Equipo del mes: Q espectrómetro de masas HF-X con fines proteómicos

El Proteomics Core Facility de la Universidad del País Vasco ha instalado un nuevo espectrómetro de masas Q Exactive HF-X acoplado a un sistema nanoUPLC EASY nLC-1200.

Este equipo es un espectrómetro de masas híbrido cuadrupolar-Orbitrap de última generación que combina un tubo de transferencia de alta capacidad, un analizador cuadrupolo de alto rendimiento y un analizador de masa Orbitrap de campo ultra alto para masa de alta resolución (HRAM) para proporcionar un excelente rendimiento tanto en análisis focalizado como  no focalizado. Admite múltiples modos de adquisición, como por ejemplo el  DDA (Adquisición dependiente de datos), SIM (Control de iones seleccionados), PRM (Monitoreo de reacción en paralelo) y DIA (Adquisición de datos independientes). Una descripción detallada de este instrumento se puede encontrar en las publicaciones 1 y 2.

Este instrumento se puede usar en la mayoría de las aplicaciones de proteómica de abajo hacia arriba. El Q Exactivo HF-X puede realizar con éxito un tipo de análisis ascendente con poca cantidad y/o muestras muy complejas.

• La identificación y cuantificación de proteínas de abajo hacia arriba continúa siendo  base en gran parte de la investigación en proteómica.
• Cuantificación dirigida de proteinas conocidas.
• Análisis de Modificación Post Translacional para determinar el sitio de modificación específico y su cuantificación relativa.

El instrumento ya se ha utilizado para identificar y cuantificar en manera relativa las proteínas en muestras tan diversas como los exosomas humanos y las raíces de las plantas. También ha demostrado ser muy útil para el análisis de proteínas modificadas con ubiquitina en la Drosophila melanogaster asi como en células humanas. Las publicaciones que describen el uso de los instrumentos de Q Exaction HF para diferentes aplicaciones proteómicas son 3, 4, 5, 6 y 7.

• Centro de Biotecnología Animal "Maria Goyri"
• Laboratorio 0.02
• Campus de Bizkaia.
• 48940, Leioa.

• Kerman Aloria
• kerman.aloria@ehu.eus
• 946013278