Gaia

XSLaren edukia

Omics: esperimentuen diseinuak eta datuen analisiak

Gaiari buruzko datu orokorrak

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Irakasleak

IzenaErakundeaKategoriaDoktoreaIrakaskuntza-profilaArloaHelbide elektronikoa
ALONSO ALEGRE, SANTOSEuskal Herriko UnibertsitateaDoktore IkertzaileakDoktoreaElebakarraAntropologia Fisikoasantos.alonso@ehu.eus
ARIZMENDI BASTARRIKA, JESUS MARIAEuskal Herriko UnibertsitateaIrakaslego AgregatuaDoktoreaElebidunaBiokimika eta Biologia Molekularrajm.arizmendi@ehu.eus
BILBAO CATALA, JOSE RAMONEuskal Herriko UnibertsitateaIrakaslego OsoaDoktoreaElebidunaGenetikajoseramon.bilbao@ehu.eus
FULLAONDO ELORDUI-ZAPATERIECHE, ASIEREuskal Herriko UnibertsitateaIrakaslego AgregatuaDoktoreaElebidunaGenetikaasier.fullaondo@ehu.eus
JUGO ORRANTIA, BEGOÑA MARINAEuskal Herriko UnibertsitateaUnibertsitateko Irakaslego TitularraDoktoreaElebidunaGenetikabegonamarina.jugo@ehu.eus
LOPEZ LOPEZ, ELIXABETEuskal Herriko UnibertsitateaIrakaslego Atxikia (Laguntzaile Doktorea)DoktoreaElebidunaBiokimika eta Biologia Molekularraelixabet.lopez@ehu.eus
ZUBIAGA ELORDIETA, ANA MARIAEuskal Herriko UnibertsitateaUnibertsitateko KatedradunaDoktoreaElebidunaGenetikaana.zubiaga@ehu.eus
ARANSAY BAÑARES, ANA MARIACentro de Investigacion Cooperativa en Biociencias (CIC-bioGUNE)BesteakDoktoreaamaransay@cicbiogune.es
BERNALES PUJANA, IRANTZUSGIKER Servicio Central de Análisis, UPV/EHUBesteakDoktoreairantzu.bernales@ehu.eus
LAVIN TRUEBA, JOSE LUISNeiker-TecnaliaBesteakDoktorea

Irakaskuntza motak

MotaIkasgelako orduakIkasgelaz kanpoko orduakOrduak guztira
Magistrala253863
Ordenagailuko p.253762

Irakaskuntza motak

IzenaOrduakIkasgelako orduen ehunekoa
Azalpenezko eskolak50.050 %
Lanak ekipo informatikoekin50.050 %
Txostenak eta azalpenak lantzea25.00 %

Ebaluazio-sistemak

IzenaGutxieneko ponderazioaGehieneko ponderazioa
Bertaratzea eta Parte-hartzea0.0 % 50.0 %
Trabajos prácticos /Valoración por parte del Tribunal del trabajo escrito0.0 % 50.0 %

Irakasgai-zerrenda

Tema 1

INTRODUCCIÓN A LA GENÓMICA. SECUENCIACIÓN DE GENOMAS. EL GENOMA HUMANO



Tema 2

ANOTACIÓN DE GENOMAS. GENÓMICA COMPARATIVA. GENOMAS DE ESPECIES MODELO EN BIOMEDICINA.

ONTOLOGÍA DE GENES.



Tema 3

ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE SECUENCIAS. BASES DE DATOS. COMPARACIÓN POR SIMILITUD.

ALINEAMIENTOS DE SECUENCIAS Y GENOMAS.



Tema 4

ANÁLISIS DE LA VARIACIÓN GENÓMICA.

SNPS: DETECCIÓN Y TECNOLOGÍAS DE GENOTIPACIÓN. VARIACIÓN GENÓMICA EN LA ESPECIE HUMANA Y SU IMPLICACIÓN EN LA SALUD.



Tema 5

DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO Y MAPAS HAPLOTÍPICOS. APLICACIONES DE LA TECNOLOGÍA DE SNPS:

MAPEO DE QTLS Y ESTUDIOS DE ASOCIACIÓN CON ENFERMEDADES.



Tema 6

ANÁLISIS DE LA EXPRESIÓN GENÓMICA. MICROMATRICES DE DNA. DISEÑO EXPERIMENTAL Y METODOLOGÍA. NUEVAS HERRAMIENTAS: CGH, CHIP ON CHIP.



Tema 7

MINERÍA DE DATOS

ANÁLISIS ESTADÍSTICO DE DATOS DE MICROMATRICES



Tema 8

INTRODUCCIÓN A LA PROTEÓMICA. MÉTODOS DE SEPARACIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS.



Tema 9

ESPECTROMETRÍA DE MASAS. ESTRATEGÍAS DE IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS.





Tema 10

BIOINFORMÁTICA EN LA PROTEÓMICA.

Bibliografia

Oinarrizko bibliografia

1.- A. MALCON CAMPBELL & LAURIE J. HEDER (2003): DISCOVERING GENOMICS, PROTEOMICS AND BIOINFORMATICS.. PEARSON EDUCATION, INC. BENJAMIN CUMMINGS, SAN FRANCISCO.

2.- G. GIBSON AND S.V. MUSE. A PRIMER OF GENOME SCIENCE. (2004). SINAUER ASSOCIATES, INC.

3.- AZUAJE, F., DOPAZO, J (EDS.). DATA ANALYSIS AND VISUALIZATION IN GENOMICS AND PROTEOMICS. (2005) WILEY

4.- MOUNT DW. (2001): BIOINFORMATICS. SEQUENCE AND GENOME ANALYSIS. APPLICATIONS IN BIOLOGICAL SCIENCE AND MEDICINE. CDR PRESS, BOCA RATON.

5.- BAXEVANIS, A.D., OUELLETTE, B.F.F. 2001. BIOINFORMATICS. A PRACTICAL GUIDE TO THE ANALYSIS OF GENES AND PROTEINS. 2ND ED. WILEY-INTERSCIENCE.

6.- DC. LIEBLER. (2002): INTRODUCTION TO PROTEOMICS. TOOLS FOR THE NEW BIOLOGY.. HUMAN PRESS, TOTOWA, NEW YORK,

7.- JAMES P. (2001): PROTEOME RESEARCH: MASS SPECTROMETRY. SPRINGER, BERLIN.

8.- E. DE HOFFMANN & V. STROOBANT (2002): MASS SPECTROMETRY: PRINCIPLES AND APPLICATIONS. WILEY, CHICHESTER



ARTÍCULOS

ALAN E., MD GUTTMACHER, ET AL. (2004): GENOMIC MEDICINE. ARTICLES FROM THE NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE. MASSACHUSETTS MEDICAL SOCIETY USA

HACKL H., ET AL (2004): ANALYSIS OF DNA MICROARRAY DATA. CURR. TOP. MED. CHEM. 4(13):1357-70

KERR MK. (2003): DESIGNS CONSIDERATIONS FOR EFFICIENT AND EFFECTIVE MICROARRAY STUDIES. BIOMETRICS DEC, 59(4):822-8

NADON R, & SHOEMAKER J. (2002): STATISTICAL ISSUES WITH MICROARRAYS: PROCESSING AND ANALYSIS. TRENS GENET. MAY18(5): 265-71



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