  • Blue planet. Agricultura, Medio-ambiente
    • Metagenómica. Análisis de la diversidad microbiana taxonómica y funcional en muestras ambientales: suelo, ríos, costas, hospitales...

Oferta de transferencia e innovación

Desarrollo de herramientas genéticas para:

  • trazabilidad de alimentos
  • identificación individual
  • controles genealógicos

Estudios genéticos de especies animales para

  • delimitación de poblaciones: estructura genética de especies
  • evaluación de su salud genética: diversidad dentro y entre poblaciones
  • grado de parentesco genético entre poblaciones: relaciones filogenéticas

Generación de recursos genómicos en especies no-modelo

  • descubrimiento de SNPs en genes
  • ensamblaje de-novo de transcriptomas
  • expresión diferencial y anotación funcional

Caracterización de la diversidad genética microbiana presente en muestras ambientales

  • aplicaciones industriales
  • investigación terapéutica
  • sostenibilidad del medio ambiente

Equipamiento

  • Usuarios de la Unidad de secuenciación y genotipado del Servicio General de Genómica de la UPV/EHU (SGIker)

Proyectos destacados

  • Título del proyecto: Reducción de tratamientos químicos en apicultura: optimización de tratamientos ecológicos y fomento del microbioma de la abeja (37-2017-00044)
    • Entidad de realización: University of the Basque country (UPV/EHU)
    • Nombres investigadores principales (IP, Co-IP,...): Andone Estonba
    • Nº de investigadores/as: 5
    • Entidad/es financiadora/s: Dept. de Desarrollo Económico y Competitividad Gobierno Vasco/Eusko Jaurlaritza
    • Nombre del programa: Ayudas I+D+I de los sectores agrario, alimentario y pesquero de la CAPV
    • Duración: 2 años 2017-2018
    • Cuantía total: 18.347,77€
  • Título del proyecto: Consortium eurorégional pour la réduction de l’impact des champignons pathogènes dans le secteur vitivinicole/Consorcio Euroregional para la reducción del impacto de los hongos patógenos en el sector vitivinícola
    • Entidad de realización: University of the Basque Country (UPV/EHU), Bodegas y Viñedos Artazu, Bodega Galdames, ISVV, UR oenologie, Sciences Agro, Vitinnov, Cave d'Irouleguy
    • Nombres investigadores principales (IP, Co-IP,...): Iratxe Zarraonaindia Martinez (UPV/EHU)
    • Nº de investigadores/as: 8
    • Entidad/es financiadora/s: AECT Euroregión Aquitania-Euskadi-Navarra
    • Nombre del programa: Convocatoria de proyectos Nueva-Aquitania Euskadi Navarra 2017
    • Duración: 18 meses
    • Cuantía total: 70.000,00€
  • Título del proyecto: Sustainable Management of Resilient Bee Populations. SMARTBEES 
    • Entidad financiadora: European Comission-Research Executive Agency. Collaborative Project ‐large‐scale integrating project targeted to SMEs. 7PM-COOP-LCP13/08
    • Entidades participantes: UPV/EHU, LIB-B, ANSES, ARU, AUA, CT, FERA, GenSK, ICDA, IO, LLH,NBA,SLU, UABD, UNINA, UNIUD
    • Fecha inicio: 1 Nov 2014 Fecha Fin: 30 Oct 2018
    • Investigador responsable: Andone ESTONBA (UPV/EHU), Coordinador: Prof. Dr. Kaspar Bienefeld. 
    • Tipo de participación en el proyecto: Dirección UPV/EHU
    • Número de investigadores participantes (y nº de investigadores de la UPV/EHU): 
    • Importe total del subproyecto: 358.000 € (UPV/EHU)
  • Título del proyecto: "Metagenómica del Txakoli: hacia una vitivinicultura personalizada”, Código OTRI: GVCV16/18 (Gobierno Vasco Convocatorias Varias)
    • Entidad de realización: University of the Basque country (UPV/EHU)
    • Nombres investigadores principales (IP, Co-IP,...): Iratxe Zarraonaindia Martinez
    • Nº de investigadores/as: 6
    • Entidad/es financiadora/s: Dept. de Desarrollo Económico y Competitividad Gobierno Vasco/Eusko Jaurlaritza
    • Nombre del programa: Ayudas I+D+I de los sectores agrario, alimentario y pesquero de la CAPV
    • Duración: 1 año 
    • Cuantía total: 19.253,93 €
  • Título del proyecto: Genes and Proteins for Autoimmunity Diagnostics. GAPAID.
    • Entidad financiadora: European Comission-Research Executive Agency. Acciones SME. 7PM-CAPACITIES-SMES12/01
    • Entidades participantes: UPV/EHU, Progenika, Toscana Biomarkers, Diagnosticum, Universitá di Pisa, Universitá di Firenze, Omnilab Iberia, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Pécsi Tudományegyetem
    • Fecha inicio: 1 Septiembre 2012 Fecha Fin: 31 Agosto 2014
    • Investigador responsable: Andone ESTONBA (UPV/EHU), Coordinadora: Claudia Alcaro (Toscana Biomarkers)
    • Tipo de participación en el proyecto: Dirección de subproyecto
    • Número de investigadores participantes (y nº de investigadores de la UPV/EHU): 3 (UPV/EHU)
    • Importe total del proyecto: 1.210.250,80 € (248.256,00 UPV)