Equipo del mes: NovaSeq6000

El NovaSeq6000 de Illumina (basado en la tecnología de secuenciación por síntesis-SBS, responsable de hasta el 90% de las secuencias actualmente depositadas en las bases de datos científicas) es la plataforma de secuenciación de alto rendimiento más potente, simple, escalable, y rápida hasta la fecha. Es a su vez la plataforma que mayor longitud de lectura permite de entre todas las plataformas de máximo rendimiento disponibles actualmente en el mercado.

El equipo ubicado en el Servicio de Genómica de los SGIker (UPV/EHU), completa la plataforma de secuenciación Masiva disponible hasta la fecha (MiSeq y NextSeq550, ambos de Illumina), cubriendo todo el rango de escalas actualmente existentes para la realización de análisis NGS.

Su elevado rendimiento productivo junto a su costo eficiencia por dato generado, permitirá a la comunidad investigadora llevar a cabo proyectos y alcanzar objetivos hasta ahora difícilmente abordables, y aplicar esta herramienta de gran potencial al ámbito biosanitario (diagnóstico, tratamiento). Concretamente, las aplicaciones que necesitan un gran volumen de datos, como la secuenciación del genoma humano completo (WGS), la secuenciación ultraprofunda de exomas y el establecimiento de perfiles tumorales y normales, secuenciación de-novo de genomas grandes,… no podían ser abarcadas por los equipamientos hasta ahora disponibles en la UPV/EHU, mientras que con la incorporación del NovaSeq6000 sí podrán llevarse a cabo, puesto que el equipo resulta adecuado, no sólo tecnológicamente sino de forma costo-eficiente, para la obtención de ese tipo de resultados. Así, el NovaSeq6000 ya ha sido asociado por muchos con el inicio de una nueva era de la NGS.

El NovaSeq6000, permitirá la consecución de proyectos NGS de gran envergadura a la comunidad investigadora de la Red Vasca de Ciencia, Tecnología e Innovación. Permitirá la apertura de nuevas líneas de investigación, apoyará las existentes y posibilitará abordar proyectos y objetivos hasta ahora económica y tecnológicamente inalcanzables. Con ello, se prevé un impacto positivo y crecimiento de proyectos de investigación, creación de nuevas líneas y grupos, iniciativas y expectativas.

Otra gran beneficiaria será la red sanitaria del entorno. La incorporación de esta infraestructura en la UPV/EHU les permitirá acceder, de manera cercana y rápida, a una tecnología de gran potencialidad, con aplicaciones especialmente prometedoras en el área de la salud humana y salud pública.

Para más información, contactar con el Servicio de Genómica de la UPV/EHU:

• Unidad de Secuenciación y Genotipado: irati.miguel@ehu.eus; fernando.rendo@ehu.eus
• Unidad de Expresión génica: irantzu.bernales@ehu.eus