En el codiseño físico-lógico se deben establecer qué funciones conviene ejecutar en el procesador programable y cuáles mediante periféricos diseñados ex profeso con ese objeto. Tal decisión no es en absoluto trivial y, a tal fin, deben evaluarse y compararse varias soluciones. Para ello hay que recurrir a aplicaciones informáticas de diseño electrónico. No obstante, a pesar de la ayuda de computadores, el mercado de la Electrónica, especialmente de consumo, no tolera plazos de fabricación largos, por lo que no queda más remedio que estimar las características de las distintas arquitecturas. Es en este punto donde las herramientas de diseño empiezan a ser insuficientes. Por tanto, se plantea encontrar algoritmos que permitan realizar estimaciones de los recursos electrónicos consumidos y de la máxima velocidad alcanzable al diseñar sistemas electrónicos complejos en FPGAs.