MICROBIOMICS

Datos generales

Ubicación
Facultad de Ciencia y Tecnología
Investigador/a principal
Aitor Rementeria Ruiz
Número de doctores/as
10
Número de integrantes
14
Correo electrónico
aitor.rementeria@ehu.eus
Página web
(Abre una nueva ventana) https://www.ehu.eus/fungalpathogen

Personal

  • Aitor Rementeria Ruiz
  • Fernando L.Hernando Echevarria
  • Juan L. Serra Ferrer
  • Maria Jesus Llama Fontal
  • Andoni Ramirez Garcia
  • Ana Abad Diaz de Cerio
  • Javier Garaizar Candina
  • Joseba Bikandi Bikandi
  • Ilargi Martinez Ballesteros
  • Lorena Laorden Muñoz

Líneas de investigación

  1. Diagnóstico de enfermedades fúngicas invasoras mediante el uso de sistemas basados en PCR y qPCR
  2. Estudio transcriptómico del hongo saprófito Aspergillus fumigatus en condiciones infectivas y de estrés ambiental
  3. Estudio de la inmunogenicidad y multirresistencia del hongo patógeno emergente Lomentospora prolificans mediante tecnologías ómicas
  4. Epidemiología molecular, genómica bacteriana y metagenómica de muestras de alimentos y ambientales naturales-humanizados.

Oferta de transferencia e innovación

Desarrollo, asesoramiento y evaluación de sistemas de detección y diagnóstico rápido y de vigilancia epidemiológica de patógenos bacterianos y fúngicos aplicados en diferentes tipos de muestras: clínicas, alimentarias, ambientales, etc., y  su transferencia tecnológica a empresas.

Análisis mediante sistemas genómicos, transcriptómicos, proteómicos, inmunómicos y metagenómicos de las actividades de los microrganismos patógenos y ambientales y de su ecología.

Selección y caracterización de microorganismos bacterianos y fúngicos de interés industrial en la producción de vinos, alimentos fermentados,…

Equipamiento

  • Sistemas de termocicladores con detección de multiples dianas para la realización de qPCR múltiples
  • Sistemas de separación proteica mediante doble dimensión y realización de Western-blot
  • Secuenciadores masivos

Proyectos destacados

Unidad de formación e investigación multidisciplinar sobre enfermedades microbianas para la promoción de una vida y un envejecimiento saludables (UFIMEMPVES). Entidad financiadora: UPV/EHU (UFI11/25). Fecha inicio: Enero 2012; Fecha Fin: Diciembre 2016

MIMOGEN-Microbiología Molecular y Genómica: Desarrollo de metodologías para el estudio genómico, proteómico, epidemiológico y de diagnóstico de bacterias y hongos basadas en técnicas moleculares y herramientas bioinformáticas. Entidad financiadora: Subvención General a Grupo de Investigación UPV/EHU (GIU12/44). Fecha inicio: 22 de Noviembre 2012; Fecha Fin: 21 de Noviembre 2015

Caracterización funcional del efecto prometastático y proinflamatorio de proteínas codificadas por el gen KRE de Candida albicans: implicaciones terapéuticas (KRE). Entidad financiadora: Gobierno Vasco SAIOTEK 2013 (Gob Vasco: PE13UN083; UPV/EHU: SAI13/116) . Fecha inicio: 2013, Fecha Fin: 2014 

New approaches in identifying and characterizing microbiological and chemical hazards (Subproyecto en la UPV/EHU). European Food Safety Authority (EFSA) (GP/EFSA/AFSCO/2015/01. Fecha inicio: Enero 2016; Fecha Fin: Junio 2018. Cofinanciado en 2016 mediante: INNUENDO: Una plataforma intersectorial para la integración de la Genómica en la Vigilancia epidemiológica de patógenos transmitidos por los AlimentosEntidad financiadora: Gobierno Vasco. Proyectos de investigación focalizada Agricultura (PA16/01) Fecha inicio: 01/01/2016, Fecha Fin: 31/12/2016

MICROBIOMICS- Biómica de hongos y bacterias. Entidad financiadora: Universidad del País Vasco (UPV/EHU).  mediante dos Ayudas a Grupos de Investigación (GIU 15/36 y PPG17/41). Fecha inicio: 01/01/2016, Fecha Fin: 31/12/2018